準(zhǔn)確的識(shí)別基因剪接位點(diǎn)對于理解以及控制基因性狀的表達(dá)具有十分重要的意義。本文基于擬南芥、水稻、玉米三類農(nóng)作物基因剪接位點(diǎn)數(shù)據(jù)集,結(jié)合卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)與遞歸神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)設(shè)計(jì)了一種深度學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)模型DeepAS（CNN+GRU+LSTM）。并根據(jù)DeepAS模型開發(fā)了農(nóng)作物基因剪接位點(diǎn)識(shí)別系統(tǒng),目的是能夠?qū)崿F(xiàn)快速準(zhǔn)確的識(shí)別農(nóng)作物基因剪接位點(diǎn),從而方便研究者的使用,加快科研工作的效率。主要研究內(nèi)容如下:1、基于擬南芥、水稻、玉米三種原始農(nóng)作物的基因數(shù)據(jù)提取基因剪接位點(diǎn)數(shù)據(jù)集,并分別制作基因剪接位點(diǎn)模型訓(xùn)練集。2、基于Tensorflow+Keras深度學(xué)習(xí)框架提出了一種農(nóng)作物基因剪接位點(diǎn)識(shí)別模型,設(shè)計(jì)了51種不同的模型結(jié)構(gòu)用于訓(xùn)練并測試三種農(nóng)作物基因剪接位點(diǎn)數(shù)據(jù)集以及他們的混合數(shù)據(jù)集,挑選出在每種數(shù)據(jù)集上識(shí)別準(zhǔn)確率最高的網(wǎng)絡(luò)模型,命名為DeepAS,并保存其模型與權(quán)重。實(shí)驗(yàn)表明DeepAS網(wǎng)絡(luò)模型在用于識(shí)別農(nóng)作物基因剪接位點(diǎn)時(shí)具有很好的準(zhǔn)確率與泛化能力,在農(nóng)作物混合基因數(shù)據(jù)集上識(shí)別準(zhǔn)確率為97.09%,精確率為96.88%,召回率為0.9692,F1_Score為96.90%,結(jié)果... 

【文章來源】：山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省

【文章頁數(shù)】：77 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

技術(shù)路線Fig.1Technologyroadmap

真核生物基因結(jié)構(gòu)

山東農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文被內(nèi)含子隔離開來，n個(gè)內(nèi)含子一般總是把基因的外顯子分隔成 n+1部分，通常內(nèi)含子的長度要比外顯子長很多，核苷酸數(shù)量可以比外顯子多許多倍。2.1.3 基因表達(dá)與剪接位點(diǎn)基因表達(dá)是基因指導(dǎo)下的蛋白質(zhì)合成過程，在這一過程中按照順序主要分為轉(zhuǎn)錄和翻譯兩步。簡單來講，轉(zhuǎn)錄是以 DNA 為模板按照堿基配對的原則合成 mRNA 的過程，翻譯則是以 mRNA 作為模板，按照密碼子表翻譯密碼子為氨基酸序列，最終形成具有生物活性的蛋白質(zhì)分子。


本文編號(hào)：3553451