龍門山地震帶銀廠溝地區(qū)土壤細(xì)菌群落多樣性研究
發(fā)布時間:2020-07-09 06:08
【摘要】:近十年來,在龍門山地震帶周邊地區(qū)先后發(fā)生了汶川大地震(里氏8.0級)和蘆山地震(里氏7.0級),但鮮有關(guān)于地震災(zāi)區(qū)土壤微生物的報道,對于結(jié)合土壤理化性質(zhì)、植被多樣性和微生物群落多樣性探討三者之間的關(guān)系的研究也甚少,而就震后如何恢復(fù)脆弱的生境方面也少有涉及。因此,本研究采集了龍門山地震帶銀廠溝地區(qū)雜木林、竹林和松樹林三種植被類型的土壤為研究對象,采用DGGE電泳、高通量測序、BIOLOG ECO平板培養(yǎng)等方法分別研究了土壤細(xì)菌16S rRNA(V6~V8區(qū))群落遺傳多樣性、16S rRNA(V3~V4區(qū))群落遺傳多樣性和代謝功能多樣性,同時結(jié)合土壤理化性質(zhì)、所覆蓋的植被和多樣性指數(shù)深入探討了他們之間的聯(lián)系。DGGE測序結(jié)果表明,龍門山地震帶銀廠溝地區(qū)土壤中11個優(yōu)勢條帶(A~K)分別屬于根微桿菌屬(Rhizomicrobium)、鏈霉菌屬(Streptomyces)、鹽單胞菌屬(Halomonas)、Lelliottia、Bryobacter、Thiofaba、鹽單胞菌屬(Halomonas)、Labilithrix、Fimbriimonas、Paludibaculum和Candidatus Solibacter,這10個屬的細(xì)菌分屬于變形菌門(Proteobacteria)、酸桿菌門(Acidobacteria)、放線菌門(Actinobacteria)和裝甲菌門(Armatimonadetes)4個門分類水平上,其中該研究區(qū)土壤中變形菌門細(xì)菌含量最多。三種植被類型土壤細(xì)菌群落多樣性存在著差別,其中雜木林土壤的細(xì)菌群落多樣性最高,竹林次之,松樹林最低。高通量測序結(jié)果表明,該研究區(qū)土壤中的細(xì)菌分別可以歸屬到33個門、90個綱、132個目、153個科、151個屬和51個種,其中在門分類水平上變形菌門(Proteobacteria)、放線菌門(Actinobacteria)、酸桿菌門(Acidobacteria)和綠彎菌門(Chloroflexi)這4個門的細(xì)菌含量相對較多;在細(xì)菌群落多樣性方面三種植被類型呈現(xiàn)出差異性,總體趨勢為雜木林最高,竹林居中,松樹林最低;主要功能菌群的代謝特征預(yù)測發(fā)現(xiàn),在不同的代謝通路中三種植被類型的土壤其功能菌群相對豐度分布具有一定的差別。ECO平板培養(yǎng)結(jié)果表明,該研究區(qū)雜木林、竹林和松樹林的土壤細(xì)菌主要利用的碳源類型不同,分別是氨基酸類、酯類、醇類和胺類,碳水化合物類、氨基酸類、酯類和醇類,碳水化合物類、酯類、胺類和酸類;并且其代謝功能多樣性也存在著一定的差異,總體為松樹林最高,其次是竹林,雜木林最低。綜上研究結(jié)果表明,不同植被類型下其土壤細(xì)菌群落遺傳多樣性和碳源代謝特征都具有一定的差別,造成這一差別的原因是由于不同種類的植物其根系分泌物不同,并且土壤細(xì)菌的生理活動對土壤的肥力也會產(chǎn)生影響,兩者之間相互影響、相互作用,造成了不同的供試土壤在細(xì)菌種類、含量上有所差別,從而在細(xì)菌群落的遺傳多樣性和代謝功能多樣性方面體現(xiàn)出差異。因此,本研究為促進震后龍門山地震帶生態(tài)環(huán)境的修復(fù)提供了科學(xué)依據(jù),同時也為維持該研究區(qū)生態(tài)系統(tǒng)的可持續(xù)發(fā)展奠定了相關(guān)理論基礎(chǔ)。
【學(xué)位授予單位】:西華師范大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:S714
【圖文】:
第 1 章 前言術(shù)進行分析,以保證實驗結(jié)果的可信度。夏圍圍[113]等指出結(jié)合高通量測GE 技術(shù)能夠較為全面地反映土壤微生物群落多樣性。陳志芳[114]等結(jié)合磷和 ECO 平板培養(yǎng)技術(shù)研究了戴云山不同森林類型土壤微生物的特征。因計實驗方案的過程中應(yīng)該將幾種不同的科學(xué)研究方法相結(jié)合,取長補短理可信的實驗數(shù)據(jù)是很有必要的。 技術(shù)路線
第 3 章 土壤細(xì)菌 16S rRNA(V6 ~ V8 區(qū))群落多樣性研究,其中添加 25 μLMaster Mix (2X),上下游引物 (1 μM) 各 1 μL無菌水 21 μL,構(gòu)成 50 μL 的反應(yīng)體系,反應(yīng)條件見圖 3-2。P對所得的 PCR 產(chǎn)物進行電泳檢測,電泳條件同總 DNA 的檢測 PCR 產(chǎn)物放入-20 °C 冰箱保存,以供下一步 DGGE 電泳使用
第 3 章 土壤細(xì)菌 16S rRNA(V6 ~ V8 區(qū))群落多樣性研加 25 μLMaster Mix (2X),上下游引物 (1 μM) 21 μL,構(gòu)成 50 μL 的反應(yīng)體系,反應(yīng)條件見圖的 PCR 產(chǎn)物進行電泳檢測,電泳條件同總 DN物放入-20 °C 冰箱保存,以供下一步 DGGE 電圖 3-1 16S rRNA(V6 ~ V8 區(qū))PCR 擴增引物序列 PCR amplification primer sequence of 16S rRNA (V6
【學(xué)位授予單位】:西華師范大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:S714
【圖文】:
第 1 章 前言術(shù)進行分析,以保證實驗結(jié)果的可信度。夏圍圍[113]等指出結(jié)合高通量測GE 技術(shù)能夠較為全面地反映土壤微生物群落多樣性。陳志芳[114]等結(jié)合磷和 ECO 平板培養(yǎng)技術(shù)研究了戴云山不同森林類型土壤微生物的特征。因計實驗方案的過程中應(yīng)該將幾種不同的科學(xué)研究方法相結(jié)合,取長補短理可信的實驗數(shù)據(jù)是很有必要的。 技術(shù)路線
第 3 章 土壤細(xì)菌 16S rRNA(V6 ~ V8 區(qū))群落多樣性研究,其中添加 25 μLMaster Mix (2X),上下游引物 (1 μM) 各 1 μL無菌水 21 μL,構(gòu)成 50 μL 的反應(yīng)體系,反應(yīng)條件見圖 3-2。P對所得的 PCR 產(chǎn)物進行電泳檢測,電泳條件同總 DNA 的檢測 PCR 產(chǎn)物放入-20 °C 冰箱保存,以供下一步 DGGE 電泳使用
第 3 章 土壤細(xì)菌 16S rRNA(V6 ~ V8 區(qū))群落多樣性研加 25 μLMaster Mix (2X),上下游引物 (1 μM) 21 μL,構(gòu)成 50 μL 的反應(yīng)體系,反應(yīng)條件見圖的 PCR 產(chǎn)物進行電泳檢測,電泳條件同總 DN物放入-20 °C 冰箱保存,以供下一步 DGGE 電圖 3-1 16S rRNA(V6 ~ V8 區(qū))PCR 擴增引物序列 PCR amplification primer sequence of 16S rRNA (V6
【參考文獻(xiàn)】
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7 何苑v
本文編號:2747058
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