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塔吉克斯坦哈特隆州土壤可培養(yǎng)細(xì)菌多樣性分析

發(fā)布時(shí)間:2018-07-04 22:24

  本文選題:塔吉克斯坦 + 純培養(yǎng)。 參考:《干旱區(qū)地理》2016年01期


【摘要】:采用純培養(yǎng)、結(jié)合核糖體DNA擴(kuò)增片段限制性酶切分析(16S r DNA PCR-RFLP)、RepPCR及16S r DNA序列測(cè)定和系統(tǒng)發(fā)育分析方法研究塔吉克斯坦哈特隆州土壤可培養(yǎng)細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)和種群多樣性。從哈特隆州的農(nóng)田、天然草地、林地及荒漠土壤中分離獲得110個(gè)菌株,分布在厚壁菌門(Firmicutes)(80.9%)、變形桿菌門(Proteobacteria)(17.2%)和放線菌門(Actinobacteria)(1.85%)三個(gè)類群中,歸屬于芽孢桿菌(Bacillus)、寡養(yǎng)單胞菌(Stenotrophomonas)、短桿菌(Brevibacterium)、節(jié)桿菌(Arthrobacter)、棍狀桿菌(Clavibacter)、短波單胞菌(Brevundimonas)、貪食菌(Variovorax)、假單胞桿菌(Pseudomonas)、芽孢八疊球菌(Sporosarcina)、賴氨酸芽孢桿菌(Lysinibacillus)、無(wú)色桿菌屬(Achromobacter)和Rheinheimera共12個(gè)屬中。其中Bacillus(71.8%)為該地區(qū)土壤可培養(yǎng)細(xì)菌絕對(duì)優(yōu)勢(shì)種群,Pseudomonas(10.9%)為次優(yōu)勢(shì)種群。對(duì)優(yōu)勢(shì)種群Bacillus的Rep-PCR基因組指紋圖分析表明,63株分離物有17種不同的多態(tài)性指紋圖譜,具有較為豐富的多樣性特征。不同樣地土壤中可培養(yǎng)細(xì)菌的種群分布、結(jié)構(gòu)組成及多樣性存在明顯差異,與土壤環(huán)境密切相關(guān)。Shannon多樣性指數(shù)、Simpson優(yōu)勢(shì)度和Pielou均勻度指數(shù)與土壤有機(jī)質(zhì)、全氮、堿解氮及含水量呈顯著正相關(guān)(p0.05)。土壤速效鉀含量也是顯著影響細(xì)菌Shannon多樣性、Simpson優(yōu)勢(shì)度的重要因素。研究不僅為后期功能菌株的篩選提供了基礎(chǔ),也為塔國(guó)不同土地利用方式下土壤環(huán)境評(píng)價(jià)提供了依據(jù)。
[Abstract]:The community structure and population diversity of culturable bacteria in the soil of Khatlon, Tajikistan, were studied by pure culture, restriction enzyme digestion analysis (16s r DNA PCR-RFLP) and sequencing of 16s r DNA sequence and phylogenetic analysis. 110 strains were isolated from farmland, natural grassland, woodland and desert soil in Hatteron. They were found in three groups: Firmicutes (80.9%), Proteobacteria (17.2%) and actinomycetes (1.85%). It belongs to Bacillus, Stenotrophomonas, Brevibacterium, Clavibacter, Brevundimonas, Variovorax, Pseudomonas, Sporosarcina, Lysinibacillus, (Achromobacter) and Rheimera. Among them, Bacillus (71.8%) is the subdominant population of soil culturable bacteria, Pseudomonas (10.9%). The genomic fingerprinting analysis of Bacillus showed that there were 17 different polymorphic fingerprints of the isolates of Bacillus, which had rich diversity characteristics. The population distribution, structural composition and diversity of culturable bacteria in different soils were significantly different. The Shannon diversity index Simpson dominance and Pielou evenness index were closely related to soil environment and soil organic matter and total nitrogen. There was a significant positive correlation between alkali hydrolyzed nitrogen and water content (p0.05). Soil available potassium content was also an important factor that significantly affected the dominance of Shannon diversity Simpson bacteria. The study not only provided the basis for screening of functional strains in the later stage, but also provided the basis for soil environmental assessment under different land use patterns in Tajikistan.
【作者單位】: 新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院;新疆自治區(qū)高校農(nóng)林有害生物監(jiān)測(cè)與安全防控重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;塔吉克斯坦農(nóng)業(yè)大學(xué);
【基金】:國(guó)家國(guó)際科技合作計(jì)劃資助(2010DFA92720-13) 溢達(dá)獎(jiǎng)學(xué)金資助
【分類號(hào)】:S154.3

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

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【相似文獻(xiàn)】

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10 肖慧;張艷;張U,

本文編號(hào):2097693


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