本文采用高通量測(cè)序法,探究短密木霉（Trichoderma brevicompactum）、大豆和咪唑乙煙酸三者分別處理以及共同作用對(duì)土壤細(xì)菌多樣性和群落結(jié)構(gòu)的影響。試驗(yàn)以不含上述3種物質(zhì)的土壤為陰性對(duì)照。結(jié)果表明:5個(gè)不同處理樣品共含有36 336個(gè)細(xì)菌OTU（operational taxonomic unit）,其中共有的細(xì)菌種類有1 031個(gè),僅占樣品細(xì)菌總數(shù)的2.84%;不同處理土壤樣品的細(xì)菌多樣性均發(fā)生變化,短密木霉、大豆對(duì)土壤細(xì)菌多樣性的影響小于咪唑乙煙酸;不同處理樣品的細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)組成基本相同,差異較大的是相對(duì)豐度。變形菌門（Proteobacteria）是5個(gè)樣品中的優(yōu)勢(shì)細(xì)菌,平均豐度為50.82%;在屬的水平下,鞘氨醇單胞菌屬（Sphingomonas）是5個(gè)樣品中的優(yōu)勢(shì)細(xì)菌,其次是芽單胞菌屬（Gemmatimonas）和微小桿菌屬（Exiguobacterium）。結(jié)論:土壤中加入短密木霉后,土壤細(xì)菌多樣性及物種總數(shù)略微下降;種植大豆后,土壤細(xì)菌多樣性及物種總數(shù)升高;加入咪唑乙煙酸后,土壤細(xì)菌多樣性及物種總數(shù)顯著降低;短密木霉及大豆對(duì)土壤細(xì)菌多樣性及物種總數(shù)的影響... 

【文章來源】：森林工程. 2020,36(03)

【文章頁數(shù)】：5 頁

【部分圖文】：

不同樣本OTU分布韋恩圖

由圖2可知,從微生物分類的門水平上來看,5個(gè)樣品主要含有10個(gè)門的細(xì)菌,包括:變形菌門(Proteobacteria )、酸桿菌門(Acidobacteria)、放線菌門(Actinobacteria)、芽單胞菌門(Gemmatimonadetes)、厚壁菌門(Firmicutes)、浮霉菌門(Planctomycetes)、擬桿菌門(Bacteroidetes)、疣微菌門(Verrucomicrobia)、螺旋體菌門(Saccharibacteria)、檢菌總門(Parcubacteria)。在門水平下,不同處理樣品的細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)組成基本相同,差異較大的是相對(duì)豐度。這也說明土壤樣品經(jīng)過不同處理后,群落結(jié)構(gòu)不會(huì)發(fā)生根本改變。變形菌門(Proteobacteria)是5個(gè)樣品中的優(yōu)勢(shì)細(xì)菌,其中,A4樣品的豐度最大,為58.45%,A2樣品的豐度最小,為42.89%。其次是酸桿菌門(Acidobacteria)和放線菌門(Actinobacteria),平均豐度分別為10.74%、10.46%。其他門以及未鑒定的細(xì)菌平均豐度均在5%以下。根據(jù)物種分類結(jié)果,由于樣品中所檢測(cè)出的微生物種類繁多,許多物種含量相對(duì)較少,因此選擇細(xì)菌豐度前20的物種進(jìn)行分類統(tǒng)計(jì),如圖3所示。由圖3可知,從微生物分類的屬水平角度來看,5個(gè)樣品豐度前20個(gè)屬的細(xì)菌有:鞘氨醇單胞菌屬(Sphingomonas)、芽單胞菌屬(Gemmatimonas)、微小桿菌屬(Exiguobacterium)、Gaiella、Rhizomicrobium、紅游動(dòng)菌屬(Rhodoplanes)、Saccharibacteria_genera_incertae_sedis、Phenylobacterium、檸檬酸桿菌屬(Citrobacter)、Rhodoferax、Rudaea、溶桿菌屬(Lysobacter)、假諾卡氏菌屬(Pseudonocardia)、產(chǎn)卟啉桿菌屬(Porphyrobacter)、Methylophilus、不動(dòng)桿菌屬(Acinetobacter)、類諾卡氏屬(Nocardioides)、孢魚菌屬(Sporichthya)、假單胞菌(Pseudomonas)及德沃斯氏菌屬(Devosia)。在屬水平下,不同處理樣品的細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)組成基本相同,差異較大的是相對(duì)豐度。鞘氨醇單胞菌屬(Sphingomonas)是5個(gè)樣品中的優(yōu)勢(shì)細(xì)菌,其中,A3樣品的豐度最大,為11.09%,其次是A4樣品,豐度為9.31%,CK樣品的豐度最小,為6.1%。鞘氨醇單胞菌屬(Sphingomonas)細(xì)菌可用于芳香化合物的生物降解,加入咪唑乙煙酸后,可能促進(jìn)了鞘氨醇單胞菌屬細(xì)菌的增殖。其次是芽單胞菌屬(Gemmatimonas),平均豐度為6.86%,而后是微小桿菌屬(Exiguobacterium),平均豐度為5.96%,而其他前20屬細(xì)菌平均豐度均在5%以下,其余已鑒定屬合計(jì)平均豐度38.7%,占很大比例。

根據(jù)物種分類結(jié)果,由于樣品中所檢測(cè)出的微生物種類繁多,許多物種含量相對(duì)較少,因此選擇細(xì)菌豐度前20的物種進(jìn)行分類統(tǒng)計(jì),如圖3所示。由圖3可知,從微生物分類的屬水平角度來看,5個(gè)樣品豐度前20個(gè)屬的細(xì)菌有:鞘氨醇單胞菌屬(Sphingomonas)、芽單胞菌屬(Gemmatimonas)、微小桿菌屬(Exiguobacterium)、Gaiella、Rhizomicrobium、紅游動(dòng)菌屬(Rhodoplanes)、Saccharibacteria_genera_incertae_sedis、Phenylobacterium、檸檬酸桿菌屬(Citrobacter)、Rhodoferax、Rudaea、溶桿菌屬(Lysobacter)、假諾卡氏菌屬(Pseudonocardia)、產(chǎn)卟啉桿菌屬(Porphyrobacter)、Methylophilus、不動(dòng)桿菌屬(Acinetobacter)、類諾卡氏屬(Nocardioides)、孢魚菌屬(Sporichthya)、假單胞菌(Pseudomonas)及德沃斯氏菌屬(Devosia)。在屬水平下,不同處理樣品的細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)組成基本相同,差異較大的是相對(duì)豐度。鞘氨醇單胞菌屬(Sphingomonas)是5個(gè)樣品中的優(yōu)勢(shì)細(xì)菌,其中,A3樣品的豐度最大,為11.09%,其次是A4樣品,豐度為9.31%,CK樣品的豐度最小,為6.1%。鞘氨醇單胞菌屬(Sphingomonas)細(xì)菌可用于芳香化合物的生物降解,加入咪唑乙煙酸后,可能促進(jìn)了鞘氨醇單胞菌屬細(xì)菌的增殖。其次是芽單胞菌屬(Gemmatimonas),平均豐度為6.86%,而后是微小桿菌屬(Exiguobacterium),平均豐度為5.96%,而其他前20屬細(xì)菌平均豐度均在5%以下,其余已鑒定屬合計(jì)平均豐度38.7%,占很大比例。3 討論與結(jié)論

【參考文獻(xiàn)】：
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本文編號(hào)：3577839