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青枯菌小種4號菌株SD54的比較基因組學(xué)及其寄主特異性研究

發(fā)布時(shí)間:2021-09-01 07:03
  由茄科雷爾氏菌(Ralstonia solanacearum)引起的植物細(xì)菌性青枯病是世界上危害最大、分布最廣、造成損失最嚴(yán)重的植物病害之一,至今尚無有效防治辦法。不同地區(qū)、不同寄主來源的青枯菌菌株在寄主范圍、致病力強(qiáng)弱和細(xì)菌學(xué)特性上并不完全相同。隨著分子生物學(xué)和測序技術(shù)的發(fā)展和完善,細(xì)菌基因組學(xué)研究得到不斷的加強(qiáng)和深入,越來越多的病原被測序。目前為止,除小種4號菌株外,青枯菌的其它4個(gè)生理小種的測序已經(jīng)完成或?qū)⒁瓿。為了更深入的研究小種4號菌株與寄主植物姜之間的特異相關(guān)性,以及為最終解析小種4號青枯菌的致病特異性及其防治奠定基礎(chǔ),本研究以小種4號菌株SD54為例,對該菌株進(jìn)行了全基因組測序、比較基因組學(xué)以及致病特異性分析等研究,取得的主要結(jié)果如下:1.青枯菌小種4號菌株SD54基因組測序及比較基因組學(xué)分析(1)利用Illumina (Solexa)和454焦磷酸測序技術(shù)相結(jié)合的測序方法對SD54進(jìn)行了全基因組序列測定,并經(jīng)過Gap填補(bǔ)和序列組裝最終獲得了SD54的基因組框架圖。序列分析表明:SD54基因組大小為5,784,798bp,平均GC含量67%,編碼5,496個(gè)CDS,56... 

【文章來源】:山東師范大學(xué)山東省

【文章頁數(shù)】:83 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

青枯菌小種4號菌株SD54的比較基因組學(xué)及其寄主特異性研究


青枯病菌致病性菌株(左)和非致病性菌株(右)在TZC瓊脂培養(yǎng)基上的形態(tài)

青枯菌小種4號菌株SD54的比較基因組學(xué)及其寄主特異性研究


青枯菌菌株GMI1000的2個(gè)復(fù)制子(引自[26]

青枯菌小種4號菌株SD54的比較基因組學(xué)及其寄主特異性研究


青枯菌毒性調(diào)控系統(tǒng)(引自[56]


本文編號:3376505

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