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YajQ家族c-di-GMP受體蛋白XC3703、Smlt4090及根癌農(nóng)桿菌T6SS銜接蛋白Atu4349結(jié)構(gòu)及功能的

發(fā)布時間:2021-06-08 15:28
  野油菜黃單胞菌野油菜致病變種(Xanthomonas campestris pv.campestris,Xcc)是引起十字花科植物黑腐病的致病菌。Xcc能夠在世界范圍內(nèi)感染十字花科植物,從而在種植此類作物的地區(qū)造成重大經(jīng)濟損失。嗜麥芽寡養(yǎng)單胞菌(Stenotrophomonas maltophilia)是一種較為罕見的革蘭氏陰性條件致病菌,易引起免疫力低下個體出現(xiàn)感染癥狀。c-di-GMP是一種廣為人知的胞內(nèi)第二信使,參與細(xì)菌包括生物被膜合成、細(xì)菌毒力、細(xì)胞運動等多種重要生理功能。而c-di-GMP的功能是通過細(xì)胞內(nèi)存在的c-di-GMP受體實現(xiàn)的。c-di-GMP通過與受體相互作用而引起下游相應(yīng)生理生化功能變化從而行使其功能。近期有研究報道YajQ蛋白家族成員中存在一種新型的c-di-GMP受體。YajQ家族蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)在細(xì)菌中相對保守,具有潛在的與核酸結(jié)合的能力。而Xcc中的YajQ家族成員XC3703被證明能與轉(zhuǎn)錄因子XC2801發(fā)生相互作用,而其與c-di-GMP的結(jié)合能夠逆轉(zhuǎn)這種相互作用,從而影響下游基因的表達,影響包括生物被膜形成、細(xì)菌毒力等在內(nèi)的多種重要生物學(xué)功能。而S... 

【文章來源】:山東大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:90 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
符號說明
第一部分 XC3703及Smlt4090結(jié)構(gòu)與功能的研究
    第一章 前言
        1.1. 野油菜黃單胞菌野油菜致病變種概述
        1.2 Xcc生物被膜形成及調(diào)控
            1.2.1 生物被膜概述
            1.2.2 Xcc生物被膜形成調(diào)控機制
        1.3 c-di-GMP調(diào)控機制
            1.3.1 c-di-GMP概述
            1.3.2 c-di-GMP受體蛋白質(zhì)
        1.4 嗜麥芽寡養(yǎng)單胞菌概述
        1.5 課題研究意義及主要內(nèi)容
    第二章 XC3703及Smlt4090的表達純化及晶體篩選
        2.1 XC3703蛋白分析
        2.2 Smlt4090蛋白分析
        2.3 材料
            2.3.1 基因組、載體和菌株
            2.3.2 主要試劑及服務(wù)
            2.3.3 主要儀器
            2.3.4 主要緩沖液及溶液配制
        2.4 實驗方法
            2.4.1 原核表達載體的構(gòu)建
            2.4.2 蛋白質(zhì)的表達純化
            2.4.3 晶體篩選及優(yōu)化
        2.5 蛋白純化及晶體生長實驗結(jié)果
            2.5.1 XC3703的表達純化結(jié)果
            2.5.2 Smlt4090的表達純化結(jié)果
            2.5.3 XC3703的晶體生長及優(yōu)化結(jié)果
            2.5.4 Smlt4090的晶體生長及優(yōu)化結(jié)果
        2.6 本章小結(jié)
    第三章 XC3703及Smlt4090衍射數(shù)據(jù)的收集及結(jié)構(gòu)的解析
        3.1 試劑、材料及儀器
        3.2 衍射數(shù)據(jù)的收集及結(jié)構(gòu)解析
            3.2.1 衍射數(shù)據(jù)的測試及收集
            3.2.2 衍射數(shù)據(jù)的處理
            3.2.3 相位的確定
            3.2.4 模型的構(gòu)建
            3.2.5 模型的精修
        3.3 結(jié)構(gòu)解析結(jié)果
            3.3.1 XC3703結(jié)構(gòu)解析結(jié)果及結(jié)構(gòu)分析
            3.3.2 Smlt4090結(jié)構(gòu)解析結(jié)果及結(jié)構(gòu)分析
        3.4 本章小結(jié)
    第四章 XC3703及Smlt4090功能初步研究
        4.1 實驗儀器
        4.2 實驗方法
            4.2.1 聚集態(tài)分析
            4.2.2 相互作用分析
        4.3 實驗結(jié)果
            4.3.1 聚集態(tài)分析
            4.3.2 XC3703與XC2801相互作用分析
        4.4 本章小結(jié)
第二部分 Atu4349的表達純化及晶體篩選
    第一章 前言
        1.1 根癌土壤桿菌概述
        1.2 六型分泌系統(tǒng)簡介
        1.3 Tap蛋白研究進展及實驗主要內(nèi)容
    第二章 Atu4349的表達純化及晶體篩選
        2.1 Atu4349蛋白分析
        2.2 實驗材料
        2.3 實驗方法
            2.3.1 原核表達載體的構(gòu)建
            2.3.2 蛋白質(zhì)的表達純化
        2.4 實驗結(jié)果
            2.4.1 Atu4349蛋白純化結(jié)果
            2.4.2 Atu4349蛋白晶體生長結(jié)果
            2.4.3 Atu4349蛋白晶體衍射結(jié)果
            2.4.4 Atu4349同源蛋白實驗結(jié)果
        2.5 本章小結(jié)
全文總結(jié)
參考文獻
致謝
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本文編號:3218751

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