【摘要】：【目的】建立扶桑綿粉蚧Phenacoccus solenopsis Tinsley的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫,揭示扶桑綿粉蚧轉(zhuǎn)錄組的整體表達(dá)特征。【方法】采用Illumina Hi SeqTM40`00測序平臺(tái)開展對(duì)扶桑綿粉蚧雌成蟲轉(zhuǎn)錄組測定,對(duì)原始數(shù)據(jù)進(jìn)行過濾和組裝�！窘Y(jié)果】共獲得58 322 258條序列讀取片段(reads),共9.48 Gb(Gen Bank登錄號(hào):SAMN06130426)57 422 032條有效轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。進(jìn)一步組裝拼接后,共獲得94 475個(gè)單基因簇(unigene),平均長度為700 bp。將unigene與數(shù)據(jù)庫中的序列進(jìn)行BLASTX比對(duì),成功注釋20 949個(gè)unigenes,其中,Nr注釋的unigenes與豌豆蚜Acyrthosiphon pisum unigenes同源性最高,達(dá)18.69%。扶桑綿粉蚧轉(zhuǎn)錄組unigenes根據(jù)GO功能注釋大致可分為細(xì)胞組分、分子功能和生物過程三大類55個(gè)分支,與結(jié)合活性、催化活性、細(xì)胞進(jìn)程和代謝進(jìn)程相關(guān)的unigenes較多。此外,本研究還篩選到20條與脂類代謝相關(guān)的途徑和與性信息素代謝相關(guān)的序列。并通過與Nr和Swiss-prot蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫比對(duì),獲得了15 037條編碼序列(CDS)片段�！窘Y(jié)論】本研究初步闡明扶桑綿粉蚧雌成蟲轉(zhuǎn)錄組的整體表達(dá)模式,為進(jìn)一步研究扶桑綿粉蚧的基因功能及性信息素的代謝途徑奠定了基礎(chǔ)。
[Abstract]:[objective] to establish the transcriptional database of Phenacoccus solenopsis Tinsley and reveal the overall expression characteristics of the transcriptome. [methods] the Illumina Hi SeqTM40 `00 sequencing platform was used to detect the transcriptional structure of female adults. The original data were filtered and assembled. [results] A total of 58,322,258 (reads), sequences were obtained, which included 9.48 Gb (Gen Bank accession number: SAMN06130426) 57,422,032 effective transcriptional group data. The average length of (unigene), of 94,475 single gene clusters was 700 BP. The sequence of unigene was compared with the sequence in the database, and 20 949 unigenes were successfully annotated, among which the unigenes annotated by Nr had the highest homology with the Acyrthosiphon pisum unigenes of the pea aphid, reaching 18.69. According to go functional annotation, the transcription group unigenes can be divided into 55 branches, including cell component, molecular function and biological process. There are more unigenes related to binding activity, catalytic activity, cellular process and metabolic process. In addition, 20 pathways related to lipid metabolism and sequences related to sex pheromone metabolism were screened. By comparing with Nr and Swiss-prot protein database, 15 037 coding sequence (CDS) fragments were obtained. [conclusion] the whole expression pattern of the transcriptional group of female adult insects was preliminarily elucidated in this study. It lays a foundation for further study on gene function and metabolic pathway of sex pheromone.
【作者單位】： 廣州大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;廣東省生物資源與應(yīng)用研究所;
【基金】：廣州市屬高校科技計(jì)劃項(xiàng)目(1201430778) 2016年度廣州大學(xué)大學(xué)生創(chuàng)新訓(xùn)練項(xiàng)目(201611078064)
【分類號(hào)】：S433

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：2191169