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基于高通量測序的少孢節(jié)叢孢轉(zhuǎn)錄組分析

發(fā)布時間:2020-12-16 16:57
  少孢節(jié)叢孢是一種典型的食線蟲真菌,在無線蟲的環(huán)境條件下營腐生生活,但在受到線蟲誘導(dǎo)后,少孢節(jié)叢孢能夠形成三維粘性菌網(wǎng)捕食線蟲。形成捕食器官也是少孢節(jié)叢孢從腐生生活方式轉(zhuǎn)化為寄生生活方式的重要標(biāo)志。本研究利用線蟲提取液誘導(dǎo)少孢節(jié)叢孢,并選擇其形成捕食器官的三個關(guān)鍵時間節(jié)點(diǎn)進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組分析,這三個時間點(diǎn)包括0h、誘導(dǎo)前期10h以及誘導(dǎo)后期48h。通過對測序結(jié)果的系統(tǒng)生物學(xué)分析,研究少孢節(jié)叢孢在捕食器官形成過程中基因表達(dá)的變化,探索少孢節(jié)叢孢生活史轉(zhuǎn)化的表達(dá)調(diào)控機(jī)理。研究結(jié)果顯示,在0h到10h的誘導(dǎo)前期,共有941個基因表現(xiàn)出顯著的表達(dá)差異,其中表現(xiàn)為上調(diào)的基因數(shù)量是496個,表現(xiàn)為下調(diào)的基因數(shù)量為445個;在10h到48h的誘導(dǎo)后期,發(fā)生顯著性差異表達(dá)的基因數(shù)量為824個,其中有459個為上調(diào)基因,365個為下調(diào)基因;在0h到48h整個誘導(dǎo)過程中則有326個基因表現(xiàn)出了顯著性差異表達(dá)的現(xiàn)象,其中192個表現(xiàn)出上調(diào)的現(xiàn)象,134個則表現(xiàn)為下調(diào)。在這三種情況下都表現(xiàn)為上調(diào)的基因有17個,分別是:ao0300022、ao0300211、ao0301042、ao0301264、ao0302655、... 

【文章來源】:云南大學(xué)云南省 211工程院校

【文章頁數(shù)】:63 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

基于高通量測序的少孢節(jié)叢孢轉(zhuǎn)錄組分析


轉(zhuǎn)錄組測序流程

基于高通量測序的少孢節(jié)叢孢轉(zhuǎn)錄組分析


不同時間段下少孢節(jié)叢孢的形態(tài)學(xué)變化

基于高通量測序的少孢節(jié)叢孢轉(zhuǎn)錄組分析


三個時間段上調(diào)差異基因

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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本文編號:2920477

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