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基于高通量測序的幾種不同作物根際土壤細菌群落結(jié)構(gòu)和多樣性分析

發(fā)布時間:2021-06-13 14:15
  寧夏揚黃灌區(qū)作物種類單一,在生產(chǎn)中需要配置不同種類的作物以增加其生物多樣性。為了探明不同作物對農(nóng)田土壤細菌群落結(jié)構(gòu)和多樣性的影響,本研究以谷子(Setaria italica)、黑豆(Glycine max)、藜麥(Chenopodium quinoa)及休閑地土壤為對象,測定了土壤pH、全氮、有機質(zhì)、速效鉀、速效磷和堿解氮的含量,在此基礎(chǔ)上,利用Illumina MiSeq高通量測序技術(shù)對比研究了其中的細菌群落結(jié)構(gòu)。結(jié)果表明:種植藜麥后土壤有機質(zhì)、堿解氮、速效鉀和速效磷的含量均升高,分別比休閑地高出2.88%、19.12%、112.04%和39.90%,但pH值降低的最少,為0.01。5組土壤樣品中共得到908 120條有效序列,從不同土壤樣品中,獲得了4 623~5 394種細菌分類操作單元OTU,共涵蓋了31門、92綱、130目、217科和363屬的細菌。菌群分類發(fā)現(xiàn),變形菌門(Protrobacteria)、綠彎菌門(Chloroflexi)和放線菌門(Actinobacteria)是主要的細菌類群,相對豐度占群落的55%~75%;不同作物根際土壤優(yōu)勢菌屬也存在差異。與休閑地相... 

【文章來源】:農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報. 2020,28(08)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】:9 頁

【部分圖文】:

基于高通量測序的幾種不同作物根際土壤細菌群落結(jié)構(gòu)和多樣性分析


共有OTU的維恩圖

二維圖,細菌,β多樣性,理化


不同作物根際土壤細菌β多樣性的主坐標(biāo)分析(PCA)三維(A)和二維(B)圖

曲線圖,曲線圖,細菌,谷子


在屬分類水平,各處理土壤細菌相對豐度排序前14的細菌屬分布見圖4。各處理的優(yōu)勢細菌屬(相對豐度>1%)不同,具體表現(xiàn)為:休閑(C)處理的優(yōu)勢細菌屬有鏈球菌屬(Streptococcus,8.27%)、幽門螺桿菌(Helicobacter,4.17%)、假單胞菌屬(Pseudomonas,3.51%)、Prevotella_7 (3.03%)、玫瑰彎菌屬(Roseiflexus,1.98%)和放線菌屬(Actinomyces,1.52%);黑豆處理土壤的優(yōu)勢細菌屬與休閑處理相似,而藜麥和谷子處理與休閑處理的差異較大。藜麥和谷子處理的優(yōu)勢細菌屬有鞘氨醇單胞菌屬(Sphingomonas)、玫瑰彎菌屬(Roseiflexus)、Sker-manella和豐祐菌屬(Opitutus)。此外研究發(fā)現(xiàn),藜麥和谷子處理中未檢測出Streptococcus、Helicobacter、Prevotella_7和Actinomyces,這些菌屬僅在休閑和黑豆處理中出現(xiàn)。圖2 共有OTU的維恩圖

【參考文獻】:
期刊論文
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[4]基于高通量測序研究草莓根際微生物群落結(jié)構(gòu)和多樣性[J]. 趙帆,趙密珍,王鈺,關(guān)玲,龐夫花.  土壤. 2019(01)
[5]典型喀斯特峰叢洼地不同植被恢復(fù)對土壤養(yǎng)分含量和微生物多樣性的影響[J]. 胡芳,杜虎,曾馥平,宋同清,彭晚霞,張芳.  生態(tài)學(xué)報. 2018(06)
[6]不同土地利用方式對三峽庫區(qū)消落帶土壤細菌和真菌多樣性的影響[J]. 秦紅,李昌曉,任慶水.  生態(tài)學(xué)報. 2017(10)
[7]Wheat, maize and sunflower cropping systems selectively influence bacteria community structure and diversity in their and succeeding crop’s rhizosphere[J]. WEN Xin-ya,Eric Dubinsky,WU Yao,YU Rong,CHEN Fu.  Journal of Integrative Agriculture. 2016(08)
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[9]馬鈴薯連作栽培對土壤微生物多樣性的影響[J]. 秦越,馬琨,劉萍.  中國生態(tài)農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2015(02)
[10]土壤微生物對不同作物根系活動的響應(yīng)[J]. 李曉慧,韓曉增,王樹起,王守宇,嚴(yán)君.  農(nóng)業(yè)系統(tǒng)科學(xué)與綜合研究. 2010(02)

碩士論文
[1]不同苧麻品種根際營養(yǎng)及根際微生物的比較研究[D]. 丁莎莎.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012



本文編號:3227687

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