為探討不同共作模式對(duì)稻田土壤細(xì)菌群落多樣性和結(jié)構(gòu)的影響,利用Miseq平臺(tái)Illumina第二代高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)河蟹共作稻田（SDHXZ）、龍蝦共作稻田（SDLXZ）和稻田單作（SDKBZ）的稻田土壤細(xì)菌16S rRNA基因V3-V4區(qū)域進(jìn)行豐富度和多樣性指數(shù)以及群落結(jié)構(gòu)分析。結(jié)果表明,稻田土壤的主要優(yōu)勢(shì)菌門是變形菌門、擬桿菌門、綠彎菌門、放線菌門和酸桿菌門。SDHXZ和SDLXZ中變形菌門和擬桿菌門的相對(duì)豐度均高于SDKBZ。優(yōu)勢(shì)屬中硫化菌屬的相對(duì)豐度在SDHXZ和SDLXZ中均高于SDKBZ。土壤中氨氮含量是主要菌屬的第一影響因子。SDHXZ的Ace指數(shù)和Shannon指數(shù)均高于SDKBZ。主成分分析結(jié)果顯示,SDHXZ和SDLXZ與SDKBZ土壤細(xì)菌群落構(gòu)成有一定差異。初步揭示了河蟹和龍蝦的引入改變稻田土壤細(xì)菌群落的結(jié)構(gòu),尤其是河蟹的引入增加了稻田土壤細(xì)菌群落多樣性,豐富了細(xì)菌群落組成,進(jìn)一步擴(kuò)大了優(yōu)勢(shì)菌門和優(yōu)勢(shì)菌屬的相對(duì)豐度。 

【文章來源】：西北農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2020,29(02)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：8 頁

【部分圖文】：

3種模式下稻田土壤微生物在屬水平上的豐度變化

圖1是對(duì)3種模式下稻田土壤中OTU的組成進(jìn)行主成分分析。由圖1可以看出,SDKBZ的3個(gè)樣品聚在一起具有很好的重復(fù)性。兩種共作稻田與單作稻田的距離較遠(yuǎn),說明龍蝦和河蟹引入后稻田土壤OTU組成差異較大,細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)也有較大差異。2.4 優(yōu)勢(shì)菌門分析

由屬分類水平上的細(xì)菌分類(圖3)可知,平均豐度低于0.01%的物種將被合并為圖中的others。共有21個(gè)屬因在分類學(xué)數(shù)據(jù)庫分類學(xué)譜系的中間等級(jí),沒有科學(xué)名稱,所以用norank作為標(biāo)記。藍(lán)藻屬(norank_c Cyarbacteria)為土壤平均相對(duì)豐度最高的屬,其在SDKBZ中為 6.31%,SDHXZ中為3.24%,SDLXZ中為 5.25%。研究證實(shí)藍(lán)藻是稻田生態(tài)系統(tǒng)中的一種主要微生物類群,可參與全球生物圈碳、氮等物質(zhì)循環(huán)[23]。優(yōu)勢(shì)屬中硫曲菌屬(Sulfuricurvum)屬于能自養(yǎng)的兼性硫氧化菌,它能以氧氣或硝酸鹽作為電子受體而氧化硫化物[24]。硫曲菌屬的相對(duì)豐度則在SDHXZ和SDLXZ中高于SDKBZ,其平均豐度分別為2.0%、3.5%和0.8%,SDLXZ和SDKBZ差異顯著。單糖菌屬(norank_p_Saccharibacteria)在SDHXZ和SDLXZ中的相對(duì)豐度也高于SDKBZ但差異不顯著。而擬桿菌VadinHA17屬(norank_c_Bacteroidetes_VadinHA 17)則在SDHXZ中相對(duì)豐度最高為4.74%,與SDKBZ(1.85%)差異顯著,SDLXZ的相對(duì)豐度為 2.06%,雖高于SDKBZ但差別不大。優(yōu)勢(shì)屬分析可以看出,稻田由于河蟹、龍蝦的引入菌屬結(jié)構(gòu)發(fā)生一定變化。圖3 3種模式下稻田土壤微生物在屬水平上的豐度變化

【參考文獻(xiàn)】：
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