真菌病毒（Mycovirus或Fungal virus）是侵染真菌的病毒,近年來,越來越受到重視。小麥赤霉病是我國一種重要的植物病害,其優(yōu)勢致病菌是禾谷鐮刀菌（Fusarium graminearum）。Fusarium graminearum hypovirus 2（FgHV2/JS16）和Fusarium graminearum mycotymovirus 1（FgMTV1/SX64）,是本實驗室在前期工作中分別從江蘇省和陜西省禾谷鐮刀菌菌株中鑒定的新病毒,全長序列分別為12800和7863個核苷酸,FgHV2/JS16和FgMTV1/SX64分別是低毒病毒科（Hypoviridae）和蕪菁黃花葉病毒科（Tymoviridae）的新病毒。在此基礎(chǔ)上,本文對FgHV2/JS16的寄主菌株JS16中大小約為5 kb的dsRNA片段測序鑒定,并系統(tǒng)分析FgHV2/JS16的生物學(xué)功能及對寄主轉(zhuǎn)錄組的影響;對FgMTV1/SX64的分類地位進行精確分析,且系統(tǒng)分析FgMTV1/SX64的生物學(xué)功能。該研究為真菌病毒的分類提供重要參考,也為真菌病毒在生物防治中的應(yīng)用奠定理論基礎(chǔ)。1、對禾谷鐮... 

【文章來源】：中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市

【文章頁數(shù)】：80 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
第一部分 引言
    1.1 真菌病毒的研究進展
        1.1.1 真菌病毒的起源
        1.1.2 真菌病毒的分類
        1.1.3 真菌病毒的傳播
        1.1.4 真菌病毒的低毒力
        1.1.5 真菌病毒與寄主真菌的互作
        1.1.6 真菌病毒在生防上的應(yīng)用及存在的挑戰(zhàn)
    1.2 真菌病毒中低毒病毒科病毒的研究
        1.2.1 低毒病毒科病毒種類和特點
        1.2.2 低毒病毒科病毒與寄主的互作
    1.3 真菌病毒中蕪菁黃花葉病毒科病毒的研究
        1.3.1 蕪菁黃花葉病毒屬（Tymovirus）
        1.3.2 玉米雷亞朵非納病毒屬（Marafivirus）
        1.3.3 葡萄斑點病毒屬（Maculavirus）
    1.4 禾谷鐮刀菌中的真菌病毒
        1.4.1 小麥赤霉病
        1.4.2 禾谷鐮刀菌的研究進展
        1.4.3 禾谷鐮刀菌中的真菌病毒
    1.5 研究目的及意義
第二部分 禾谷鐮刀菌病毒FgHV2/JS16的功能鑒定
    第一章 禾谷鐮刀菌病毒FgHV2/JS16的缺陷型RNA克隆及序列分析
        2.1 實驗材料
            2.1.1 供試菌株
            2.1.2 實驗試劑
            2.1.3 實驗儀器
            2.1.4 試劑配制
        2.2 實驗方法
            2.2.1 菌株培養(yǎng)
            2.2.2 缺陷型RNA的dsRNA提取
            2.2.3 缺陷型RNA的膠回收
            2.2.4 缺陷型RNA的c DNA克隆
            2.2.5 缺陷型RNA序列拼接
            2.2.6 缺陷型RNA的Northern blot驗證
            2.2.7 序列分析所用的軟件及方法
        2.3 結(jié)果與分析
            2.3.1 菌株JS16 dsRNA的提取
            2.3.2 缺陷型RNA的cDNA克隆
            2.3.3 缺陷型RNA全長序列拼接
            2.3.4 FgHV2/JS16基因組RNA與其缺陷型RNA的基因組結(jié)構(gòu)比對
            2.3.5 缺陷型RNA的Northern blot驗證
        2.4 小結(jié)與討論
    第二章 禾谷鐮刀菌病毒FgHV2/JS16的生物學(xué)功能鑒定
        3.1 實驗材料
            3.1.1 供試菌株
            3.1.2 實驗試劑
            3.1.3 實驗儀器
            3.1.4 試劑配制
        3.2 實驗方法
            3.2.1 菌落形態(tài)的觀察和生長速度的測定
            3.2.2 分生孢子產(chǎn)量的測定
            3.2.3 生物產(chǎn)量的測定
            3.2.4 毒素測定
            3.2.5 致病力測定
            3.2.6 RNAi相關(guān)基因的表達測定
        3.3 結(jié)果與分析
            3.3.1 菌落形態(tài)的觀察和生長速度的測定
            3.3.2 分生孢子產(chǎn)量的測定
            3.3.3 生物產(chǎn)量的測定
            3.3.4 毒素測定
            3.3.5 致病力測定
            3.3.6 RNAi相關(guān)基因的表達測定
        3.4 小結(jié)與討論
    第三章 感染FgHV2/JS16的禾谷鐮刀菌的轉(zhuǎn)錄組分析
        4.1 實驗材料
            4.1.1 供試菌株
            4.1.2 實驗試劑
            4.1.3 實驗儀器
            4.1.4 試劑配制
        4.2 實驗方法
            4.2.1 菌株活化與培養(yǎng)
            4.2.2 RNA提取
            4.2.3 cDNA文庫構(gòu)建和深度測序
            4.2.4 差異表達基因的鑒定
            4.2.5 基因本體富集分析
        4.3 結(jié)果與分析
            4.3.1 差異表達基因的鑒定
            4.3.2 代表性轉(zhuǎn)錄組的鑒定
            4.3.3 差異表達基因的GO分析
            4.3.4 與代謝途徑有關(guān)的基因表達
            4.3.5 與膜轉(zhuǎn)運系統(tǒng)相關(guān)的基因表達
            4.3.6 FgHV2/JS16侵染對轉(zhuǎn)錄因子的影響
            4.3.7 與RNAi相關(guān)的基因表達上調(diào)
            4.3.8 與真菌毒素和色素合成相關(guān)的基因表達上調(diào)
            4.3.9 與有性生殖相關(guān)的基因表達
        4.4 小結(jié)與討論
第三部分 禾谷鐮刀菌病毒FgMTV1/SX64的功能鑒定
    第一章 禾谷鐮刀菌病毒FgMTV1/SX64的分類地位
        5.1 實驗材料
            5.1.1 供試菌株
            5.1.2 實驗試劑
            5.1.3 實驗儀器
            5.1.4 試劑配制
        5.2 實驗方法
            5.2.1 菌株培養(yǎng)
            5.2.2 dsRNA提取
            5.2.3 序列分析所用的軟件及方法
        5.3 結(jié)果與分析
            5.3.1 菌株SX64 dsRNA的提取
            5.3.2 FgMTV1/SX64的基因組結(jié)構(gòu)
            5.3.3 FgMTV1/SX64的全序列分析
            5.3.4 FgMTV1/SX64編碼蛋白序列比對
            5.3.5 FgMTV1/SX64分類地位的確定
        5.4 小結(jié)與討論
    第二章 禾谷鐮刀菌病毒FgMTV1/SX64的生物學(xué)功能鑒定
        6.1 實驗材料
            6.1.1 供試菌株
            6.1.2 實驗試劑及儀器
        6.2 實驗方法
            6.2.1 菌落形態(tài)的觀察和生長速度的測定
            6.2.2 分生孢子產(chǎn)量的測定
            6.2.3 生物產(chǎn)量的測定
            6.2.4 毒素測定
            6.2.5 致病力測定
        6.3 結(jié)果與分析
            6.3.1 菌落形態(tài)的觀察和生長速度的測定
            6.3.2 分生孢子產(chǎn)量的測定
            6.3.3 生物產(chǎn)量的測定
            6.3.4 毒素測定
            6.3.5 致病力測定
        6.4 小結(jié)與討論
第四部分 全文總結(jié)
參考文獻
附錄
致謝
作者簡歷



本文編號：3220045