細(xì)菌利用各種機(jī)制來(lái)精確地調(diào)節(jié)自身行為,以響應(yīng)環(huán)境的變化,從而促進(jìn)細(xì)菌生長(zhǎng)、生存和侵染。Sigma（σ）因子就是其中一類影響基因表達(dá)轉(zhuǎn)錄調(diào)控的全局信號(hào)調(diào)控系統(tǒng)。σ因子作為RNA聚合酶（RNA polymerase,RNAP）的重要組成部分,負(fù)責(zé)識(shí)別特異的啟動(dòng)子序列,提高RNA聚合酶辨認(rèn)啟動(dòng)子的能力。細(xì)菌募集各類σ因子調(diào)控基因表達(dá),響應(yīng)不同的環(huán)境信號(hào),如溫度、滲透壓、酸堿、重金屬等各種脅迫等�；诮Y(jié)構(gòu)和功能上的差別,σ因子可分為兩類:σ54家族和σ70家族。十字花科黑腐病菌（Xanthomonas campestris pv.campstris,Xcc）是一種能在全球范圍內(nèi)引起所有十字花科植物黑腐病的重要植物病原細(xì)菌。本研究對(duì)Xccσ因子在致病中的調(diào)控作用進(jìn)行了研究,為進(jìn)一步闡明Xcc 8004菌株的致病機(jī)理提供基礎(chǔ)�；谝呀�(jīng)測(cè)序的Xcc8004基因組序列,我們利用SMART（Simple Modular Architecture Research Tool）（http://smart.embl-heidelberg.de）分析預(yù)測(cè)得到 15 個(gè) σ 因子:XC1311（RpoN1）和 X... 

【文章來(lái)源】：廣西大學(xué)廣西壯族自治區(qū) 211工程院校

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【學(xué)位級(jí)別】：博士

【部分圖文】：

圖１－１細(xì)菌ＲＮＡ聚合酶全酶示意圖（Ｄａｖｉｓ?ｅｔａｌ．，２０１７）??Ｆｉｕｒｅ?１－１?Ｓｃｈｅｍａｔｉｃ?ｒｅｒｅｓｅｎｔａｔｉｏｎ?ｏｆ?ｂａｃｔｅｒｉａｌ?ＲＮＡＰＲＮＡｏｌｍｅｒａｓｅｈｏｌｏ?ｅｎｚｍｅ??

１．２．２．１?ａ７０家族的結(jié)構(gòu)??（Ｊ？家族是〇因子重要的組成部分，其結(jié)構(gòu)中含有４個(gè)高度保守的區(qū)域：區(qū)??域１、區(qū)域２、區(qū)域３和區(qū)域４，每個(gè)區(qū)域又可分為幾個(gè)不同的亞區(qū)域（圖１－３）。??區(qū)域１?（〇１）位于〇因子的Ｎ端，它是４個(gè)區(qū)域中保守性較低的一段。區(qū)域??１又可分為區(qū)域１．１和區(qū)域１．２。區(qū)域１負(fù)責(zé)將ＤＮＡ從初始的雙鏈閉合狀態(tài)打開(kāi)??４??

含保守的區(qū)域２和區(qū)域４，保證了?〇因子的基本特性：與ＲＮＡ聚合酶核心酶結(jié)??合和識(shí)別特定的啟動(dòng)子序列，但是它們?nèi)鄙侃枺罚且蜃又邪l(fā)現(xiàn)的其它保守區(qū)域??（Ｆｅｋｌｉｓｔｏｖｅｔａｌ．，２０１４）（圖１－４）。ＥＣＦｃｒ因子的主要序列都較保守，而且它們識(shí)??別的啟動(dòng)子也很相似，尤其是在－３５區(qū)中（Ｌｏｎｅｔｔｏ?ｅｔ?ａｌ．，１９９４；?Ｅｎｚ?ｅｔ?ａｌ．，１９９５）。??所有這些蛋白都可以調(diào)控胞質(zhì)功能基因，并且對(duì)胞質(zhì)信號(hào)作出反應(yīng)（Ｌｏｎｅｔｔｏｅｔａｌ．，??１９９４），這個(gè)家族的四個(gè)成員ＡｌｇＵ、ａＥＥ。、ＣａｒＱ和ＣｎｒＨ已知或者預(yù)測(cè)其受同一??操縱子的下游基因負(fù)向調(diào)控（Ｌｉｅｓｅｇａｎｇ?ｅｔ?ａｌ．，?１９９３；?Ｍａｒｔｉｎ?ｅｔ?ａｌ．，?１９９３；?ＭｃＧｏｗａｎ??ｅｔ?ａｌ．，１９９３；?Ｌｏｎｅｔｔｏ?ｅｔ?ａｌ．，?１９９４），但是也存在著不同的調(diào)控機(jī)制，比如ＨｒｐＬ是在??轉(zhuǎn)錄水平上被ＨｒｐＲ和ＨｒｐＳ這兩個(gè)類ＮｔｒＣ蛋白激活（Ｘｉａｏ?ｅｔ?ａｌ．，?１９９４）。??ＥＣＦｏ家族現(xiàn)在約有３８０００個(gè)基因，由７６７９個(gè)細(xì)菌基因組組成，構(gòu)成了細(xì)??菌的主要信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)系統(tǒng)之一（Ｓｔａｒｏｒｉｅｔａｌ．


本文編號(hào)：3537657