發(fā)布時(shí)間：2021-03-10 22:28

　　中小學(xué)校園是具有人口密度大、微生物傳播和交流活躍等特點(diǎn)的特殊人居環(huán)境。校園微生物群落組成及其傳播是影響青少年健康微生物組形成和發(fā)育的重要因素。以某中學(xué)校園為研究對象,探究校園不同場所的微生物群落結(jié)構(gòu),力圖初步闡明校園微生物群落及其特征分布。采集教學(xué)樓扶手、實(shí)驗(yàn)樓扶手門和把手、體育館扶手、食堂門把手等人體最易接觸到的物體微生物樣品,采用Illumina HiSeq平臺對采集的樣品進(jìn)行細(xì)菌16S rRNA基因V4區(qū)高通量測序,分析各樣品的細(xì)菌群落特征。結(jié)果顯示,不同場所細(xì)菌群落存在著不同的特征組成。盡管各場所物體表面的微生物主要屬于變形菌門（Proteobacteria）,厚壁菌門（Firmicutes）和放線菌門（Actinobacteria）等的棲水菌屬（Enhydrobacter）,鏈球菌屬（Streptococcus）,葡萄球菌（Staphylococcus）等屬,但其相對豐度存在著顯著的差異。例如,從食堂樣品中檢測到的豐度較高的不動(dòng)桿菌屬（Acinetobacter）和氣球菌屬（Aerococcus）,在教學(xué)區(qū)域場所中未發(fā)現(xiàn)這兩類微生物。體育館樓梯扶手表面物種多樣性顯著高于其他場... 

【文章來源】：生物技術(shù)通報(bào). 2020,36(08)北大核心

【文章頁數(shù)】：8 頁

【部分圖文】：

各建筑物場所屬水平下Venn圖

根據(jù)物種預(yù)測信息，分析表明：體育館的物種豐富度最高（可觀測SV數(shù)為414），其次是實(shí)驗(yàn)樓（可觀測SV為255）和教學(xué)樓（可觀測SV為223），最后是食堂（可觀測SV為201）（圖1-B）。與此類似的是，體育館的Shannon指數(shù)也最高，其次是實(shí)驗(yàn)樓和教學(xué)樓，而食堂的Shannon指數(shù)也最低（圖1-A）。為什么體育館的物種豐富度最高而食堂的最低？究其原因，有如下幾種可能：（1）該學(xué)校只有一個(gè)體育館，到體育館上課的學(xué)生數(shù)量大于其他10個(gè)樣品對應(yīng)學(xué)生數(shù)量；（2）在體育館里的活動(dòng)中，人體運(yùn)動(dòng)代謝產(chǎn)生產(chǎn)生更多的汗液、皮脂等等，為微生物生長和繁殖提供了營養(yǎng)物質(zhì)條件。至于食堂中微生物相對豐度和多樣性指數(shù)較低的原因，可能要?dú)w功于食堂中經(jīng)常進(jìn)行消毒滅菌。依據(jù)上述SV的計(jì)算和預(yù)測，計(jì)算所有樣本基于SV的Unweighted-Unifrac距離和WeightedUnifrac距離，進(jìn)行主坐標(biāo)（PCoA）分析，以圖了解樣品微生物群落的聚類情況和群落結(jié)構(gòu)相似性。Weighted-Unifrac和Unweighted-Unifrac分析的區(qū)別在于Unweighted-Unifrac不考慮物種豐度。在PCoA圖中，如果樣本距離越接近，表示物種組成結(jié)構(gòu)越相似。結(jié)果顯示，各樣品按照場所用途的不同在第一、二坐標(biāo)上有明顯區(qū)分。從Weighted-Unifrac分析（圖2-A）和Unweighted-Unifrac分析（圖2-B）結(jié)果，可以看出：來自于不同場所的樣品微生物群落大體按照場所功能而聚類，例如食堂、實(shí)驗(yàn)樓、體育館、教室樓樣品中微生物群落基本各自聚在一起。進(jìn)一步利用PERMANOVA相似性分析，結(jié)果表明教學(xué)區(qū)域與食堂之間存在顯著差異，其中Weighted-Unifrac距離下P=0.017,Unweighted-Unifrac距離下P=0.006。

用Unweighted-Unifrac距離和Weighted-Unifrac距離計(jì)算的PCoA圖

【參考文獻(xiàn)】：
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本文編號：3075385