為了揭示胡蘿卜連作與輪作模式中土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)和多樣性特征,并探究?jī)煞N耕作模式根際細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)差異,本研究采用Illumina Hi Seq PE250測(cè)序平臺(tái)的雙末端測(cè)序（Paired-End）法對(duì)4組土樣的16S r RNA V4區(qū)進(jìn)行測(cè)序,并進(jìn)行生物信息學(xué)分析。結(jié)果顯示,4個(gè)樣本共獲得196 220條有效序列,相同測(cè)序深度（28 890條）下,RM.F （胡蘿卜-萬(wàn)壽菊輪作根際土壤）樣品中的Chao1指數(shù)和Shannon指數(shù)均高于RM.R （胡蘿卜連作根際土壤）樣品。RM.F樣品中的優(yōu)勢(shì)菌綱為α-變形菌（Alphaproteobacteria）、β-變形菌綱（Betaproteobacteria）、γ-變形菌綱（Gammaproteobacteria）及芽孢桿菌綱（Bacilli）。RM.R樣品中的優(yōu)勢(shì)菌綱是γ-變形菌綱（Gammaproteobacteria）、擬桿菌綱（Bacteroidia）。OTUs比對(duì)結(jié)果顯示,希瓦氏菌屬（Shewanella）、Clostridium sensu stricto 1、Parabacteroides、不動(dòng)菌屬（Acinetobacter）... 

【文章來源】：基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2020,39(05)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】：7 頁(yè)

【部分圖文】：

水稻SET蛋白家族成員系統(tǒng)進(jìn)化分析及分類:基于擬南芥與水稻SET結(jié)構(gòu)域基因家族成員的蛋白全長(zhǎng),使用鄰接法構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹

通過對(duì)KMT3的SET結(jié)構(gòu)域序列比對(duì)發(fā)現(xiàn)，本組的SET結(jié)構(gòu)域由123～124個(gè)氨基酸組成，在數(shù)量上相對(duì)一致；其中有30個(gè)氨基酸位點(diǎn)在所有成員中保持一致(圖3)。SDG4與SDG736的SET結(jié)構(gòu)域由124個(gè)氨基酸組成，其中有88個(gè)氨基酸位點(diǎn)一致(圖3)。在本組成員中，擬南芥中與開花或花器官發(fā)育相關(guān)的成員SDG7、SDG8和SDG26在水稻中的同源基因分別為SDG724、SDG72和SDG708(圖2)，水稻中的這3個(gè)同源基因也已被報(bào)道與開花相關(guān)，本組中的SDG4已被報(bào)道與花器官的發(fā)育相關(guān)，但在水稻中的同源基因SDG736尚未報(bào)道(圖2)，根據(jù)進(jìn)化分析的結(jié)果，本研究推測(cè)SDG736可能與花的調(diào)控相關(guān)。因此本研究將對(duì)SDG736進(jìn)行遺傳功能的研究，探究SDG736是否也與花的相關(guān)調(diào)控有關(guān)。1.3 SDG736超量達(dá)載體構(gòu)建及轉(zhuǎn)基因擬南芥陽(yáng)性苗的獲得

通過對(duì)轉(zhuǎn)基因植株#1、#3、#5的多代篩選后，最終得到他們的純合子，并在#1、#3、#5植株純合子后代的基礎(chǔ)上進(jìn)行表型觀察及下一步實(shí)驗(yàn)。表型分析結(jié)果顯示超量表達(dá)的SDG736擬南芥比野生型擬南芥提前開花(圖7)。超量表達(dá)擬南芥開花時(shí)間為31～32 d，而野生型擬南芥為36～37 d，但在生長(zhǎng)時(shí)間一致的情況下蓮座的數(shù)目基本一致。這表明SDG736可能通過調(diào)控?cái)M南芥開花途徑上的基因表達(dá)從而對(duì)擬南芥開花時(shí)間進(jìn)行調(diào)控；對(duì)開花期調(diào)控作用的結(jié)果與之前生物信息學(xué)分析所推測(cè)SDG736的功能相關(guān)。圖3 KMT3亞家族成員SET結(jié)構(gòu)域序列分析

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]萬(wàn)壽菊煙草多樣性種植對(duì)土壤肥力相關(guān)的菌群和土壤酶活的影響[J]. 吳文濤,薛美靜,張靖,許姍姍,呂德芳,胡艷芳,聶裕芳,王揚(yáng).  分子植物育種. 2018(23)
[2]萬(wàn)壽菊-煙草套作體系中不同生長(zhǎng)期煙草根際土壤微生物多樣性研究[J]. 夏體淵,陳澤斌,蘇源,劉佳妮,余磊,王定康,徐勝光.  西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2018(04)
[3]馬鈴薯間作栽培對(duì)土壤微生物群落結(jié)構(gòu)與功能的影響[J]. 劉亞軍,馬琨,李越,杜春鳳,李倩,李賀,馬玲,汪春明.  核農(nóng)學(xué)報(bào). 2018(06)
[4]三七連作根際微生物多樣性研究[J]. 付麗娜,汪婭婷,王星,姬廣海,魏蘭芳.  云南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)). 2018(02)
[5]連作對(duì)大豆根際土壤細(xì)菌菌群結(jié)構(gòu)的影響[J]. 殷繼忠,李亮,接偉光,蔡柏巖.  生物技術(shù)通報(bào). 2018(01)
[6]萬(wàn)壽菊當(dāng)歸多樣性種植對(duì)土壤真菌多樣性的影響[J]. 魏環(huán)宇,管麗蓉,王揚(yáng),王海寧,劉勝,李正科,王云月,謝勇.  植物保護(hù). 2015(05)
[7]玉米與馬鈴薯間作對(duì)根際微生物群落結(jié)構(gòu)和多樣性的影響[J]. 覃瀟敏,鄭毅,湯利,龍光強(qiáng).  作物學(xué)報(bào). 2015(06)
[8]羅布泊地區(qū)沙生植物根際放線菌多樣性及生物活性的研究[J]. 庹利,旭格拉·哈布丁,郭琳,張玉琴,陶玲,王飛飛,劉佳萌,蔣忠科,潘臻,張玉彬,孫承航.  中國(guó)抗生素雜志. 2012(01)



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