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黃瓜根際芽孢桿菌親緣辨識特性研究

發(fā)布時(shí)間:2018-05-06 23:30

  本文選題:親緣辨識 + 群集運(yùn)動(dòng) ; 參考:《南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)》2017年06期


【摘要】:[目的]依據(jù)群集運(yùn)動(dòng)表型和16S rRNA基因序列信息研究黃瓜根際芽孢桿菌親緣辨識能力,進(jìn)而形成直接合作的多細(xì)胞行為,找到解淀粉芽孢桿菌SQR9的近親菌株。[方法]采用高溫處理和稀釋涂布的方法從黃瓜根際篩選芽孢桿菌,得到菌株后分析其16S rRNA基因測序結(jié)果,結(jié)合swarming平板對峙表型對芽孢桿菌類群進(jìn)行亞家族分類。最后通過24孔細(xì)胞培養(yǎng)板靜置培養(yǎng)、salkowski比色法分析吲哚乙酸(IAA)產(chǎn)量和植酸酶活性測定的方法評價(jià)SQR9近親菌株的促生潛力。[結(jié)果]初篩共選出118株芽孢桿菌,復(fù)篩后確定為21株。菌株swarming對峙后表現(xiàn)融合、半融合和對峙3種表型。在融合的27組菌株里,25組有100%相同的16S rRNA基因,而其余2組的基因相似度較低。產(chǎn)生邊界的組合中只有10%(142對中只有15對)的16S rRNA基因相似度大于99%;半融合的基因相似性為99.5%~100%。菌株SQR9的親近菌株P(guān)2、W-4和N-2在生物膜形成、IAA分泌和植酸酶活性等方面都接近SQR9。[結(jié)論]初步證明swarming表型與16S rRNA有一定的相關(guān)性,菌株SQR9近親菌株P(guān)2、W-4和N-2都是潛在的根際促生菌。
[Abstract]:[objective] to study the genetic identification ability of Bacillus rhizosphere in cucumber based on the cluster motion surface and 16s rRNA gene sequence information, and to form a direct cooperative multicellular behavior, and to find a close relative strain of Bacillus amylolyticus SQR9. [methods] Bacillus spp. Was screened from cucumber rhizosphere by high temperature treatment and dilution coating. The 16s rRNA gene sequencing results were analyzed, and the subfamily classification of Bacillus subfamily was carried out combined with the phenotype of swarming plate confrontation. Finally, the growth promotion potential of SQR9 indole-acetic acid (SQR9) indole-acetic acid (SQR9) indole-acetic acid (SQR9) indole-acetic acid was evaluated by the method of 24-well cell culture plate static culture with salkowski colorimetry. [results] 118 strains of Bacillus were selected and 21 strains were screened again. The strain swarming showed fusion, semi-fusion and confrontation phenotypes after confrontation. There were 100% identical 16s rRNA genes in 25 groups of fusion 27 strains, while the other two groups had lower gene similarity. The similarity of 16s rRNA gene in the combination of 10 pairs and 142 pairs is greater than that of 99%, while the similarity of semi-fusion gene is 99.5%. The close strains P2OW-4 and N-2 of strain SQR9 were close to SQR9 in the production of biofilm and the activity of phytase. [conclusion] the phenotype of swarming was correlated with 16s rRNA, and P2CW-4 and N-2 were both potential rhizosphere growth-promoting bacteria.
【作者單位】: 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)資源與環(huán)境科學(xué)學(xué)院/江蘇省固體有機(jī)廢棄物資源化高技術(shù)研究重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;江蘇省耕地質(zhì)量與農(nóng)業(yè)環(huán)境保護(hù)站;
【基金】:國家自然科學(xué)基金青年基金項(xiàng)目(31501833) 江蘇省自然科學(xué)基因青年基金項(xiàng)目(BK20150658) 江蘇高校品牌專業(yè)建設(shè)工程資助項(xiàng)目(PPZY2015A061)
【分類號】:S154.3;S642.2

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