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粘綠木霉Gv29-8的碳水化合物活性酶類蛋白預測及遺傳關系分析

發(fā)布時間:2018-06-21 22:19

  本文選題:碳水化合物活性酶類蛋白 + 粘綠木霉; 參考:《華中農(nóng)業(yè)大學學報》2017年05期


【摘要】:利用CAT(CAZymes analysis toolkit)在線分析程序?qū)richoderma virens Gv29-8中碳水化合物活性酶類蛋白(carbohydrate-active enzymes,CAZymes)不同亞家族的分布情況進行分析,結果表明:粘綠木霉Gv29-8中含有185個CAZymes蛋白,分為主要類別和復合類別兩種類型;其中,主要類別含有71個GH蛋白、54個CBM蛋白及12個AA蛋白、25個CE蛋白、3個PL蛋白、3個GT蛋白;復合類型含有17個蛋白。遺傳關系分析表明,CAZymes分類應進一步細化到更小的類別。
[Abstract]:The distribution of carbohydrate active enzyme proteins in Trichoderma virens Gv29-8 was analyzed by cat (CAZymes analysis toolkit). The results showed that there were 185 CAZymes proteins in Trichoderma virens Gv29-8. There are 71 GH protein, 54 CBM protein and 12 AA protein, 25 CE protein, 3 PL protein and 3 GT protein in the main category and 17 protein in the complex type. The main category contains 71 GH protein, 54 CBM protein, 12 AA protein, 25 CE protein, 3 PL protein and 3 GT protein. Genetic analysis showed that the classification of CAZymes should be further refined to a smaller category.
【作者單位】: 西南林業(yè)大學林學院/云南省森林災害預警與控制重點實驗室;
【基金】:國家自然科學基金項目(31560211) 云南省森林災害預警與控制重點實驗室開放基金項目(ZK150004) 云南省林學一流學科建設項目(51600625)
【分類號】:S476.1

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