本文選題：解淀粉芽孢桿菌SQR + bacillomycin��； 參考：《南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)》2017年05期

【摘要】：[目的]植物促生細(xì)菌的根際生物膜形成過(guò)程是其功能發(fā)揮的關(guān)鍵因素,本研究利用轉(zhuǎn)錄組技術(shù)遴選參與這一過(guò)程的相關(guān)基因。[方法]利用轉(zhuǎn)錄組技術(shù)分析解淀粉芽孢桿菌SQR9的突變體SQR9M1和野生型SQR9生物膜形成24 h時(shí)基因的表達(dá)差異,并用定量Real-time PCR驗(yàn)證;通過(guò)電感耦合等離子質(zhì)譜(ICP-MS)的方法比較突變體SQR9M1和野生型SQR9的胞內(nèi)鐵離子濃度的差異;細(xì)胞培養(yǎng)板結(jié)合定量PCR監(jiān)測(cè)外源添加鐵離子后對(duì)突變體SQR9M1生物膜形成表型和相關(guān)基因表達(dá)的影響。[結(jié)果]突變體SQR9M1的生物膜形成能力在培養(yǎng)前期(24 h)顯著低于野生型SQR9。與野生型相比,突變體生物膜細(xì)胞中共有1 261個(gè)基因表達(dá)發(fā)生改變,其中574個(gè)基因上調(diào)(P0.01),687個(gè)基因下調(diào)(P0.01)。功能明確的變化基因約占全部差異基因數(shù)量的70%,變化最大的基因功能類群是無(wú)機(jī)離子轉(zhuǎn)運(yùn)和代謝。突變體SQR9M1的生物膜形成延遲現(xiàn)象與其鐵離子轉(zhuǎn)運(yùn)能力受損有關(guān),外源添加鐵離子能誘導(dǎo)野生型SQR9和突變體SQR9M1生物膜的形成和相關(guān)基因的表達(dá)。[結(jié)論]突變體SQR9M1鐵離子ABC轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白Fhu BGC、Feu ABC和Yfm CDEF相關(guān)基因顯著下調(diào),其胞內(nèi)鐵離子濃度在生長(zhǎng)前期顯著低于野生型,外源添加鐵離子后能恢復(fù)突變體的生物膜表型。
[Abstract]:[objective] the process of biofilm formation in rhizosphere of plant-promoting bacteria is the key factor for its function. In this study, transcriptome technique was used to select the genes involved in this process. [methods] the difference of gene expression between mutant SQR9M1 of Bacillus amylolyticus SQR9 and wild-type SQR9 biofilm at 24 h was analyzed by transcriptional technique and verified by quantitative Real-time PCR. Inductively coupled plasma mass spectrometry (ICP-MS) was used to compare the difference of intracellular iron concentration between the mutant SQR9M1 and the wild-type SQR9. Cell culture plates combined with quantitative PCR were used to detect the effects of exogenous iron ions on the biofilm formation phenotype and related gene expression of mutant SQR9M1. [results] the biofilm forming ability of mutant SQR9M1 was significantly lower than that of wild type SQR9 at 24 h. Compared with wild type, there were 1 261 gene expression changes in the mutant biofilm cells, of which 574 genes up-regulated the expression of P0.01G and 687 genes down-regulated P0.01G. About 70% of the total differentially expressed genes were functionally altered, and the most varied functional groups were inorganic ion transport and metabolism. The delayed biofilm formation of mutant SQR9M1 is related to the loss of its iron ion transport ability. Exogenous iron ions can induce the formation of wild type SQR9 and mutant SQR9M1 biofilm and the expression of related genes. [conclusion] the SQR9M1 iron ion ABC transporter Fhu BGCfFeu ABC and Yfm CDEF related genes were down-regulated, and the intracellular iron ion concentration was significantly lower in the early stage of growth than in the wild type. Exogenous iron ions could restore the biofilm phenotype of the mutant.
【作者單位】： 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)資源與環(huán)境科學(xué)學(xué)院/江蘇省固體有機(jī)廢棄物資源化高技術(shù)研究重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;江蘇省耕地質(zhì)量與農(nóng)業(yè)環(huán)境保護(hù)站;
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31501833) 江蘇省自然科學(xué)基金項(xiàng)目(20150658)
【分類號(hào)】：S182

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本文編號(hào)：1952814