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致病相關(guān)因子BcNop53和BcSnf2調(diào)控灰葡萄孢菌生長發(fā)育及致病性機(jī)理研究

發(fā)布時(shí)間:2020-05-11 16:26
【摘要】:灰葡萄孢菌(Botrytis cinerea)是典型的死體營養(yǎng)型植物病原真菌,寄主范圍極其廣泛,能夠侵染1400多種植物,其引起的灰霉病對全球范圍的農(nóng)業(yè)生產(chǎn)造成嚴(yán)重危害,帶來巨大的經(jīng)濟(jì)損失。近年來,隨著全基因組序列的公開,灰葡萄孢菌致病的分子機(jī)理得到了廣泛研究,使得人們對灰葡萄孢菌與寄主互作過程的認(rèn)識(shí)不斷更新。盡管已鑒定出多個(gè)致病相關(guān)基因,但該菌的致病調(diào)控機(jī)制尚未被充分發(fā)掘。構(gòu)建突變體庫是挖掘新基因及進(jìn)行功能基因組學(xué)研究的有效途徑,本研究利用農(nóng)桿菌介導(dǎo)的遺傳轉(zhuǎn)化體系(ATMT),構(gòu)建了一個(gè)約含9000個(gè)轉(zhuǎn)化子的灰葡萄孢菌T-DNA插入轉(zhuǎn)化子群體,采用番茄和草莓兩種不同的寄主葉片進(jìn)行致病性篩選,經(jīng)三輪復(fù)篩從中獲得400多個(gè)致病力喪失或下降的突變體。通過熱不對稱交錯(cuò)PCR(TAIL-PCR)進(jìn)行側(cè)翼序列的克隆及分析確定T-DNA的整合部位,從T-DNA標(biāo)記的基因中選取了三個(gè)候選基因進(jìn)行后續(xù)研究,并分別命名為BcNOP53、BcRAB-6A及BcSNF2。為研究候選基因的生物學(xué)功能及作用機(jī)理,我們對其進(jìn)行了定向敲除及遺傳互補(bǔ),通過檢測基因敲除突變體ΔBcnop53、ΔBcrab-6a及ΔBcsnf2的致病力,進(jìn)一步確認(rèn)了候選基因BcNOP53和BcSNF2與T-DNA插入突變體致病表型的相關(guān)性,并對其在調(diào)控病原物發(fā)育和致病過程中的生物學(xué)功能和機(jī)制展開了系統(tǒng)的研究。核糖體是細(xì)胞內(nèi)負(fù)責(zé)蛋白質(zhì)生物合成的重要細(xì)胞器,然而目前對于核糖體如何調(diào)節(jié)微生物的致病過程知之甚少。本研究結(jié)果表明,BcNop53具有與酵母Nop53p類似的功能,是核糖體60S亞基成熟后期的作用因子,對病原菌的生長、致病發(fā)育及致病力至關(guān)重要。BcNop53定位于細(xì)胞核內(nèi),該蛋白在酵母突變體ΔScnop53中表達(dá)能夠完全恢復(fù)后者生長緩慢的缺陷;同樣,BcNOP53基因缺失導(dǎo)致灰葡萄孢菌生長速率減慢。研究還發(fā)現(xiàn),BcNOP53基因缺失導(dǎo)致灰葡萄孢菌致病力喪失且侵染結(jié)構(gòu)形成受阻與病原物中活性氧(ROS)產(chǎn)生減少有關(guān)。此外,BcNop53缺失降低了灰葡萄孢菌分生孢子產(chǎn)量及對逆境脅迫的適應(yīng),改變了分生孢子及菌核形態(tài),延緩分生孢子與菌核的萌發(fā),并降低了細(xì)胞壁降解酶的活性;然而,ΔBcnop53菌核數(shù)量顯著增加。將完整的BcNOP53基因?qū)毽cnop53能夠完全恢復(fù)上述表型缺陷。Snf2家族是一類依賴ATP的解旋酶類似(helicase-like)蛋白,能夠通過水解ATP獲得能量來改變?nèi)旧|(zhì)的結(jié)構(gòu),從而改變組蛋白與DNA之間的接觸,以便完成DNA復(fù)制、轉(zhuǎn)錄、重組或修復(fù)等生物學(xué)過程。通過生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn),BcSnf2是該家族中的一員,其在病原真菌中的生物學(xué)功能尚未見報(bào)道,本研究發(fā)現(xiàn),BcSnf2在灰葡萄孢菌發(fā)育及致病過程中具有重要的作用,可調(diào)節(jié)某些特定基因的轉(zhuǎn)錄水平,推測Bc Snf2可能通過調(diào)控某些致病因子的轉(zhuǎn)錄水平參與灰葡萄孢菌的致病過程。BcSNF2基因缺失導(dǎo)致灰葡萄孢菌致病力顯著減弱,同時(shí)導(dǎo)致灰葡萄孢菌生長速率下降、產(chǎn)孢量降低、孢子萌發(fā)遲緩、菌落與菌核的形態(tài)發(fā)生改變。利用轉(zhuǎn)錄組測序(RNA-seq)技術(shù)對ΔBcsnf2與野生型B05.10基因差異表達(dá)水平進(jìn)行了分析,在差異表達(dá)基因中,除與生長發(fā)育相關(guān)的基因外,還富集到一些參與致病過程的基因,其中包括已經(jīng)報(bào)導(dǎo)的灰葡萄孢菌致病因子,我們將在后續(xù)的研究中對BcSnf2及Snf2家族其他成員調(diào)控灰葡萄孢菌自身發(fā)育及其與寄主互作過程的機(jī)制進(jìn)行系統(tǒng)的分析。簡言之,本研究以灰葡萄孢菌為材料,構(gòu)建T-DNA插入突變體庫,從中鑒定出BcNOP53和BcSNF2兩個(gè)新穎的致病相關(guān)基因并對其進(jìn)行系統(tǒng)的生物學(xué)功能分析,闡釋了灰葡萄孢菌生長、致病發(fā)育和侵入寄主等有賴于BcNop53調(diào)控相關(guān)蛋白合成及內(nèi)源活性氧ROS產(chǎn)生的機(jī)制;同時(shí)解析了Snf2家族成員BcSnf2調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄,影響病原菌生長發(fā)育及致病的生物學(xué)功能。本研究為核糖體發(fā)生及依賴ATP的染色質(zhì)重塑復(fù)合物介導(dǎo)的表觀遺傳調(diào)控調(diào)節(jié)真菌致病過程的機(jī)制提供了新的見解,可能為解決真菌疾病開辟新的靶點(diǎn),為作物灰霉病綠色防控提供理論依據(jù)。
【圖文】:

灰葡萄孢菌,侵染循環(huán),再侵染,農(nóng)事


灰葡萄孢菌的侵染循環(huán)(Amselemetal.,2011)

插入位點(diǎn),轉(zhuǎn)化子,灰葡萄孢菌,基因組數(shù)據(jù)庫


Fig.2.8 The feature map of the gene BC1G_02571 in Botrytis cinerea5)轉(zhuǎn)化子 M7280該轉(zhuǎn)化子致病力喪失,接種草莓及番茄葉片后,無可見病斑出現(xiàn)。TAIL-PCR 獲得 259 bp T-DNA 片段,T-DNA 插入基因 BC1G_08709 與BC1G_08710 之間,該插入位點(diǎn)距離 BC1G_08709 起始密碼子 90 bp,距離BC1G_08710 起始密碼子 201 bp (圖 2.9)。 BC1G_08709 基因由 1366 個(gè)核苷酸組成,包含 2 個(gè)外顯子(圖 2.10),,編碼 437 個(gè)氨基酸的未知蛋白,包含一個(gè) NOP53結(jié)構(gòu)域;灰葡萄孢菌基因組數(shù)據(jù)庫序列信息顯示,BC1G_08710 基因序列全長為888 bp, 包含 3 個(gè)外顯子,編碼 207 個(gè)氨基酸的假定 GTP-binding 蛋白,包含結(jié)構(gòu)域 Rab6 和 Ras,NCBI 最新數(shù)據(jù)顯示 BC1G_08710 基因序列全長為 564 bp(圖2.11),本研究中 BC1G_08710 基因序列參考灰葡萄孢菌基因組數(shù)據(jù)庫中的序列信息。
【學(xué)位授予單位】:吉林大學(xué)
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:S432.44

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本文編號(hào):2658742

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