為揭示Cd脅迫下馬鈴薯根際土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)差異及根際細(xì)菌對(duì)Cd脅迫的響應(yīng)特征,并為深入研究馬鈴薯根際土壤細(xì)菌與耐Cd性之間的關(guān)系提供理論基礎(chǔ),應(yīng)用高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)不同含量（0、10、50、100 mg/kg）Cd脅迫下馬鈴薯根際土壤細(xì)菌多樣性和群落結(jié)構(gòu)進(jìn)行研究。結(jié)果表明,Cd含量為100 mg/kg時(shí),馬鈴薯根際土壤細(xì)菌多樣性最低;Cd含量為10 mg/kg時(shí),馬鈴薯根際土壤細(xì)菌多樣性最高。在門水平上,變形菌門（Proteobacteria）為優(yōu)勢(shì)菌門,占比為37.78%～48.28%;在屬水平上,水恒桿菌屬（Mizugakiibacter）為優(yōu)勢(shì)菌屬,占比為9.16%～20.44%。主成分分析表明,馬鈴薯根際土壤細(xì)菌受Cd脅迫后,其群落結(jié)構(gòu)與對(duì)照具有明顯差異。利用相關(guān)性分析得到3個(gè)對(duì)Cd具有耐性的細(xì)菌菌屬,分別是苔蘚桿菌屬（Bryobacter）、Flexivirga和Jatrophihabitans。 

【文章來(lái)源】：河南農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,49(06)北大核心

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Cd脅迫下馬鈴薯根際土壤樣品細(xì)菌 OTU 數(shù)量韋恩圖

由圖2可知,4 個(gè)不同處理的土壤細(xì)菌稀釋性曲線均呈先上升隨后趨于平緩的趨勢(shì),更多的數(shù)據(jù)量只會(huì)產(chǎn)生少量新的OTU,說(shuō)明取樣基本合理,樣本能夠比較真實(shí)地反映不同處理土壤中細(xì)菌群落。結(jié)合覆蓋率和稀釋性曲線數(shù)據(jù)可知,測(cè)序結(jié)果包含了大多數(shù)細(xì)菌類群, 可以反映不同處理土壤中細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)組成。2.3 Cd脅迫下馬鈴薯根際土壤細(xì)菌的群落組成

由圖3可知,在門水平上,將樣本中相對(duì)豐度占比<0.01的樣品歸為一類(Others)后發(fā)現(xiàn),Cd脅迫下馬鈴薯根際土壤細(xì)菌群落主要屬于11門:變形菌門(Proteobacteria)、放線菌門(Actinobacteria)、厚壁菌門(Firmicutes)、綠彎菌門(Chloroflexi)、 Saccharibacteria、酸桿菌門(Acidobacteria)、擬桿菌門(Bacteroidetes)、 芽單胞菌門(Gemmatimonadetes)、浮霉菌門(Planctomycetes)、藍(lán)藻門(Cyanobacteria)和Unclassified_k_norank�？傮w而言,變形菌門豐度最高,占比為37.78%～48.28%,為優(yōu)勢(shì)菌門;其次為放線菌門,占比為10.14%～17.16%;已命名菌門中藍(lán)藻門豐度最低,占比為0.19%～2.07%。與對(duì)照土壤(Cd0)相比,放線菌門、綠彎菌門和藍(lán)藻門的豐度增加,表明放線菌門、綠彎菌門、藍(lán)藻門對(duì)重金屬Cd具有耐受性。在屬水平上(細(xì)菌群落的相對(duì)豐度用對(duì)數(shù)表示),對(duì)4個(gè)處理的土壤細(xì)菌豐度分布特征進(jìn)行聚類(圖4),Cd100與Cd50處理土壤細(xì)菌類群相似度最高,其與Cd10 處理聚為一類;Cd0與上述3個(gè)處理聚成的一大類為同一水平。在屬水平上獲得了前50個(gè)優(yōu)勢(shì)菌屬,其中,豐度>1%的有水恒桿菌屬(Mizugakiibacter)、類芽孢桿菌屬(Paenibacillus)、Norank_p__Saccharibacteria、產(chǎn)黃桿菌屬(Rhodanobacter)等24個(gè)菌屬。其中,水恒桿菌屬占比為9.16%～20.44%,Norank_p__Saccharibacteria占比為5.36%～12.11%,產(chǎn)黃桿菌屬占比為3.67%～5.26%,顯著富集在各個(gè)處理中。此外,在Cd脅迫后,部分具有優(yōu)勢(shì)的菌屬消失,出現(xiàn)了新的菌屬。Norank_c__TK10和Norank_f__DA111僅出現(xiàn)在對(duì)照組中。另外一些菌屬僅在某一Cd處理中出現(xiàn),如德沃西亞菌屬(Devosia)、Paenibacillus僅存在于Cd10處理中。以上結(jié)果表明,土壤受Cd脅迫后,其細(xì)菌群落發(fā)生了明顯變化。

【參考文獻(xiàn)】：
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