玫瑰黃鏈霉菌Men-myco-93-63 srpA基因的功能分析
發(fā)布時間:2021-05-15 20:00
玫瑰黃鏈霉菌Men-myco-93-63是一株從馬鈴薯瘡痂病自然衰退土壤中分離的生防菌,能夠產(chǎn)生多種脂溶性抗生素,對多種植物病原真菌有抑制作用。A-因子及其類似物作為一種微生物激素廣泛存在于多種鏈霉菌中,其上均含有一個γ-丁酸酯環(huán)結構。A-因子及其類似物對鏈霉菌的代謝和菌體形態(tài)分化具有重大調控作用,可調控鏈霉菌的氣生菌絲生長、孢子形成以及次級代謝產(chǎn)物的形成。研究發(fā)現(xiàn)afsA基因家族能夠編碼鏈霉菌A-因子及其類似物合成過程中的一種關鍵酶。本實驗室前期工作中將玫瑰黃鏈霉菌Men-myco-93-63抗生素合成基因簇定位于其線性質粒pSR47上,生物信息學分析發(fā)現(xiàn)pSR47含有afsA家族基因srpA。本研究通過基因敲除技術進行srpA基因的功能分析。主要研究結果如下:1)構建srpA基因敲除載體pKC1139-srpAF-tsr-srpAR,應用接合轉移技術將pKC1139-srpAF-tsr-srpAR轉入玫瑰黃鏈霉菌Men-myco-93-63,初篩獲得硫鏈絲菌素抗性突變株。2)分別提取野生株和srpA突變株48h、60h、72h、84h菌絲體總RNA,進行逆轉錄PCR檢測。發(fā)現(xiàn)不同時...
【文章來源】:河北農(nóng)業(yè)大學河北省
【文章頁數(shù)】:50 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
縮寫詞表
1 引言
1.1 玫瑰黃鏈霉菌研究進展
1.2 A-因子及其類似物
1.3 afsA 基因家族是 A-因子及其結構類似物生物合成途徑中的關鍵基因
1.4 基因功能研究方法—基因敲除與基因轉導技術
1.5 本研究的目的及意義
2 材料
2.1 菌株和質粒
2.2 PCR 引物
2.3 限制性內切酶與試劑盒
2.4 分子量標準
2.5 抗生素
2.6 培養(yǎng)基
2.7 緩沖液及試劑
2.8 常用儀器設備
3 方法
3.1 玫瑰黃鏈霉菌 Men-myco-93-63 的菌種保存
3.2 玫瑰黃鏈霉菌 Men-myco-93-63 孢子懸浮液的制備
3.3 堿裂解法鏈霉菌質粒提取[67,79]
3.4 srpA 基因的克隆及原核表達
3.4.1 srpA 基因特異引物的設計
3.4.2 srpA 的 PCR 擴增
3.4.3 srpA 基因原核重組表達載體的構建[70,79,80]
3.4.4 陽性克隆的篩選
3.4.5 srpA 基因序列的測定與分析
3.4.6 srpA 基因在 E. coli M15 中的誘導表達
3.4.7 SrpA 蛋白檢測
3.5 玫瑰黃鏈霉菌 Men-myco-93-63 srpA 基因的敲除
3.5.1 srpA 基因敲除載體的構建
3.5.2 鏈霉菌-大腸桿菌之間的接合轉移
3.5.3 突變菌株的篩選驗證
3.5.4 srpA 基因功能分析
4 結果與分析
4.1 srpA 基因的克隆及原核表達
4.1.1 目的基因 srpA 的克隆
4.1.2 srpA 基因的序列分析
4.1.3 重組表達載體 pQE30-srpA 的構建
4.1.4 srpA 基因在 E. coli 中的誘導表達與檢測
4.2 玫瑰黃鏈霉菌 Men-myco-93-63 srpA 基因的敲除
4.2.1 srpAF、srpAR 的克隆
4.2.2 tsr 基因克隆
4.2.3 srpA 敲除載體 pKC1139-srpAF-tsr-srpAR 的驗證
4.2.4 野生型及突變株玫瑰黃鏈霉菌 Men-myco-93-63 中 srpA 轉錄分析
4.2.5 srpA 缺失對鏈霉菌 Men-myco-93-63 液態(tài)培養(yǎng)條件下菌體生長的影響
4.2.6 srpA 缺失對鏈霉菌 Men-myco-93-63 菌落形態(tài)的影響
4.2.7 srpA 缺失對鏈霉菌 Men-myco-93-63 抗生素生產(chǎn)能力的影響
5 討論
6 結論
7 參考文獻
作者簡歷
致謝
在讀期間發(fā)表的學術論文:
【參考文獻】:
期刊論文
[1]自溶鏈霉菌遺傳操作研究[J]. 楊本壽,尹敏,肖正群,徐麗華,姜成林,魯濤. 云南大學學報(自然科學版). 2010(06)
[2]放線菌769抑菌譜及液體培養(yǎng)生長曲線的測定[J]. 張紅丹,杜茜,張正坤,徐文靜,陳光,李啟云. 中國植保導刊. 2010(07)
[3]基因敲除與基因沉默[J]. 呂學詵,呂仁杰,呂超. 黑龍江醫(yī)藥科學. 2009(05)
[4]生防鏈霉菌Men-myco-93-63遺傳轉化體系的建立和優(yōu)化[J]. 沈鳳英,李亞寧,劉力強,吳偉剛,劉大群. 中國農(nóng)學通報. 2009(13)
[5]高效檢測分析玫瑰黃鏈霉菌Men-myco-93-63線性質粒[J]. 孫偉明,郭巍,劉大群. 微生物學報. 2008(12)
[6]人脂聯(lián)素原核表達載體PQE30/ADPN的構建及在大腸桿菌中的表達[J]. 史曉文,劉德敏,孫穎,張捷. 天津醫(yī)藥. 2008(11)
[7]鏈霉菌細胞色素P450研究進展[J]. 李梅,曾凡榮. 微生物學通報. 2008(07)
[8]鏈霉菌看家基因引物的設計與驗證[J]. 郭銀平,黃英. 微生物學報. 2007(06)
[9]大腸桿菌原核表達載體pSBET-His的構建[J]. 陳正斌,譚仲夏,秦西云. 安徽農(nóng)業(yè)科學. 2007(27)
[10]鏈霉菌質粒pSET152電轉化稀有放線菌小單孢菌的研究[J]. 李曉華,龍慈凡,周秀芬,鄧子新. 微生物學報. 2007(04)
碩士論文
[1]鏈霉菌分化負調節(jié)基因nsdA在抗生素高產(chǎn)育種上的應用[D]. 王茜.華中農(nóng)業(yè)大學 2004
本文編號:3188247
【文章來源】:河北農(nóng)業(yè)大學河北省
【文章頁數(shù)】:50 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
縮寫詞表
1 引言
1.1 玫瑰黃鏈霉菌研究進展
1.2 A-因子及其類似物
1.3 afsA 基因家族是 A-因子及其結構類似物生物合成途徑中的關鍵基因
1.4 基因功能研究方法—基因敲除與基因轉導技術
1.5 本研究的目的及意義
2 材料
2.1 菌株和質粒
2.2 PCR 引物
2.3 限制性內切酶與試劑盒
2.4 分子量標準
2.5 抗生素
2.6 培養(yǎng)基
2.7 緩沖液及試劑
2.8 常用儀器設備
3 方法
3.1 玫瑰黃鏈霉菌 Men-myco-93-63 的菌種保存
3.2 玫瑰黃鏈霉菌 Men-myco-93-63 孢子懸浮液的制備
3.3 堿裂解法鏈霉菌質粒提取[67,79]
3.4 srpA 基因的克隆及原核表達
3.4.1 srpA 基因特異引物的設計
3.4.2 srpA 的 PCR 擴增
3.4.3 srpA 基因原核重組表達載體的構建[70,79,80]
3.4.4 陽性克隆的篩選
3.4.5 srpA 基因序列的測定與分析
3.4.6 srpA 基因在 E. coli M15 中的誘導表達
3.4.7 SrpA 蛋白檢測
3.5 玫瑰黃鏈霉菌 Men-myco-93-63 srpA 基因的敲除
3.5.1 srpA 基因敲除載體的構建
3.5.2 鏈霉菌-大腸桿菌之間的接合轉移
3.5.3 突變菌株的篩選驗證
3.5.4 srpA 基因功能分析
4 結果與分析
4.1 srpA 基因的克隆及原核表達
4.1.1 目的基因 srpA 的克隆
4.1.2 srpA 基因的序列分析
4.1.3 重組表達載體 pQE30-srpA 的構建
4.1.4 srpA 基因在 E. coli 中的誘導表達與檢測
4.2 玫瑰黃鏈霉菌 Men-myco-93-63 srpA 基因的敲除
4.2.1 srpAF、srpAR 的克隆
4.2.2 tsr 基因克隆
4.2.3 srpA 敲除載體 pKC1139-srpAF-tsr-srpAR 的驗證
4.2.4 野生型及突變株玫瑰黃鏈霉菌 Men-myco-93-63 中 srpA 轉錄分析
4.2.5 srpA 缺失對鏈霉菌 Men-myco-93-63 液態(tài)培養(yǎng)條件下菌體生長的影響
4.2.6 srpA 缺失對鏈霉菌 Men-myco-93-63 菌落形態(tài)的影響
4.2.7 srpA 缺失對鏈霉菌 Men-myco-93-63 抗生素生產(chǎn)能力的影響
5 討論
6 結論
7 參考文獻
作者簡歷
致謝
在讀期間發(fā)表的學術論文:
【參考文獻】:
期刊論文
[1]自溶鏈霉菌遺傳操作研究[J]. 楊本壽,尹敏,肖正群,徐麗華,姜成林,魯濤. 云南大學學報(自然科學版). 2010(06)
[2]放線菌769抑菌譜及液體培養(yǎng)生長曲線的測定[J]. 張紅丹,杜茜,張正坤,徐文靜,陳光,李啟云. 中國植保導刊. 2010(07)
[3]基因敲除與基因沉默[J]. 呂學詵,呂仁杰,呂超. 黑龍江醫(yī)藥科學. 2009(05)
[4]生防鏈霉菌Men-myco-93-63遺傳轉化體系的建立和優(yōu)化[J]. 沈鳳英,李亞寧,劉力強,吳偉剛,劉大群. 中國農(nóng)學通報. 2009(13)
[5]高效檢測分析玫瑰黃鏈霉菌Men-myco-93-63線性質粒[J]. 孫偉明,郭巍,劉大群. 微生物學報. 2008(12)
[6]人脂聯(lián)素原核表達載體PQE30/ADPN的構建及在大腸桿菌中的表達[J]. 史曉文,劉德敏,孫穎,張捷. 天津醫(yī)藥. 2008(11)
[7]鏈霉菌細胞色素P450研究進展[J]. 李梅,曾凡榮. 微生物學通報. 2008(07)
[8]鏈霉菌看家基因引物的設計與驗證[J]. 郭銀平,黃英. 微生物學報. 2007(06)
[9]大腸桿菌原核表達載體pSBET-His的構建[J]. 陳正斌,譚仲夏,秦西云. 安徽農(nóng)業(yè)科學. 2007(27)
[10]鏈霉菌質粒pSET152電轉化稀有放線菌小單孢菌的研究[J]. 李曉華,龍慈凡,周秀芬,鄧子新. 微生物學報. 2007(04)
碩士論文
[1]鏈霉菌分化負調節(jié)基因nsdA在抗生素高產(chǎn)育種上的應用[D]. 王茜.華中農(nóng)業(yè)大學 2004
本文編號:3188247
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