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朱砂葉螨miRNA鑒定及其在敏感和抗藥性品系的表達差異

發(fā)布時間:2021-08-11 22:11
  朱砂葉螨(Tetranychus cinnabarinus)是重要的世界性害螨,因其個體小、繁殖速度快、移動范圍小、接觸藥劑機會多和近親繁殖率高等特點而極易產(chǎn)生抗藥性。miRNAs (microRNAs)是一種人小為21nt左右,由真核生物基因組編碼的內(nèi)源性,具有調(diào)控功能的非編碼RNA,它通過5’端種子序列2-8位核苷酸與靶基因mRNA3’端UTR區(qū)互補配對識別,降解靶基因mRNA或抑制mRNA的翻澤,從而調(diào)控基因的表達。為了解miRNAs的調(diào)控作用是否與朱砂葉螨抗藥性的產(chǎn)生有關(guān),我們利用Illumina HiSeq2000測序平臺第一次對朱砂葉螨small RNA進行測序,鑒定朱砂葉螨miRNA并研究其在甲氰菊酯抗性品系和敏感品系中的表達。主要研究結(jié)果如下1.通過small RNA測序,在朱砂葉螨甲氰菊酯抗性品系FeR中獲得24796487條reads,在敏感品系SS中獲得22001867條reads.通過篩選,發(fā)現(xiàn)sRNA(18-30nt)的在FeR中為21232699條,其中的7014169條(33.56%)能匹配上二斑葉螨(Tetranychus urticae)基因組;在SS... 

【文章來源】:西南大學(xué)重慶市 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:72 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
Abstract
縮略語
第一章 文獻綜述
    1. 朱砂葉螨及其抗性
        1.1 朱砂葉螨
        1.2 葉螨抗性概況
        1.3 葉螨抗性機理
        1.4 甲氰菊酯研究現(xiàn)狀
    2. microRNAs(miRNAs)
        2.1 miRNA簡介
        2.2 miRNA功能
引言
第二章 朱砂葉螨small RNA測序
    1. 材料與方法
        1.1 供試朱砂葉螨
        1.2 供試藥劑和儀器
        1.3 實驗材料
        1.4 朱砂葉螨抗性水平的確定
        1.5 提取RNA所需耗材處理方法
        1.6 葉碟法收集朱砂葉螨
        1.7 朱砂葉螨總RNA的提取和質(zhì)量檢測
        1.8 朱砂葉螨轉(zhuǎn)錄組測序方法
    2 結(jié)果與分析
        2.1 朱砂葉螨總RNA質(zhì)量檢測結(jié)果
        2.2 朱砂葉螨small RNA測序概況
        2.3 small RNA測序質(zhì)量分析
    3. 討論
第三章 朱砂葉螨small RNA生物信息學(xué)分析
    1 材料與方法
        1.1 實驗工具
        1.2 生物信息學(xué)分析方法
    2. 結(jié)果與分析
        2.1 已知miRNA的鑒定結(jié)果
        2.2 新的miRNA的預(yù)測結(jié)果
        2.3 miRNA靶基因預(yù)測及抗性基因分析
        2.4 差異表達的miRNA及鞭基因分析
        2.5 miRNA堿基編輯
    3. 討論
第四章 朱砂葉螨miRNA表達研究
    1 材料與方法
        1.1 供試朱砂葉螨
        1.2 供試試劑與儀器
        1.3 實驗材料
        1.4 朱砂葉螨總RNA的提取及質(zhì)量檢測
        1.5 定量PCR
    2. 結(jié)果與分析
        2.1 朱砂葉螨總RNA質(zhì)量檢測
        2.2 標(biāo)準(zhǔn)曲線
        2.3 溶解曲線及相對表達
    3. 討論
參考文獻
附錄
致謝
在讀期間發(fā)表的論文
在讀期間參加的科研課題


【參考文獻】:
期刊論文
[1]阿維菌素的研究與應(yīng)用前景探析[J]. 徐麗君,王英滿,徐建陶.  現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2008(21)
[2]我國朱砂葉螨研究進展[J]. 劉波,桂連友.  長江大學(xué)學(xué)報(自科版)農(nóng)學(xué)卷. 2007(03)
[3]桑園害蟲朱砂葉螨的研究進展[J]. 吳福安,王興科,余茂德,程嘉翎.  蠶業(yè)科學(xué). 2006(03)
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[9]Resistance Selection of Tetranychus cinnabarinus to Three Acaricides and Its Management Strategy[J]. HE Lin, ZHAO Zhi-mo, DENG Xin-ping, WANG Jin-jun, LIU Huai and LIU Ying-hongKey Laboratory of Entomology and Pest Control Engineering of Chongqing, Southwest Agricultural University , Chongqing 400716 , P. R. China.  Agricultural Sciences in China. 2003(02)
[10]朱砂葉螨對兩種殺螨劑的抗性遺傳力及風(fēng)險評估[J]. 何林,趙志模,鄧新平,王進軍,劉懷.  植物保護學(xué)報. 2002(04)

博士論文
[1]日本落葉松實生苗small RNA測序、microRNA鑒定及其目標(biāo)基因差異表達分析[D]. 吳濤.中國林業(yè)科學(xué)研究院 2012

碩士論文
[1]朱砂葉螨鈉通道基因克隆及其kdr突變研究[D]. 馮亞寧.西南大學(xué) 2011



本文編號:3336982

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