天堂国产午夜亚洲专区-少妇人妻综合久久蜜臀-国产成人户外露出视频在线-国产91传媒一区二区三区

中國菜蝽屬DNA條形碼和線粒體基因組學(xué)研究(半翅目:蝽科)

發(fā)布時(shí)間:2020-11-09 00:56
   菜蝽屬Eurydema隸屬于半翅目Hemiptera異翅亞目Heteroptera蝽科Pentatomidae,是一類重要的農(nóng)業(yè)害蟲,世界分布33種,其中我國分布13種。該屬昆蟲體中小型,長卵圓形,體色鮮艷、色斑多樣,種內(nèi)、種間均有表型變異。雖然已有一些學(xué)者采用不同的方法對菜蝽屬部分種進(jìn)行了研究,但是該屬昆蟲的分類界限和系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系仍存有爭議。近年來,隨著分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展,DNA條形碼作為有效的物種鑒定方法已經(jīng)廣泛應(yīng)用于多個(gè)生物類群,而線粒體基因組則是重建系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系和研究類群進(jìn)化歷史的有效工具。本文在廣泛采集分布于中國的菜蝽屬昆蟲的基礎(chǔ)上,對該屬做了一下兩方面的研究:第一,運(yùn)用遺傳距離(distance-based)和系統(tǒng)發(fā)育樹(tree-based)兩種方法對分布于中國的菜蝽屬9種、共計(jì)199頭樣本進(jìn)行了 DNA條形碼分析。主要結(jié)論如下:1、結(jié)合形態(tài)結(jié)構(gòu)和DNA條形碼結(jié)果,均支持疑難種Eurydemasp.為菜蝽屬中一新種一白腹萊蝽Eurydema leucoventera sp.nov.。E.leucoventera sp.nov.與菜蝽屬其他種之間的平均遺傳距離(7.4%)是其種內(nèi)遺傳距離(1.1%)的6.7倍。在NJ和BI系統(tǒng)發(fā)育樹結(jié)果中,E.leucoventera sp.nov.的不同單倍型聚為單獨(dú)一支,且與甘藍(lán)菜蝽形成姐妹群關(guān)系。另外,ABGD分析也支持將樣本劃分為9個(gè)分組,與形態(tài)種一一對應(yīng)。2、結(jié)合形態(tài)結(jié)構(gòu)和DNA條形碼結(jié)果,均支持將秦嶺菘蝽Bagrada qinlingensis Zheng,1982組合為秦嶺菜蝽Eurydema qinlingensis(Zheng,1982)comb.mov.。其與菘蝽屬錫箔菘蝽之間的遺傳距離為17.5%,遠(yuǎn)高于與菜蝽屬昆蟲的平均種間遺傳距離(11.7%)。在NJ和BI系統(tǒng)發(fā)育樹結(jié)果中,秦嶺菜蝽分支屬于菜蝽屬內(nèi)部,且與圓角菜蝽關(guān)系較近。3、遺傳距離和系統(tǒng)發(fā)育樹結(jié)果均支持菜蝽E.dominulus和藍(lán)菜蝽E.oleracea的表型變異屬于種內(nèi)變異范疇。菜蝽的不同體色、不同色斑類型之間的遺傳距離小于0.6%,且遠(yuǎn)小于菜蝽的最小種間遺傳距離5.1%;同樣地,藍(lán)菜蝽的兩種表型之間的遺傳距離為0.4%,也小于藍(lán)菜蝽的最小種間遺傳距離4.4%。在NJ和BI系統(tǒng)發(fā)育樹結(jié)果中,不同的表型變異不具有單系性。4、本研究證明COI基因在菜蝽屬的物種識(shí)別中有較高的準(zhǔn)確性。菜蝽屬內(nèi)各個(gè)種的最大種內(nèi)遺傳距離均小于最小種間遺傳距離,且物種鑒定成功率超過99%:同時(shí)基于COI基因的DNA條形碼成功輔助解決形態(tài)疑難種和表型變異問題。因此,雖然菜蝽屬內(nèi)遺傳距離存在微小的“barcoding overlap”,但是我們認(rèn)為COI基因可以作為該屬的DNA條形碼。第二,本研究測得6種萊蝽屬昆蟲(菜蝽 E.dominulus、印緬菜蝽 E.liturifera、新疆菜蝽 E.maracandica、藍(lán)菜蝽 E.oleracea、秦嶺菜蝽 E.qinlingensis和圓角菜蝽 E.ventralis)的線粒體基因組序列,并對序列進(jìn)行了比對和注釋。聯(lián)合已發(fā)表的橫紋菜蝽E.gebleri線粒體基因組序列,對菜蝽屬昆蟲進(jìn)行了比較線粒體基因組學(xué)分析,此外,采用支序系統(tǒng)學(xué)方法及化石記錄,結(jié)合已發(fā)表的異翅亞目昆蟲線粒體基因組序列對菜蝽屬的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系及分化時(shí)間進(jìn)行了評估。主要結(jié)果如下:1、菜蝽、印緬菜蝽、新疆菜蝽、藍(lán)菜蝽、秦嶺菜蝽和圓角菜蝽的線粒體基因組長度分別為 16752bp,15585bp,15391bp,15892bp,15820bp 和 15500bp。菜蝽屬昆蟲線粒體基因組序列均編碼37個(gè)基因(13個(gè)蛋白編碼基因,22個(gè)tRNA基因以及2個(gè)rRNA基因),且基因排列與其他異翅亞目昆蟲的線粒體基因組一致。22個(gè)tRNA二級結(jié)構(gòu)中,除trnS1和trnV缺DHU臂外,22個(gè)tRNA基因的二級結(jié)構(gòu)均為典型的三葉草結(jié)構(gòu)。2、菜蝽屬昆蟲線粒體基因組序列中,不同物種的編碼基因的長度變化不大,主要的差異為控制區(qū)長度的變化。通過比較發(fā)現(xiàn),菜蝽屬昆蟲線粒體基因組序列均具有明顯的AT偏向性且存在A偏斜和C偏斜。重疊區(qū)和間隔區(qū)的序列較保守,甚至完全相同。除ND4L、ND5和ND6外,其余蛋白編碼基因的起始密碼子均相同;除ND2、ND4和ND6外,其余蛋白編碼基因的終止密碼子均相同。3、采用不同數(shù)據(jù)集計(jì)算的菜蝽屬種間遺傳距離結(jié)果顯示,基于PCG數(shù)據(jù)集計(jì)算的遺傳距離值較大,其次是PCGRNA數(shù)據(jù)集(13PCG+22tRNA+2rRNA),基于tRNA計(jì)算的遺傳距離值最小。菜蝽屬昆蟲線粒體基因組的13個(gè)蛋白編碼基因的Ka與Ks的比值均小于1,說明菜蝽屬的蛋白編碼基因均受到純化選擇的作用。4、異翅亞目各次目的拓?fù)潢P(guān)系為(奇蝽次目+(黽蝽次目+(鞭蝽次目+(蝎蝽次目+(細(xì)蝽次目+(臭蟲次目+蝽次目))))))。在蝽次目分支中,(扁蝽總科+(蝽總科+(長蝽總科+(紅蝽總科+緣蝽總科))))。蝽總科分支的拓?fù)潢P(guān)系為(異蝽科+(龜蝽科+(土蝽科+(荔蝽科+兜蝽科)+蝽科)))。在蝽科菜蝽屬分支中,秦嶺菜蝽位于菜蝽屬分支的基部,(圓角菜蝽+(藍(lán)菜蝽+印緬菜蝽))形成分支1,(新疆菜蝽+(橫紋菜蝽和菜蝽))形成分支2。5、蝎蝽次目是異翅亞目中分化最早的類群,分化時(shí)間為246Ma(三疊紀(jì)中期)。菜蝽屬的分化開始于87Ma白堊紀(jì)晚期,屬內(nèi)物種多樣性的增加在古近紀(jì)和新近紀(jì)階段。分化時(shí)間依次為秦嶺菜蝽(古近紀(jì)古新世)、圓角菜蝽(古近紀(jì)漸新世)、新疆菜蝽(古近紀(jì)漸新世)、菜蝽-橫紋菜蝽(古近紀(jì)漸新世)和藍(lán)菜蝽和印緬菜蝽(新近紀(jì)中新世)。
【學(xué)位單位】:山西農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類】:S433.3
【部分圖文】:

試驗(yàn)所,信息,浸制標(biāo)本,無水乙醇


化試驗(yàn)室所積累的酒精浸制標(biāo)本,少量來自南開大學(xué)昆蟲研宄所的浸制標(biāo)本。所有標(biāo)本??均浸制于無水乙醇中,-2〇°C冰箱保存。??試驗(yàn)共選。玻埃愁^標(biāo)本(包括外群錫箔菘蝽4頭),涵蓋全國16個(gè)省市(見圖2.8)。??標(biāo)本采集地點(diǎn)、時(shí)間、及試驗(yàn)所需詳細(xì)信息見表2.1。試驗(yàn)標(biāo)本只選取同側(cè)三條足或胸??部肌肉進(jìn)行試驗(yàn),剩余部分作為證據(jù)標(biāo)本置于無水乙醇,保存于_2〇°C冰箱,以備查驗(yàn)。??Mr?w?i?*?luTml?I3*?*?n?<lrJ:?ISt'"?rf'ft'l??I?I?I?I?1?1???Lecend??-...?'??乙?A?£.?domimdus??f?c一、廣^一?飛.一、▲'了????E.?geb/eri????.^?'?^?1?'?-xJk?'"?v??命?r?>?夕?E.?maracanaica??、一^r:t;?、'?:.?。Т穑?E.?olcracea???,廣成義"-???£.?ventralis??4?,?^?E.?sp.??_?^?#?E.?liturifera??A?r^;??^???B.?qinlingensis??〇?5〇o?i.ooo?2.000?(£.?qinlingensis)??Kilometers????B.?stolata??圖2.1試驗(yàn)所用標(biāo)本采集地信息??Fig.?2.1?Map?of?China?with?sampling?localities.??2.1.1.2試驗(yàn)試劑??Tris.Cl?緩沖液(ImolL,PH8.0)、EDTA?(乙二胺四乙酸)(〇_5mol/L,PH8.0)、EB??(

疑難種,菜蝽,表型


暴1爨i??c?D??圖2.4藍(lán)菜蝽的2種表型.A.B)?I型的背面觀和腹面觀;C,D)丨1型的背面觀和腹面觀??Fig.?2.4?Two?phenotype?types?of?E.?oleracea.?A.B)?Dorsal?view?and?ventral?view?of?type?I;?C,D)?Dorsal??view?and?ventralview?of?type?II.?Scale?bars?=?1?mm.??ii?A?B??圖2.5疑難種的背面觀(A)和腹面觀(B)??Fig.?2.5?Dorsal?(A)?and?ventral?(B)?view?of?£?sp.?Scale?bars?=?1?mm.??36??

秦嶺,生殖囊,陽莖,側(cè)面觀


?0.625mm?0.625mm??圖2.6疑難種的生殖節(jié)解剖圖(A.生殖囊腹面觀;B.生殖囊背面觀;C.陽基側(cè)突側(cè)面觀;D.陽莖腹??面觀;E.陽莖側(cè)面觀)??Fig.?2.6?Photos?of?male?genitalia?of?E.?sp.?(A.?pygophoral?ventral?view;?B.?pygophoral?dorsal?view;?C.??paramere;?D.?aedeagus?ventral?view;?E.?aedeagus?lateral?view).??暴|暴|??摩,A?爾L?B??圖2.7秦嶺菘蝽背面觀(A)和腹面觀(B)??Fig.?2.7?Dorsal?(A)?and?ventral?(B)?view?of?Bagrada?qinlingensis.?Scale?bars?=?1?mm.??37??
【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前7條

1 趙婉清;趙清;張虎芳;;基于DNA條形碼對菜蝽屬內(nèi)疑難種的鑒定(半翅目:蝽科)[J];山西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2015年02期

2 葉朵朵;周善義;陳志林;陸春文;陳媛;;基于MTDNA序列的中國臭蟻亞科(膜翅目,蟻科)分子系統(tǒng)學(xué)研究(英文)[J];動(dòng)物分類學(xué)報(bào);2013年03期

3 張媛;郭曉華;劉廣純;張卓;;DNA條形碼在鞘翅目昆蟲分子系統(tǒng)學(xué)研究中的應(yīng)用[J];應(yīng)用昆蟲學(xué)報(bào);2011年02期

4 戴玉成;莊劍云;;中國菌物已知種數(shù)[J];菌物學(xué)報(bào);2010年05期

5 劉佳妮;桂富榮;李正躍;沈文武;;稻飛虱基因組DNA提取方法的比較[J];云南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào);2009年01期

6 成新躍,周紅章,張廣學(xué);分子生物學(xué)技術(shù)在昆蟲系統(tǒng)學(xué)研究中的應(yīng)用[J];動(dòng)物分類學(xué)報(bào);2000年02期

7 章士美,胡梅操;菜蝽研究初報(bào)[J];江西農(nóng)業(yè)科技;1984年07期


相關(guān)博士學(xué)位論文 前1條

1 姜培;異翅亞目昆蟲比較線粒體基因組學(xué)及系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系研究[D];中國農(nóng)業(yè)大學(xué);2017年



本文編號:2875629

資料下載
論文發(fā)表

本文鏈接:http://sikaile.net/kejilunwen/nykj/2875629.html


Copyright(c)文論論文網(wǎng)All Rights Reserved | 網(wǎng)站地圖 |

版權(quán)申明:資料由用戶d7dc5***提供,本站僅收錄摘要或目錄,作者需要?jiǎng)h除請E-mail郵箱bigeng88@qq.com