鹽地堿蓬根際土壤細菌群落結(jié)構(gòu)及其功能
發(fā)布時間:2021-03-06 22:01
鹽地堿蓬作為生物改良鹽堿地的理想材料,其根際土壤微生物對土壤改良發(fā)揮著重要作用。為了深入探索環(huán)渤海濱海鹽堿地堿蓬根際土壤細菌群落結(jié)構(gòu)組成及其功能,采用Illumina Misep高通量測序平臺對環(huán)渤海地區(qū)濱海鹽堿地鹽地堿蓬根際土壤和裸地土壤進行測序。從16個樣本中獲得有效序列734 792條, 4 285個OTUs,歸屬于41門、100綱、282目、400科、892屬、1 577種。鹽地堿蓬根際土壤細菌群落由變形菌門(Proteobacteria)、放線菌門(Actinobacteria)、綠彎曲門(Chloroflexi)、擬桿菌門(Bacteroidetes)、芽單胞菌門(Gemmatimonadetes)、酸桿菌門(Acidobacteria)、厚壁菌門(Firmicutes)、藍藻細菌門(Cyanobacteria)、髕骨細菌門(Patescibacteria、浮霉菌門(Planctomycetes)組成。Alpha多樣性計算結(jié)果表明,鹽地堿蓬根際土壤細菌群落結(jié)構(gòu)多樣性高并與裸地土壤間差異顯著;LEfSe(LDAEffectSize)分析發(fā)現(xiàn),鹽地堿蓬與裸地差異指示種明顯不同。...
【文章來源】:中國生態(tài)農(nóng)業(yè)學(xué)報(中英文). 2020,28(10)北大核心
【文章頁數(shù)】:12 頁
【部分圖文】:
濱海鹽地堿蓬根際土壤及裸地土壤細菌的稀釋曲線
通過上述分析判斷出鹽地堿蓬根際土壤與裸地土壤之間具有顯著差異。比較微生物群落差異的另一個主要目的是確定組間的顯著性差異物種,為此使用LEf Se分析,首先使用non-parametric factorial Kruskal-Wallis (KW) sum-rank test(非參數(shù)因子克魯斯卡爾-沃利斯秩和驗檢)檢測不同分組間豐度差異顯著的物種,并且判斷顯著差異物種是否趨于同一分類級別。其次,采用線性判別分析(LDA)來估算每個組分(物種)豐度對差異效果影響的大小。因此本研究從域到屬級對鹽地堿蓬根際土壤與裸地土壤進行LEf Se分析,檢測具有顯著豐度差異的特征,僅LDA得分值大于4的被展示(圖5)。鹽地堿蓬根際土壤中差異指示種為藍藻細菌門、酸桿菌門、甲型變形桿菌綱(Alphaproteobacteria)、產(chǎn)氧光合細菌綱、綠彎菌綱(Chloroflexia)、根瘤菌目(Rhizobiales)、念珠藻目、鞘脂單胞菌目(Sphingomonadales)、鞘脂單胞菌科(Sphingomonadaceae)、芽孢桿菌屬(Bacillus),而裸地土壤差異指示種包括丙型變形菌(從綱到屬)、外硫螺菌目、硫堿螺旋菌科(Thioalkalispiraceae)、巴紐爾斯菌Balneolaceae(從目到科)、甲型變形桿菌(從目到屬)、嗜硫鹽菌屬(Thiohalophilus)。以上物種均對鹽地堿蓬根際土壤和裸地土壤之間群落結(jié)構(gòu)組成的差異起到非常重要的影響。圖3 濱海鹽堿地鹽地堿蓬根際土壤(J)與裸地土壤(D)優(yōu)勢物種組成比例及其在樣本中的分布比例
濱海鹽堿地鹽地堿蓬根際土壤(J)與裸地土壤(D)優(yōu)勢物種組成比例及其在樣本中的分布比例
【參考文獻】:
期刊論文
[1]黃河三角洲鹽堿土根際微環(huán)境的微生物多樣性及理化性質(zhì)分析[J]. 趙嬌,謝慧君,張建. 環(huán)境科學(xué). 2020(03)
[2]鹽地堿蓬生長對濱海重鹽堿地的改土效應(yīng)[J]. 楊策,陳環(huán)宇,李勁松,田宇,封曉輝,劉小京,郭凱. 中國生態(tài)農(nóng)業(yè)學(xué)報(中英文). 2019(10)
[3]1961—2017年環(huán)渤海地區(qū)氣象干旱時空特征及致災(zāi)危險性評估[J]. 王曉利,張春艷,侯西勇. 生態(tài)學(xué)報. 2019(13)
[4]硒砂瓜連作對土壤真菌群落結(jié)構(gòu)的影響[J]. 馮翠娥,岳思君,簡阿妮,陳麗萍,郭洋,鄭蕊,蘇建宇. 中國生態(tài)農(nóng)業(yè)學(xué)報(中英文). 2019(04)
[5]芒草種植對土壤細菌群落結(jié)構(gòu)和功能的影響[J]. 段鵬飛,陳彥,張菲,韓輝,龐發(fā)虎,陳兆進,田偉. 應(yīng)用生態(tài)學(xué)報. 2019(06)
[6]翅堿蓬響應(yīng)高鹽脅迫的分子機制研究[J]. 謝欠影,曹晟陽,趙晨陽,伊凱,戴峰,秦會發(fā),秦玉雪,方蕾. 大連海洋大學(xué)學(xué)報. 2019(02)
[7]基于高通量測序研究草莓根際微生物群落結(jié)構(gòu)和多樣性[J]. 趙帆,趙密珍,王鈺,關(guān)玲,龐夫花. 土壤. 2019(01)
[8]銀北鹽漬化土壤中6種耐鹽植物根際細菌群落結(jié)構(gòu)及其多樣性[J]. 代金霞,田平雅,張瑩,蘇建宇. 生態(tài)學(xué)報. 2019(08)
[9]貴州茂蘭喀斯特森林不同小生境下土壤細菌群落特征[J]. 吳求生,龍健,廖洪凱,劉靈飛,李娟,吳勁楠,肖雄. 應(yīng)用生態(tài)學(xué)報. 2019(01)
[10]環(huán)渤海缺水區(qū)鹽堿地改良利用技術(shù)研究[J]. 劉小京. 中國生態(tài)農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2018(10)
博士論文
[1]神農(nóng)架森林土壤微生物沿海拔分布格局及形成機制[D]. 丁軍軍.清華大學(xué) 2016
碩士論文
[1]干濕交替和外加氮源對土壤碳氮轉(zhuǎn)化及微生物多樣性的影響[D]. 張傳更.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2018
[2]三七根際土壤細菌的群落結(jié)構(gòu)與功能研究[D]. 崔尹贍.昆明理工大學(xué) 2017
[3]山東省三處鹽場環(huán)境中嗜鹽菌多樣性調(diào)查及六株嗜鹽新菌的分類學(xué)研究[D]. 夏珺.山東大學(xué) 2016
本文編號:3067892
【文章來源】:中國生態(tài)農(nóng)業(yè)學(xué)報(中英文). 2020,28(10)北大核心
【文章頁數(shù)】:12 頁
【部分圖文】:
濱海鹽地堿蓬根際土壤及裸地土壤細菌的稀釋曲線
通過上述分析判斷出鹽地堿蓬根際土壤與裸地土壤之間具有顯著差異。比較微生物群落差異的另一個主要目的是確定組間的顯著性差異物種,為此使用LEf Se分析,首先使用non-parametric factorial Kruskal-Wallis (KW) sum-rank test(非參數(shù)因子克魯斯卡爾-沃利斯秩和驗檢)檢測不同分組間豐度差異顯著的物種,并且判斷顯著差異物種是否趨于同一分類級別。其次,采用線性判別分析(LDA)來估算每個組分(物種)豐度對差異效果影響的大小。因此本研究從域到屬級對鹽地堿蓬根際土壤與裸地土壤進行LEf Se分析,檢測具有顯著豐度差異的特征,僅LDA得分值大于4的被展示(圖5)。鹽地堿蓬根際土壤中差異指示種為藍藻細菌門、酸桿菌門、甲型變形桿菌綱(Alphaproteobacteria)、產(chǎn)氧光合細菌綱、綠彎菌綱(Chloroflexia)、根瘤菌目(Rhizobiales)、念珠藻目、鞘脂單胞菌目(Sphingomonadales)、鞘脂單胞菌科(Sphingomonadaceae)、芽孢桿菌屬(Bacillus),而裸地土壤差異指示種包括丙型變形菌(從綱到屬)、外硫螺菌目、硫堿螺旋菌科(Thioalkalispiraceae)、巴紐爾斯菌Balneolaceae(從目到科)、甲型變形桿菌(從目到屬)、嗜硫鹽菌屬(Thiohalophilus)。以上物種均對鹽地堿蓬根際土壤和裸地土壤之間群落結(jié)構(gòu)組成的差異起到非常重要的影響。圖3 濱海鹽堿地鹽地堿蓬根際土壤(J)與裸地土壤(D)優(yōu)勢物種組成比例及其在樣本中的分布比例
濱海鹽堿地鹽地堿蓬根際土壤(J)與裸地土壤(D)優(yōu)勢物種組成比例及其在樣本中的分布比例
【參考文獻】:
期刊論文
[1]黃河三角洲鹽堿土根際微環(huán)境的微生物多樣性及理化性質(zhì)分析[J]. 趙嬌,謝慧君,張建. 環(huán)境科學(xué). 2020(03)
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[3]1961—2017年環(huán)渤海地區(qū)氣象干旱時空特征及致災(zāi)危險性評估[J]. 王曉利,張春艷,侯西勇. 生態(tài)學(xué)報. 2019(13)
[4]硒砂瓜連作對土壤真菌群落結(jié)構(gòu)的影響[J]. 馮翠娥,岳思君,簡阿妮,陳麗萍,郭洋,鄭蕊,蘇建宇. 中國生態(tài)農(nóng)業(yè)學(xué)報(中英文). 2019(04)
[5]芒草種植對土壤細菌群落結(jié)構(gòu)和功能的影響[J]. 段鵬飛,陳彥,張菲,韓輝,龐發(fā)虎,陳兆進,田偉. 應(yīng)用生態(tài)學(xué)報. 2019(06)
[6]翅堿蓬響應(yīng)高鹽脅迫的分子機制研究[J]. 謝欠影,曹晟陽,趙晨陽,伊凱,戴峰,秦會發(fā),秦玉雪,方蕾. 大連海洋大學(xué)學(xué)報. 2019(02)
[7]基于高通量測序研究草莓根際微生物群落結(jié)構(gòu)和多樣性[J]. 趙帆,趙密珍,王鈺,關(guān)玲,龐夫花. 土壤. 2019(01)
[8]銀北鹽漬化土壤中6種耐鹽植物根際細菌群落結(jié)構(gòu)及其多樣性[J]. 代金霞,田平雅,張瑩,蘇建宇. 生態(tài)學(xué)報. 2019(08)
[9]貴州茂蘭喀斯特森林不同小生境下土壤細菌群落特征[J]. 吳求生,龍健,廖洪凱,劉靈飛,李娟,吳勁楠,肖雄. 應(yīng)用生態(tài)學(xué)報. 2019(01)
[10]環(huán)渤海缺水區(qū)鹽堿地改良利用技術(shù)研究[J]. 劉小京. 中國生態(tài)農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2018(10)
博士論文
[1]神農(nóng)架森林土壤微生物沿海拔分布格局及形成機制[D]. 丁軍軍.清華大學(xué) 2016
碩士論文
[1]干濕交替和外加氮源對土壤碳氮轉(zhuǎn)化及微生物多樣性的影響[D]. 張傳更.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2018
[2]三七根際土壤細菌的群落結(jié)構(gòu)與功能研究[D]. 崔尹贍.昆明理工大學(xué) 2017
[3]山東省三處鹽場環(huán)境中嗜鹽菌多樣性調(diào)查及六株嗜鹽新菌的分類學(xué)研究[D]. 夏珺.山東大學(xué) 2016
本文編號:3067892
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