RacA與Cdc42調(diào)節(jié)雙型真菌萊氏野村菌的極性生長和微菌核形成
發(fā)布時(shí)間:2021-10-12 21:28
蟲生真菌是一種環(huán)境友好型真菌,在防治農(nóng)林害蟲時(shí)有對(duì)環(huán)境無污染、無殘留和不易產(chǎn)生抗藥性等優(yōu)點(diǎn)。隨著人們環(huán)保意識(shí)的增強(qiáng),人們對(duì)環(huán)境友好型農(nóng)藥的研究也在逐漸加強(qiáng)。萊氏野村菌是一種重要的昆蟲病原真菌,在田間能夠侵染多種夜蛾科害蟲并引起流行病。萊氏野村菌的有效成分為分生孢子,但是由于其產(chǎn)孢需要苛刻的營養(yǎng)和持續(xù)光照,限制了大規(guī)模生產(chǎn)。重慶大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院微生物實(shí)驗(yàn)室采用誘導(dǎo)發(fā)酵技術(shù)培養(yǎng)出了微菌核,并對(duì)其的抗逆性和毒力等進(jìn)行研究,證實(shí)微菌核可以代替分生孢子作為有效的活性成分。其后,采用比較轉(zhuǎn)錄組技術(shù)研究微菌核形成的分子機(jī)理,發(fā)現(xiàn)在微菌核形成過程中伴隨著菌絲的極性生長和氧脅迫(ROS)的產(chǎn)生。本論文是從比較轉(zhuǎn)錄組上調(diào)表達(dá)的cDNA文庫中挑取racA與cdc42基因,將其克隆并證明二者參與菌絲的極性生長和微菌核的形成。主要研究成果:①目標(biāo)基因克隆鑒定:采用SMART RACE RT-PCR技術(shù)獲得racA與cdc42的cDNA和基因組序列,ORF分別為657bp和555bp,各自編碼218和184個(gè)氨基酸;②目標(biāo)基因的生物信息學(xué)分析:采用生物信息學(xué)軟件對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),RacA與Cdc42蛋白都有...
【文章來源】:重慶大學(xué)重慶市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:67 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
縮略詞
1 緒論
1.1 引言
1.2 立題依據(jù)
1.2.1 萊氏野村菌的研究進(jìn)展
1.2.2 微菌核的研究進(jìn)展
1.2.3 RacA 與 Cdc42 蛋白的研究進(jìn)展
1.2.4 RacA、Cdc42 與 NADPH 復(fù)合體以及 ROS 之間關(guān)系的研究
1.3 研究目的
1.4 研究內(nèi)容和技術(shù)路線
1.4.1 研究內(nèi)容
1.4.2 技術(shù)路線
1.5 本研究創(chuàng)新之處
2 racA 和 cdc42 全長 cDNA 與基因組的克隆與分析
2.1 試驗(yàn)材料
2.1.1 試驗(yàn)用菌株
2.1.2 主要試劑
2.1.3 主要設(shè)備儀器
2.1.4 主要溶液和培養(yǎng)基的配制
2.2 主要試驗(yàn)方法
2.2.1 萊氏野村菌微菌核的培養(yǎng)
2.2.2 萊氏野村菌微菌核總 RNA 的提取
2.2.3 萊氏野村菌 RACE 技術(shù)的 cDNA 一鏈的獲得
2.2.4 萊氏野村菌 RACE 技術(shù)的獲得 cDNA 的全長
2.2.5 PCR 產(chǎn)物的測(cè)序
2.2.6 全長 cDNA 的測(cè)通及基因組的克隆
2.2.7 racA 和 cdc42 的生物信息學(xué)及進(jìn)化分析
2.3 結(jié)果與分析
2.3.1 racA 與 cdc42 的 3'/5'RACE 的擴(kuò)增
2.3.2 racA 與 cdc42 的基因組克隆和序列分析
2.3.3 RacA 與 Cdc42 蛋白生物信息學(xué)及進(jìn)化關(guān)系分析
3 racA、cdc42、noxA 和 noxR 的表達(dá)模式分析
3.1 試驗(yàn)材料
3.1.1 試驗(yàn)菌株
3.1.2 主要試劑
3.1.3 主要設(shè)備及儀器
3.1.4 主要培養(yǎng)基
3.2 試驗(yàn)方法
3.2.1 微菌核形成的時(shí)期及材料收集
3.2.2 微菌核形成各個(gè)時(shí)期菌體 RNA 的提取及 cDNA 一鏈的合成
3.2.3 qPCR 引物設(shè)計(jì)
3.2.4 萊氏野村菌 racA、cdc42、noxA 和 noxR 的表達(dá)模式分析
3.2.5 qPCR 結(jié)果分析
3.3 試驗(yàn)結(jié)果與分析
3.3.1 微菌核形成的各個(gè)時(shí)期
3.3.2 racA 與 cdc42 的表達(dá)模式
3.3.3 noxA 與 noxR 的表達(dá)模式
4 RNAi 的方法研究 racA 與 cdc42 的功能
4.1 試驗(yàn)材料
4.1.1 試驗(yàn)菌株
4.1.2 主要試劑
4.1.3 主要設(shè)備儀器
4.1.4 主要培養(yǎng)基和溶液
4.2 主要試驗(yàn)方法
4.2.1 萊氏野村菌 racA 與 cdc42 干擾引物的設(shè)計(jì)
4.2.2 萊氏野村菌 racA 與 cdc42 干擾片段擴(kuò)增
4.2.3 dsRNA 的體外合成
4.2.4 dsRNA 的純化
4.2.5 dsRNA 的酶切消化
4.2.6 siRNA 的純化
4.2.7 siRNA 的轉(zhuǎn)化(改良的 PEG/Licl 的方法)
4.2.8 最適 siRNA 濃度的確定以及干擾效率的測(cè)定
4.2.9 菌落形態(tài)、菌絲兩態(tài)型轉(zhuǎn)變、孢子形態(tài)以及產(chǎn)孢量的測(cè)定
4.2.10 菌絲及微菌核形態(tài)、微菌核數(shù)量的測(cè)定
4.2.11 Reactive Oxygen Species (ROS)的檢測(cè)
4.2.12 干擾后 NOX 復(fù)合體的表達(dá)模式
4.2.13 毒力生測(cè)
4.2.14 數(shù)據(jù)處理
4.3 試驗(yàn)結(jié)果與分析
4.3.1 最適 siRNA 濃度的確定以及干擾效率的測(cè)定
4.3.2 菌落形態(tài)、菌絲兩態(tài)型轉(zhuǎn)變、孢子形態(tài)以及產(chǎn)孢量的測(cè)定
4.3.3 菌絲及微菌核形態(tài)、微菌核數(shù)量的測(cè)定
4.3.4 ROS 的檢測(cè)以及干擾后 NOX 復(fù)合體的表達(dá)模式
4.3.5 毒力生測(cè)
5 racA、cdc42、noxA、noxR 和 cdc24 之間關(guān)系初探
5.1 試驗(yàn)材料
5.2 試驗(yàn)方法
5.3 試驗(yàn)結(jié)果與分析
6 討論
7 主要結(jié)論及后續(xù)工作
7.1 主要研究結(jié)論
7.2 后續(xù)試驗(yàn)建議
致謝
參考文獻(xiàn)
附錄 作者在攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表論文的目錄
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]萊氏野村菌CQNr01微菌核的人工誘導(dǎo)培養(yǎng)[J]. 殷幼平,黃姍,宋章永,王中康. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(23)
[2]蟲生真菌在農(nóng)林害蟲生物防治中的應(yīng)用[J]. 王記祥,馬良進(jìn). 浙江林學(xué)院學(xué)報(bào). 2009(02)
[3]蟲生真菌分子致病機(jī)理及基因工程改造研究進(jìn)展[J]. 呂丁丁,李增智,王成樹. 微生物學(xué)通報(bào). 2008(03)
[4]中國蟲生真菌應(yīng)用50年簡史(英文)[J]. 李增智. 安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2007(02)
[5]蟲生真菌對(duì)害蟲防治的研究與應(yīng)用[J]. 何恒果,李正躍,陳斌,文良柱. 云南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2004(02)
本文編號(hào):3433329
【文章來源】:重慶大學(xué)重慶市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:67 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
縮略詞
1 緒論
1.1 引言
1.2 立題依據(jù)
1.2.1 萊氏野村菌的研究進(jìn)展
1.2.2 微菌核的研究進(jìn)展
1.2.3 RacA 與 Cdc42 蛋白的研究進(jìn)展
1.2.4 RacA、Cdc42 與 NADPH 復(fù)合體以及 ROS 之間關(guān)系的研究
1.3 研究目的
1.4 研究內(nèi)容和技術(shù)路線
1.4.1 研究內(nèi)容
1.4.2 技術(shù)路線
1.5 本研究創(chuàng)新之處
2 racA 和 cdc42 全長 cDNA 與基因組的克隆與分析
2.1 試驗(yàn)材料
2.1.1 試驗(yàn)用菌株
2.1.2 主要試劑
2.1.3 主要設(shè)備儀器
2.1.4 主要溶液和培養(yǎng)基的配制
2.2 主要試驗(yàn)方法
2.2.1 萊氏野村菌微菌核的培養(yǎng)
2.2.2 萊氏野村菌微菌核總 RNA 的提取
2.2.3 萊氏野村菌 RACE 技術(shù)的 cDNA 一鏈的獲得
2.2.4 萊氏野村菌 RACE 技術(shù)的獲得 cDNA 的全長
2.2.5 PCR 產(chǎn)物的測(cè)序
2.2.6 全長 cDNA 的測(cè)通及基因組的克隆
2.2.7 racA 和 cdc42 的生物信息學(xué)及進(jìn)化分析
2.3 結(jié)果與分析
2.3.1 racA 與 cdc42 的 3'/5'RACE 的擴(kuò)增
2.3.2 racA 與 cdc42 的基因組克隆和序列分析
2.3.3 RacA 與 Cdc42 蛋白生物信息學(xué)及進(jìn)化關(guān)系分析
3 racA、cdc42、noxA 和 noxR 的表達(dá)模式分析
3.1 試驗(yàn)材料
3.1.1 試驗(yàn)菌株
3.1.2 主要試劑
3.1.3 主要設(shè)備及儀器
3.1.4 主要培養(yǎng)基
3.2 試驗(yàn)方法
3.2.1 微菌核形成的時(shí)期及材料收集
3.2.2 微菌核形成各個(gè)時(shí)期菌體 RNA 的提取及 cDNA 一鏈的合成
3.2.3 qPCR 引物設(shè)計(jì)
3.2.4 萊氏野村菌 racA、cdc42、noxA 和 noxR 的表達(dá)模式分析
3.2.5 qPCR 結(jié)果分析
3.3 試驗(yàn)結(jié)果與分析
3.3.1 微菌核形成的各個(gè)時(shí)期
3.3.2 racA 與 cdc42 的表達(dá)模式
3.3.3 noxA 與 noxR 的表達(dá)模式
4 RNAi 的方法研究 racA 與 cdc42 的功能
4.1 試驗(yàn)材料
4.1.1 試驗(yàn)菌株
4.1.2 主要試劑
4.1.3 主要設(shè)備儀器
4.1.4 主要培養(yǎng)基和溶液
4.2 主要試驗(yàn)方法
4.2.1 萊氏野村菌 racA 與 cdc42 干擾引物的設(shè)計(jì)
4.2.2 萊氏野村菌 racA 與 cdc42 干擾片段擴(kuò)增
4.2.3 dsRNA 的體外合成
4.2.4 dsRNA 的純化
4.2.5 dsRNA 的酶切消化
4.2.6 siRNA 的純化
4.2.7 siRNA 的轉(zhuǎn)化(改良的 PEG/Licl 的方法)
4.2.8 最適 siRNA 濃度的確定以及干擾效率的測(cè)定
4.2.9 菌落形態(tài)、菌絲兩態(tài)型轉(zhuǎn)變、孢子形態(tài)以及產(chǎn)孢量的測(cè)定
4.2.10 菌絲及微菌核形態(tài)、微菌核數(shù)量的測(cè)定
4.2.11 Reactive Oxygen Species (ROS)的檢測(cè)
4.2.12 干擾后 NOX 復(fù)合體的表達(dá)模式
4.2.13 毒力生測(cè)
4.2.14 數(shù)據(jù)處理
4.3 試驗(yàn)結(jié)果與分析
4.3.1 最適 siRNA 濃度的確定以及干擾效率的測(cè)定
4.3.2 菌落形態(tài)、菌絲兩態(tài)型轉(zhuǎn)變、孢子形態(tài)以及產(chǎn)孢量的測(cè)定
4.3.3 菌絲及微菌核形態(tài)、微菌核數(shù)量的測(cè)定
4.3.4 ROS 的檢測(cè)以及干擾后 NOX 復(fù)合體的表達(dá)模式
4.3.5 毒力生測(cè)
5 racA、cdc42、noxA、noxR 和 cdc24 之間關(guān)系初探
5.1 試驗(yàn)材料
5.2 試驗(yàn)方法
5.3 試驗(yàn)結(jié)果與分析
6 討論
7 主要結(jié)論及后續(xù)工作
7.1 主要研究結(jié)論
7.2 后續(xù)試驗(yàn)建議
致謝
參考文獻(xiàn)
附錄 作者在攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表論文的目錄
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]萊氏野村菌CQNr01微菌核的人工誘導(dǎo)培養(yǎng)[J]. 殷幼平,黃姍,宋章永,王中康. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(23)
[2]蟲生真菌在農(nóng)林害蟲生物防治中的應(yīng)用[J]. 王記祥,馬良進(jìn). 浙江林學(xué)院學(xué)報(bào). 2009(02)
[3]蟲生真菌分子致病機(jī)理及基因工程改造研究進(jìn)展[J]. 呂丁丁,李增智,王成樹. 微生物學(xué)通報(bào). 2008(03)
[4]中國蟲生真菌應(yīng)用50年簡史(英文)[J]. 李增智. 安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2007(02)
[5]蟲生真菌對(duì)害蟲防治的研究與應(yīng)用[J]. 何恒果,李正躍,陳斌,文良柱. 云南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2004(02)
本文編號(hào):3433329
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