云南省紫莖澤蘭入侵區(qū)炭疽菌遺傳結(jié)構(gòu)研究
發(fā)布時(shí)間:2021-08-06 12:50
植物病害一直是農(nóng)作物優(yōu)質(zhì)高產(chǎn)的重要制約因素之一,而大多數(shù)的植物病害由病原真菌侵染所導(dǎo)致。炭疽菌(Colletotrichum)物種多,寄主廣,在熱帶和亞熱帶廣泛分布,能引起許多農(nóng)作物、木本植物、草本植物和水果患病。炭疽菌的研究目前主要集中在農(nóng)作物及觀賞植物上,對(duì)入侵植物以及本地植物的炭疽菌物種組成差異以及種群之間的遺傳交流情況尚未開展研究。本研究首先通過野外調(diào)查在云南省紫莖澤蘭入侵區(qū)確定了 14個(gè)采樣點(diǎn),采集到了紫莖澤蘭健康葉片、病斑葉片和本地植物病斑葉片,利用傳統(tǒng)分離培養(yǎng)技術(shù),經(jīng)核糖體轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)序列(Internaltranscribed spacers gene,ITS)測(cè)序鑒定,獲得了 874株炭疽菌。對(duì)其中數(shù)量占優(yōu)勢(shì)的ITS基因型OTU48、OTU397進(jìn)行多基因擴(kuò)增,包括肌動(dòng)蛋白基因(Actin gene,ACT)、3-磷酸甘油醛脫氫酶基因(Glyceraldehydes-3-phosphate dehydrogenase gene,GAPDH)、幾丁質(zhì)合成酶A基因(ChitinsynthaseAgene,CHS-1)、β-微管蛋白基因(β-Tubulin2gene,TUB2...
【文章來源】:云南大學(xué)云南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:92 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖2樣地地理信息圖??Fi?
炭疽菌涵蓋了云南省紫莖澤蘭入侵區(qū)14個(gè)樣地,其中91株來自紫莖澤蘭病斑,??占總菌株數(shù)的25%;?189株來自紫莖澤蘭健康葉片,占總菌株數(shù)的52%;?83株來??自紫莖澤蘭入侵區(qū)本地植物,占總菌株數(shù)的23%?(圖4)。另外,通過在UNITE??上比對(duì)菌株的ITS序列,我們獲得了?134株參考菌株的多基因序列(具體菌株信??息見附表1,其中部分菌株序列有缺失片段)。??圖5是多基因聯(lián)合的BI樹。從圖中,我們可以看到大部分的菌株與參考序列中??的膠孢炭疽菌聚集在一個(gè)大的分支,整個(gè)大分支又分成了兩個(gè)主要的分支,即Clade??A和CladeB。在CladeA進(jìn)化枝中,大部分菌株為CA^awaesubsp.Ciggaro系統(tǒng)發(fā)??育種;在Clade?B進(jìn)化枝中,果生炭疽菌系統(tǒng)發(fā)育種、暹羅炭疽菌系統(tǒng)發(fā)育種和一??個(gè)未知進(jìn)化分支占據(jù)了主體。單基因所構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹與多基因聯(lián)合構(gòu)樹結(jié)果??基本一致,而在具體的分支上則存在一定的差異(相應(yīng)數(shù)據(jù)未給出)。??yryc*?wy-?oyyr*?twryy?wyy?i?ryy?i?yya"?myr??wyy?iwyir??if
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【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]云南葡萄炭疽病菌遺傳多樣性分析[J]. 鄧維萍,杜飛,楊敏,楊積忠,何霞紅,王海寧,李成云,朱書生. 云南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)). 2015(02)
[2]淺議我國外來物種入侵問題及其防治對(duì)策[J]. 胡隱昌,宋紅梅,牟希東,羅建仁. 生物安全學(xué)報(bào). 2012(04)
[3]外來植物紫莖澤蘭的入侵機(jī)理與控制策略研究進(jìn)展[J]. 萬方浩,劉萬學(xué),郭建英,強(qiáng)勝,李保平,王進(jìn)軍,楊國慶,牛紅榜,桂富榮,黃文坤,蔣智林,王文琪. 中國科學(xué):生命科學(xué). 2011(01)
[4]Repeated Range Expansion and Glacial Endurance of Potentilla glabra(Rosaceae) in the Qinghai-Tibetan Plateau[J]. Hiroshi Ikeda. Journal of Integrative Plant Biology. 2009(07)
[5]土壤微生物生物地理學(xué)研究進(jìn)展[J]. 賀紀(jì)正,葛源. 生態(tài)學(xué)報(bào). 2008(11)
[6]外來入侵植物紫莖澤蘭的研究進(jìn)展[J]. 劉潮,韓利紅,施曉東. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2008(30)
[7]群體遺傳結(jié)構(gòu)中的基因流[J]. 曲若竹,侯林,呂紅麗,李海燕. 遺傳. 2004(03)
[8]分子進(jìn)化生物學(xué)中序列分析方法的新進(jìn)展[J]. 張?jiān)?陳之端. 植物學(xué)通報(bào). 2003(04)
[9]膠孢炭疽菌的種內(nèi)遺傳多樣性研究[J]. 曾大興,戚佩坤,姜子德. 菌物系統(tǒng). 2003(01)
[10]果樹膠孢炭疽菌的RAPD分析[J]. 劉開啟,郭濼. 仲愷農(nóng)業(yè)技術(shù)學(xué)院學(xué)報(bào). 2002(04)
博士論文
[1]毒溝褶菌(Trogia venenata)群體遺傳學(xué)及雞油菌復(fù)合種分子系統(tǒng)學(xué)與生物地理學(xué)研究[D]. 米飛.云南大學(xué) 2016
[2]中國蘋果炭疽病病原菌的遺傳多樣性[D]. 符丹丹.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2014
[3]基于微衛(wèi)星分子標(biāo)記的中國疫區(qū)內(nèi)蘋果蠹蛾Cydia pomonella(L.)種群遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)研究[D]. 門秋雷.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2012
碩士論文
[1]紫莖澤蘭內(nèi)生真菌多樣性及其在周圍環(huán)境分布的動(dòng)態(tài)研究[D]. 苗一方.云南大學(xué) 2017
[2]紫莖澤蘭(Ageratina adenophora)與其優(yōu)勢(shì)葉內(nèi)生真菌的遺傳多樣性研究[D]. 姚廣博.云南大學(xué) 2015
[3]云南省雞樅菌的遺傳多樣性和群體遺傳學(xué)研究[D]. 湯曉召.云南大學(xué) 2015
[4]茶樹炭疽病的病原鑒定及其遺傳多樣性分析[D]. 劉威.福建農(nóng)林大學(xué) 2013
本文編號(hào):3325805
【文章來源】:云南大學(xué)云南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:92 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖2樣地地理信息圖??Fi?
炭疽菌涵蓋了云南省紫莖澤蘭入侵區(qū)14個(gè)樣地,其中91株來自紫莖澤蘭病斑,??占總菌株數(shù)的25%;?189株來自紫莖澤蘭健康葉片,占總菌株數(shù)的52%;?83株來??自紫莖澤蘭入侵區(qū)本地植物,占總菌株數(shù)的23%?(圖4)。另外,通過在UNITE??上比對(duì)菌株的ITS序列,我們獲得了?134株參考菌株的多基因序列(具體菌株信??息見附表1,其中部分菌株序列有缺失片段)。??圖5是多基因聯(lián)合的BI樹。從圖中,我們可以看到大部分的菌株與參考序列中??的膠孢炭疽菌聚集在一個(gè)大的分支,整個(gè)大分支又分成了兩個(gè)主要的分支,即Clade??A和CladeB。在CladeA進(jìn)化枝中,大部分菌株為CA^awaesubsp.Ciggaro系統(tǒng)發(fā)??育種;在Clade?B進(jìn)化枝中,果生炭疽菌系統(tǒng)發(fā)育種、暹羅炭疽菌系統(tǒng)發(fā)育種和一??個(gè)未知進(jìn)化分支占據(jù)了主體。單基因所構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹與多基因聯(lián)合構(gòu)樹結(jié)果??基本一致,而在具體的分支上則存在一定的差異(相應(yīng)數(shù)據(jù)未給出)。??yryc*?wy-?oyyr*?twryy?wyy?i?ryy?i?yya"?myr??wyy?iwyir??if
Fig.7?Haplotype?composition?of?C.?kahawae?subsp.?ciggaro??注:每個(gè)圓圈代表一個(gè)OTU,圓圈的大小表示其相對(duì)豐度。??Note:?Each?circle?represents?an?OTU,?and?circle?size?is?proportional?to?its?abundance.??CaBrrntnrkmm?fraencoU??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]云南葡萄炭疽病菌遺傳多樣性分析[J]. 鄧維萍,杜飛,楊敏,楊積忠,何霞紅,王海寧,李成云,朱書生. 云南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)). 2015(02)
[2]淺議我國外來物種入侵問題及其防治對(duì)策[J]. 胡隱昌,宋紅梅,牟希東,羅建仁. 生物安全學(xué)報(bào). 2012(04)
[3]外來植物紫莖澤蘭的入侵機(jī)理與控制策略研究進(jìn)展[J]. 萬方浩,劉萬學(xué),郭建英,強(qiáng)勝,李保平,王進(jìn)軍,楊國慶,牛紅榜,桂富榮,黃文坤,蔣智林,王文琪. 中國科學(xué):生命科學(xué). 2011(01)
[4]Repeated Range Expansion and Glacial Endurance of Potentilla glabra(Rosaceae) in the Qinghai-Tibetan Plateau[J]. Hiroshi Ikeda. Journal of Integrative Plant Biology. 2009(07)
[5]土壤微生物生物地理學(xué)研究進(jìn)展[J]. 賀紀(jì)正,葛源. 生態(tài)學(xué)報(bào). 2008(11)
[6]外來入侵植物紫莖澤蘭的研究進(jìn)展[J]. 劉潮,韓利紅,施曉東. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2008(30)
[7]群體遺傳結(jié)構(gòu)中的基因流[J]. 曲若竹,侯林,呂紅麗,李海燕. 遺傳. 2004(03)
[8]分子進(jìn)化生物學(xué)中序列分析方法的新進(jìn)展[J]. 張?jiān)?陳之端. 植物學(xué)通報(bào). 2003(04)
[9]膠孢炭疽菌的種內(nèi)遺傳多樣性研究[J]. 曾大興,戚佩坤,姜子德. 菌物系統(tǒng). 2003(01)
[10]果樹膠孢炭疽菌的RAPD分析[J]. 劉開啟,郭濼. 仲愷農(nóng)業(yè)技術(shù)學(xué)院學(xué)報(bào). 2002(04)
博士論文
[1]毒溝褶菌(Trogia venenata)群體遺傳學(xué)及雞油菌復(fù)合種分子系統(tǒng)學(xué)與生物地理學(xué)研究[D]. 米飛.云南大學(xué) 2016
[2]中國蘋果炭疽病病原菌的遺傳多樣性[D]. 符丹丹.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2014
[3]基于微衛(wèi)星分子標(biāo)記的中國疫區(qū)內(nèi)蘋果蠹蛾Cydia pomonella(L.)種群遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)研究[D]. 門秋雷.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2012
碩士論文
[1]紫莖澤蘭內(nèi)生真菌多樣性及其在周圍環(huán)境分布的動(dòng)態(tài)研究[D]. 苗一方.云南大學(xué) 2017
[2]紫莖澤蘭(Ageratina adenophora)與其優(yōu)勢(shì)葉內(nèi)生真菌的遺傳多樣性研究[D]. 姚廣博.云南大學(xué) 2015
[3]云南省雞樅菌的遺傳多樣性和群體遺傳學(xué)研究[D]. 湯曉召.云南大學(xué) 2015
[4]茶樹炭疽病的病原鑒定及其遺傳多樣性分析[D]. 劉威.福建農(nóng)林大學(xué) 2013
本文編號(hào):3325805
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