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基于土壤宏基因組的新穎木聚糖酶基因克隆及生物信息學分析

發(fā)布時間:2021-06-16 14:35
  土壤微生物總DNA經(jīng)試劑盒提取,使用CODEHOP引物進行木聚糖酶基因編碼區(qū)核心序列進行擴增,根據(jù)所擴增序列設計hiTAIL-PCR特異性引物,最終克隆了1個編碼區(qū)長度為1 284 bp的新穎木聚糖酶基因。生物信息學分析表明,該基因編碼蛋白質氨基酸序列長度為427 aa,分子量為47 398.91 Da,理論等電點(pI)為8.99,是一個不含跨膜區(qū)域的親水性蛋白。 

【文章來源】:生物化工. 2020,6(01)

【文章頁數(shù)】:6 頁

【部分圖文】:

基于土壤宏基因組的新穎木聚糖酶基因克隆及生物信息學分析


蛋白質跨膜區(qū)域分析

電泳圖,電泳,土壤,質量


土壤中因富含腐殖酸、多酚等雜質,其高質量微生物總DNA的提取頗有困難困難較大。本研究使用試劑盒法提取總DNA。所提樣品經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測,結果如圖1所示。發(fā)現(xiàn)其條帶單一,泳道內無彌散、降解現(xiàn)象,初步認為可滿足PCR擴增對模板質量的要求。為了進一步驗證模板質量,以微生物16S rRNA通用引物27F/1525R擴增,PCR產物經(jīng)電泳檢測,結果如圖2所示?梢钥吹綌U增產物條帶清晰、符合預期大小,因此所提取DNA可滿足后續(xù)實驗要求。2.2 木聚糖酶基因核心序列的PCR擴增

基于土壤宏基因組的新穎木聚糖酶基因克隆及生物信息學分析


16S rRNAPCR檢測

【參考文獻】:
期刊論文
[1]木聚糖酶對全麥面團特性的影響研究[J]. 王佳玉,陳鳳蓮,湯曉智.  中國糧油學報. 2019(09)
[2]木聚糖酶預處理在檀皮纖維漂白中的應用[J]. 王陽,盛杰,劉旭,楊仁黨.  造紙科學與技術. 2019(01)
[3]木聚糖酶對肉雞不同類型飼糧凈能值的影響[J]. 班志彬,閆曉剛,張瑩,于維,郎朝麗,梁浩,李立佳,蘇斯瑤,楊華明.  動物營養(yǎng)學報. 2019(03)
[4]基于土壤宏基因組文庫篩選非培養(yǎng)木聚糖酶基因[J]. 熊科,高樂,楊玉煥,崔曉亭,李秀婷.  食品與發(fā)酵工業(yè). 2015(10)
[5]木聚糖酶及其在食品工業(yè)中的應用[J]. 閔兆升,郭會明,顧承真,洪厚勝.  食品與發(fā)酵工業(yè). 2013(10)



本文編號:3233250

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