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粉蚧科昆蟲DNA條形碼鑒定技術(shù)及數(shù)據(jù)庫的建立

發(fā)布時間:2017-03-30 13:15

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【摘要】:粉蚧是一種體型微小的吸汁害蟲,隸屬蚧總科粉蚧科。因其適應(yīng)性及繁殖能力非常強,易對農(nóng)林區(qū)爆發(fā)成災(zāi),是我國高度警惕的有害生物。粉蚧隱蔽性強,給我國入境檢疫帶來極大困難,快速準確鑒定是粉蚧監(jiān)測與有效防控的基礎(chǔ),而目前粉蚧的傳統(tǒng)形態(tài)鑒定方法存在諸多弊端,所以尋找更加高效便捷的鑒定方法尤為緊迫。DNA條形碼技術(shù)是利用標準基因片段的序列差異對物種進行鑒定的方法。本研究基于線粒體COI基因利用DNA條形碼技術(shù),對538頭粉蚧樣本(含23屬52種)進行序列擴增,共獲得502條COI基因5’端和356條COI基因3’端序列。粉蚧COI基因5’端和3’端序列長度分別為649bp和820bp,堿基組成AT含量明顯高于GC含量。粉蚧科COI基因5’端種內(nèi)遺傳距離介于0.00%~8.03%,種間遺傳距離介于1.60%~22.89%;粉蚧科COI基因3’端種內(nèi)遺傳距離介于0.00%~9.50%,種間遺傳距離介于1.99%~24.39%。種內(nèi)與種間遺傳距離出現(xiàn)重疊現(xiàn)象。雙條拂粉蚧和美地綿粉蚧兩種粉蚧的不同地理種群分別出現(xiàn)明顯的遺傳分化,已達種的分化水平。采用鄰接法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹表明,除了雙條拂粉蚧和美地綿粉蚧,其余種均可形成單系,并聚為獨立分支。分別對粉蚧屬、綿粉蚧屬、臀紋粉蚧屬和灰粉蚧屬的COI基因構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,結(jié)果顯示COI基因能很好地區(qū)分粉蚧科主要屬的種類,同種粉蚧聚成一支,與形態(tài)鑒定結(jié)果基本一致,對于近緣種同樣具有很好的鑒定效果。本研究證明線粒體COI基因可作為DNA條形碼對粉蚧科昆蟲進行有效的物種鑒定,并且對粉蚧科昆蟲隱存種的發(fā)現(xiàn)有重要意義。對粉蚧進行系統(tǒng)分類并構(gòu)建DNA條形碼數(shù)據(jù)庫,為檢測預(yù)警和檢疫處理提供科學(xué)依據(jù),對豐富粉蚧類群的分類研究提供重要參考。
【關(guān)鍵詞】:粉蚧科 線粒體COI基因 分子鑒定
【學(xué)位授予單位】:華南農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:S433.3
【目錄】:
  • 摘要3-4
  • Abstract4-8
  • 1 前言8-14
  • 1.1 粉蚧概述8-9
  • 1.1.1 粉蚧生物學(xué)特性8
  • 1.1.2 粉蚧的危害8-9
  • 1.2 粉蚧的分類鑒定9-10
  • 1.3 DNA條形碼概述10-12
  • 1.3.1 DNA條形碼的提出10-11
  • 1.3.2 DNA條形碼數(shù)據(jù)庫11-12
  • 1.3.3 DNA條形碼在介殼蟲中的應(yīng)用12
  • 1.4 研究目的及意義12-13
  • 1.5 研究技術(shù)路線13-14
  • 2 材料與方法14-19
  • 2.1 實驗材料14
  • 2.2 主要儀器設(shè)備14
  • 2.3 主要試劑14-15
  • 2.4 研究方法15-19
  • 2.4.1 總DNA提取15-16
  • 2.4.2 目的片段擴增16-17
  • 2.4.3 序列處理及分析17-18
  • 2.4.4 數(shù)據(jù)庫的構(gòu)建18-19
  • 3 結(jié)果與分析19-52
  • 3.1 粉蚧科COI基因序列特征分析19-23
  • 3.1.1 序列特征21-22
  • 3.1.2 堿基組成22
  • 3.1.3 堿基替換22-23
  • 3.2 遺傳距離分析23-29
  • 3.3 系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建29-49
  • 3.3.1 粉蚧科系統(tǒng)發(fā)育樹29-37
  • 3.3.2 粉蚧屬系統(tǒng)發(fā)育樹37-40
  • 3.3.3 綿粉蚧屬系統(tǒng)發(fā)育樹40-43
  • 3.3.4 臀紋粉蚧屬系統(tǒng)發(fā)育樹43-46
  • 3.3.5 灰粉蚧屬系統(tǒng)發(fā)育樹46-49
  • 3.4 粉蚧DNA條形碼數(shù)據(jù)庫的構(gòu)建49-52
  • 3.4.1 粉蚧DNA條形碼數(shù)據(jù)庫構(gòu)建情況49-50
  • 3.4.2 粉蚧DNA條形碼數(shù)據(jù)庫的功能50-52
  • 4 結(jié)論與討論52-56
  • 4.1 結(jié)論52-53
  • 4.2 討論53-55
  • 4.3 展望55-56
  • 致謝56-57
  • 參考文獻57-63
  • 附錄63-75

【參考文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 黃標;鄧業(yè)余;鄭立權(quán);黎志文;吳軍亮;趙家流;文尚華;;新菠蘿灰粉蚧生物學(xué)特性與發(fā)生規(guī)律的研究[J];安徽農(nóng)業(yè)科學(xué);2015年29期

2 魏亦寒;鄭斯竹;蔡平;詹國輝;高淵;;分子生物學(xué)技術(shù)在蚧蟲分類鑒定中的應(yīng)用[J];環(huán)境昆蟲學(xué)報;2015年04期

3 楊耀華;;DNA條形碼技術(shù)的應(yīng)用進展[J];中國醫(yī)藥指南;2013年17期

4 徐浪;余道堅;焦懿;向才玉;陳志|

本文編號:277225


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