基于形態(tài)和分子標(biāo)記的癭螨分類與系統(tǒng)進(jìn)化研究(蜱螨亞綱:癭螨總科)
發(fā)布時間:2021-07-22 16:11
癭螨是一類世界性分布的植食性螨類。它們的種類繁多,目前超過4000個種類被報道。癭螨對寄主高度;,其中有約80%的種類僅僅被報道于一種寄主植物上。對比其它蜱螨亞綱的類群,癭螨的個體微小,形態(tài)結(jié)構(gòu)特殊。癭螨的經(jīng)濟(jì)重要性僅次于葉螨,有些種類是農(nóng)業(yè)害蟲,又有些種類可以用于雜草的生物防治。因此,精準(zhǔn)、快速的癭螨分類需求不斷增加。癭螨的種內(nèi)進(jìn)化往往表現(xiàn)出寄主關(guān)聯(lián)特性,這種現(xiàn)象被當(dāng)作自然選擇導(dǎo)致物種分化與成種的重要證據(jù)。之前的癭螨分類學(xué)研究幾乎全都基于形態(tài)學(xué)。然而,如果用于分類鑒定的形態(tài)特征是來自與同型進(jìn)化的,那么所建立的分類系統(tǒng)就不能反映正確的類群內(nèi)系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系。因此,從另一個角度使用分子系統(tǒng)學(xué)方法重建癭螨總科內(nèi)的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系。選取了3個來自rRNA的分子標(biāo)記和112個代表分類單元,使用貝葉斯、最大似然和最大簡約的方法重建癭螨總科系統(tǒng)發(fā)育。根據(jù)進(jìn)化樹內(nèi)部良好的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)與分類單元形態(tài)特征的比較,重新修正一系列支系。對原癭螨總科分類系統(tǒng)的單系測驗的結(jié)果否認(rèn)了其中3個科、1個亞科和4個族的單系性。祖征重建的結(jié)果表明了有5個用于分類鑒定的形態(tài)特征經(jīng)歷了多次獨立進(jìn)化,這是現(xiàn)行分類系統(tǒng)存在問題的關(guān)鍵。另外...
【文章來源】:南京農(nóng)業(yè)大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:142 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1 基于形態(tài)學(xué)的癭螨分類和系統(tǒng)進(jìn)化研究概述
1.1 Nalepa在癭螨分類研究的成就
1.2 Keifer在癭螨分類研究的成就
1.3 現(xiàn)行癭螨分類系統(tǒng)及其爭議
2 基于分子標(biāo)記的癭螨分類和系統(tǒng)進(jìn)化研究概述
2.1 分子標(biāo)記在癭螨中應(yīng)用的關(guān)鍵技術(shù)
2.2 分子標(biāo)記在癭螨分類鑒定的應(yīng)用
2.3 分子標(biāo)記在癭螨種群結(jié)構(gòu)研究的應(yīng)用
2.4 分子標(biāo)記在癭螨分化成種研究的應(yīng)用
3 分類和系統(tǒng)進(jìn)化中寄主關(guān)聯(lián)現(xiàn)象的解釋
3.1 歸家沖動
3.2 遷移能力
3.3 對寄主環(huán)境的依賴程度
3.4 寄主關(guān)聯(lián)的繁殖行為
3.5 繁殖率
4 與癭螨分類和系統(tǒng)進(jìn)化有關(guān)的行為學(xué)線索
4.1 癭螨的遷移行為
4.2 癭螨的覓食行為
5 本研究意義和思路
第二章 基于分子標(biāo)記的癭螨總科分類和系統(tǒng)進(jìn)化研究
1 材料與方法
1.1 癭螨總科分類單元的選取
1.2 DNA提取,PCR,克隆和測序
1.3 序列比對和系統(tǒng)發(fā)育分析
1.4 現(xiàn)行分類系統(tǒng)的單系測驗
1.5 形態(tài)祖征和寄主轉(zhuǎn)移歷史的重建
2 結(jié)果與分析
2.1 系統(tǒng)發(fā)育分析
2.2 現(xiàn)行分類系統(tǒng)的單系測驗
2.3 形態(tài)祖征和寄主轉(zhuǎn)移歷史的重建
3 討論
3.1 對現(xiàn)行癭螨總科分類系統(tǒng)合理性的質(zhì)疑
3.2 癭螨形態(tài)特征的同型進(jìn)化現(xiàn)象
3.3 癭螨的寄主轉(zhuǎn)移歷史和進(jìn)化的寄主關(guān)聯(lián)現(xiàn)象
第三章 癭螨進(jìn)化歷史和區(qū)系分布研究
1 材料與方法
1.1 癭螨分類單元及其外群的選取
1.2 DNA提取,PCR和測序
1.3 序列比對,系統(tǒng)發(fā)育分析和分化時間推算
1.4 種類統(tǒng)計資料收集
1.5 類群的劃分準(zhǔn)則
2 結(jié)果與分析
2.1 系統(tǒng)發(fā)育分析
2.2 分化時間推算
2.3 區(qū)系統(tǒng)計
3 討論
3.1 癭螨在蜱螨亞綱中的分類地位
3.2 癭螨與其寄主植物進(jìn)化歷史的關(guān)聯(lián)
3.3 癭螨區(qū)系的一般規(guī)律
3.4 現(xiàn)階段癭螨區(qū)系分析的局限
第四章 形態(tài)和分子標(biāo)記揭示和隱藏的癭螨微進(jìn)化——以山楂四癭螨為例
1 材料與方法
1.1 山楂四癭螨不同寄主和地理種群的采集
1.2 形態(tài)測量分析
1.3 DNA提取,PCR,克隆和測序
1.4 序列比對和系統(tǒng)發(fā)育分析
1.5 種的界定
1.6 支系內(nèi)的單倍型網(wǎng)狀圖分析
2 結(jié)果與分析
2.1 形態(tài)測量分析
2.2 系統(tǒng)發(fā)育分析
2.3 種的界定
2.4 支系內(nèi)種群分化分析
3 討論
3.1 不同地理種群的寄主關(guān)聯(lián)隱存多樣性
3.2 不同方法隱存多樣性的結(jié)果比較
3.3 對癭螨的寄主關(guān)聯(lián)系統(tǒng)進(jìn)化研究的展望
第五章 寄主關(guān)聯(lián)差異現(xiàn)象缺失的癭螨微進(jìn)化——以茶橙癭螨和龍首麗癭螨為例
1 材料與方法
1.1 茶橙癭螨與龍首麗癭螨的樣品采集
1.2 DNA提取,PCR和測序
1.3 種群結(jié)構(gòu)分析
2 結(jié)果與分析
3 討論
3.1 寄主關(guān)聯(lián)差異現(xiàn)象證據(jù)的缺失
3.2 近期入侵歷史
第六章 生態(tài)群落的癭螨微進(jìn)化比較——以裸子植物癭螨群落為例
1 材料與方法
1.1 裸子植物癭螨群落的樣本采集和鑒定
1.2 DNA提取,PCR和測序
1.3 序列的分析
2 結(jié)果與分析
2.1 中國東洋區(qū)裸子植物癭螨群落多樣性
2.2 線粒體和核基因在表現(xiàn)群落遺傳多樣性的差異
2.3 寄主選擇和地理隔離造成的種群結(jié)構(gòu)
2.4 兩大類群的遺傳多樣·性差異
3 討論
3.1 單一形態(tài)鑒定對群落多樣性的掩蓋
3.2 并非絕對的HAD現(xiàn)象
3.3 種群較頻繁的長距離遷移
3.4 癭螨進(jìn)化與其寄主植物進(jìn)化的聯(lián)系
后記
參考文獻(xiàn)
附錄
以第一作者發(fā)表論文和參與學(xué)術(shù)會議情況
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]游離氨基酸含量與茶樹抗螨性的關(guān)系[J]. 陳華才,許寧,陳宗懋. 植物保護(hù)學(xué)報. 2000(04)
[2]茶樹品種抗茶橙癭螨的形態(tài)與生化特征[J]. 許寧,陳雪芬,陳華才,陳宗懋. 茶葉科學(xué). 1996(02)
[3]癭螨染色體核型分析及其親緣關(guān)系[J]. 匡海源,林福平,趙健. 動物分類學(xué)報. 1995(04)
[4]我國茶樹上的癭螨[J]. 趙健,匡海源. 茶葉. 1995(02)
[5]癭螨總科科間親緣關(guān)系的初步研究[J]. 匡海源,謝茂成,龔國璣. 動物分類學(xué)報. 1992(03)
本文編號:3297468
【文章來源】:南京農(nóng)業(yè)大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:142 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1 基于形態(tài)學(xué)的癭螨分類和系統(tǒng)進(jìn)化研究概述
1.1 Nalepa在癭螨分類研究的成就
1.2 Keifer在癭螨分類研究的成就
1.3 現(xiàn)行癭螨分類系統(tǒng)及其爭議
2 基于分子標(biāo)記的癭螨分類和系統(tǒng)進(jìn)化研究概述
2.1 分子標(biāo)記在癭螨中應(yīng)用的關(guān)鍵技術(shù)
2.2 分子標(biāo)記在癭螨分類鑒定的應(yīng)用
2.3 分子標(biāo)記在癭螨種群結(jié)構(gòu)研究的應(yīng)用
2.4 分子標(biāo)記在癭螨分化成種研究的應(yīng)用
3 分類和系統(tǒng)進(jìn)化中寄主關(guān)聯(lián)現(xiàn)象的解釋
3.1 歸家沖動
3.2 遷移能力
3.3 對寄主環(huán)境的依賴程度
3.4 寄主關(guān)聯(lián)的繁殖行為
3.5 繁殖率
4 與癭螨分類和系統(tǒng)進(jìn)化有關(guān)的行為學(xué)線索
4.1 癭螨的遷移行為
4.2 癭螨的覓食行為
5 本研究意義和思路
第二章 基于分子標(biāo)記的癭螨總科分類和系統(tǒng)進(jìn)化研究
1 材料與方法
1.1 癭螨總科分類單元的選取
1.2 DNA提取,PCR,克隆和測序
1.3 序列比對和系統(tǒng)發(fā)育分析
1.4 現(xiàn)行分類系統(tǒng)的單系測驗
1.5 形態(tài)祖征和寄主轉(zhuǎn)移歷史的重建
2 結(jié)果與分析
2.1 系統(tǒng)發(fā)育分析
2.2 現(xiàn)行分類系統(tǒng)的單系測驗
2.3 形態(tài)祖征和寄主轉(zhuǎn)移歷史的重建
3 討論
3.1 對現(xiàn)行癭螨總科分類系統(tǒng)合理性的質(zhì)疑
3.2 癭螨形態(tài)特征的同型進(jìn)化現(xiàn)象
3.3 癭螨的寄主轉(zhuǎn)移歷史和進(jìn)化的寄主關(guān)聯(lián)現(xiàn)象
第三章 癭螨進(jìn)化歷史和區(qū)系分布研究
1 材料與方法
1.1 癭螨分類單元及其外群的選取
1.2 DNA提取,PCR和測序
1.3 序列比對,系統(tǒng)發(fā)育分析和分化時間推算
1.4 種類統(tǒng)計資料收集
1.5 類群的劃分準(zhǔn)則
2 結(jié)果與分析
2.1 系統(tǒng)發(fā)育分析
2.2 分化時間推算
2.3 區(qū)系統(tǒng)計
3 討論
3.1 癭螨在蜱螨亞綱中的分類地位
3.2 癭螨與其寄主植物進(jìn)化歷史的關(guān)聯(lián)
3.3 癭螨區(qū)系的一般規(guī)律
3.4 現(xiàn)階段癭螨區(qū)系分析的局限
第四章 形態(tài)和分子標(biāo)記揭示和隱藏的癭螨微進(jìn)化——以山楂四癭螨為例
1 材料與方法
1.1 山楂四癭螨不同寄主和地理種群的采集
1.2 形態(tài)測量分析
1.3 DNA提取,PCR,克隆和測序
1.4 序列比對和系統(tǒng)發(fā)育分析
1.5 種的界定
1.6 支系內(nèi)的單倍型網(wǎng)狀圖分析
2 結(jié)果與分析
2.1 形態(tài)測量分析
2.2 系統(tǒng)發(fā)育分析
2.3 種的界定
2.4 支系內(nèi)種群分化分析
3 討論
3.1 不同地理種群的寄主關(guān)聯(lián)隱存多樣性
3.2 不同方法隱存多樣性的結(jié)果比較
3.3 對癭螨的寄主關(guān)聯(lián)系統(tǒng)進(jìn)化研究的展望
第五章 寄主關(guān)聯(lián)差異現(xiàn)象缺失的癭螨微進(jìn)化——以茶橙癭螨和龍首麗癭螨為例
1 材料與方法
1.1 茶橙癭螨與龍首麗癭螨的樣品采集
1.2 DNA提取,PCR和測序
1.3 種群結(jié)構(gòu)分析
2 結(jié)果與分析
3 討論
3.1 寄主關(guān)聯(lián)差異現(xiàn)象證據(jù)的缺失
3.2 近期入侵歷史
第六章 生態(tài)群落的癭螨微進(jìn)化比較——以裸子植物癭螨群落為例
1 材料與方法
1.1 裸子植物癭螨群落的樣本采集和鑒定
1.2 DNA提取,PCR和測序
1.3 序列的分析
2 結(jié)果與分析
2.1 中國東洋區(qū)裸子植物癭螨群落多樣性
2.2 線粒體和核基因在表現(xiàn)群落遺傳多樣性的差異
2.3 寄主選擇和地理隔離造成的種群結(jié)構(gòu)
2.4 兩大類群的遺傳多樣·性差異
3 討論
3.1 單一形態(tài)鑒定對群落多樣性的掩蓋
3.2 并非絕對的HAD現(xiàn)象
3.3 種群較頻繁的長距離遷移
3.4 癭螨進(jìn)化與其寄主植物進(jìn)化的聯(lián)系
后記
參考文獻(xiàn)
附錄
以第一作者發(fā)表論文和參與學(xué)術(shù)會議情況
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]游離氨基酸含量與茶樹抗螨性的關(guān)系[J]. 陳華才,許寧,陳宗懋. 植物保護(hù)學(xué)報. 2000(04)
[2]茶樹品種抗茶橙癭螨的形態(tài)與生化特征[J]. 許寧,陳雪芬,陳華才,陳宗懋. 茶葉科學(xué). 1996(02)
[3]癭螨染色體核型分析及其親緣關(guān)系[J]. 匡海源,林福平,趙健. 動物分類學(xué)報. 1995(04)
[4]我國茶樹上的癭螨[J]. 趙健,匡海源. 茶葉. 1995(02)
[5]癭螨總科科間親緣關(guān)系的初步研究[J]. 匡海源,謝茂成,龔國璣. 動物分類學(xué)報. 1992(03)
本文編號:3297468
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