線粒體基因組因?yàn)榭焖龠M(jìn)化、嚴(yán)格遵守母系遺傳等特點(diǎn)已廣泛應(yīng)用到遺傳結(jié)構(gòu)與系統(tǒng)分類的生物學(xué)研究,是研究真菌系統(tǒng)進(jìn)化與遺傳關(guān)系的有效工具。作為昆蟲(chóng)病原真菌中已有普遍應(yīng)用的綠僵菌屬真菌（Metarhizium）,其線粒體基因組數(shù)據(jù)尚不完整。為了進(jìn)一步完善綠僵菌屬線粒體基因組數(shù)據(jù),深入昆蟲(chóng)病原真菌遺傳與進(jìn)化的研究,本論文選取羅伯茨綠僵菌（Metarhizium robertsii）ARSEF 2575,采用PDA固體培養(yǎng)基培養(yǎng)、CTAB法提取總DNA,經(jīng)高通量測(cè)序、PCR擴(kuò)增、Sanger測(cè)序成功組裝其線粒體基因組并進(jìn)行注釋分析,結(jié)合在NCBI上已有的麥角菌科真菌的相關(guān)數(shù)據(jù),開(kāi)展比較線粒體基因組學(xué)比較,對(duì)17種肉座菌目真菌的14個(gè)常見(jiàn)的線粒體蛋白的氨基酸序列進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系的重建。結(jié)果如下:羅伯茨綠僵菌ARSEF 2575的完整線粒體基因組大小為24945 bp,包含14個(gè)常見(jiàn)蛋白編碼基因、2個(gè)核糖體RNA基因和25個(gè)轉(zhuǎn)運(yùn)RNA基因,蛋白編碼基因的種類和排列順序與已經(jīng)報(bào)道的麥角菌科真菌基本一致。此外,同多數(shù)真菌相似,羅伯茨綠僵菌線粒體基因組的蛋白編碼基因、tRNA基因以及核糖體RNA基因均有明顯... 

【文章來(lái)源】：山西大學(xué)山西省

【文章頁(yè)數(shù)】：54 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

Metarhiziumrobertsii線粒體基因組結(jié)構(gòu)圖

的菌種所聚集成的幾個(gè)分支則距離Metarhizium robertsii親緣關(guān)系較遠(yuǎn)，從整體上來(lái)看，該系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)與目前的分類系統(tǒng)基本符合一致。圖2-2 基于14個(gè)蛋白編碼基因構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)Figure 2-2 Phylogenetic tree based on 14 protein-coding genes.

Fig.3-3 Intergenic region of Clavicipitaceae mitogenome3.3.6 麥角菌科線粒體基因組的蛋白編碼基因以及內(nèi)含子的比較在麥角菌科真菌中，7個(gè)線粒體基因組中呈現(xiàn)比較明顯的差異（圖3-4），Metarhizium robertsii、Metarhizium anisopliae、Pochonia chlamydosporia、Paecilomyceshepiali之間的蛋白編碼基因大小比較類似，而Epichloe屬的3個(gè)菌種Epichloe festucae、Epichloe hybrid、Epichloe typhina的蛋白編碼基因區(qū)域則明顯較大。將7個(gè)菌種的14個(gè)蛋白編碼基因比較之后，我們發(fā)現(xiàn)在Epichloe屬的7個(gè)基因當(dāng)中有數(shù)量不等的內(nèi)含子（圖3-3）。Epichloe屬的3個(gè)菌種Epichloe festucae、Epichloe hybrid、Epichloe typhina中的內(nèi)含子在蛋白編碼基因中的位置與大小，內(nèi)含子數(shù)量從1-7不等，7個(gè)擁有內(nèi)含子的基因當(dāng)中，Epichloe typhina中的cox1基因是含有內(nèi)含子數(shù)量最多的基因，而Epichloefestucae、Epichloe hybrid、Epichloe typhina的nad1基因和Epichloe festucae、Epichloehybrid中的nad2基因是內(nèi)含子數(shù)量最少的基因。從總體上來(lái)看

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]線粒體的發(fā)現(xiàn)和起源假說(shuō)[J]. 劉銳.  生物學(xué)教學(xué). 2016(11)
[2]線粒體DNA在分子進(jìn)化研究中的應(yīng)用[J]. 陳星,沈永義,張亞平.  動(dòng)物學(xué)研究. 2012(06)
[3]植物線粒體結(jié)構(gòu)基因組研究進(jìn)展[J]. 蘇愛(ài)國(guó),李雙雙,王玉美,雷彬彬,劉國(guó)政,康定明,華金平.  中國(guó)農(nóng)業(yè)科技導(dǎo)報(bào). 2011(03)
[4]一株綠僵菌的分離、鑒定及其生物學(xué)特性的初步研究[J]. 嚴(yán)智燕,薛召東,曾糧斌,楊瑞林.  中國(guó)麻業(yè)科學(xué). 2011(02)
[5]綠僵菌的研究現(xiàn)狀及進(jìn)展[J]. 丁苗苗,于永浩,曾濤.  廣西農(nóng)業(yè)科學(xué). 2009(11)
[6]密碼子偏性的分析方法及相關(guān)研究進(jìn)展[J]. 吳憲明,吳松鋒,任大明,朱云平,賀福初.  遺傳. 2007(04)
[7]綠僵菌生物農(nóng)藥的研制與應(yīng)用[J]. 張禮生,張澤華,高松,農(nóng)向群.  中國(guó)生物防治. 2006(S1)
[8]綠僵菌對(duì)椰心葉甲的控制作用研究[J]. 丁福章,張澤華,張禮生,丁偉.  西南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2006(03)
[9]綠僵菌屬系統(tǒng)分類的研究進(jìn)展(綜述)[J]. 黃勃,樊美珍,李增智.  安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2002(02)
[10]不同結(jié)構(gòu)的蛋白編碼基因的密碼子偏性研究[J]. 顧萬(wàn)君,馬建民,周童,孫嘯,陸祖宏.  生物物理學(xué)報(bào). 2002(01)

博士論文
[1]芒果炭疽病菌抗藥性基因tub2的克隆及其轉(zhuǎn)化金龜子綠僵菌的初步研究[D]. 詹儒林.華南熱帶農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007

碩士論文
[1]線蟲(chóng)生防菌厚垣普可尼亞菌的基因組學(xué)研究[D]. 林潤(rùn)茂.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2014
[2]優(yōu)良綠僵菌菌株的篩選及應(yīng)用性研究[D]. 馬麗娟.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012



本文編號(hào)：3138027