禾谷炭疽菌效應(yīng)分子motif序列研究
本文選題:禾谷炭疽菌 + 效應(yīng)分子 ; 參考:《科學(xué)技術(shù)與工程》2016年18期
【摘要】:禾谷炭疽菌侵染玉米、小麥等糧食作物而引起的炭疽病,給各國(guó)農(nóng)業(yè)生產(chǎn)造成了巨大經(jīng)濟(jì)損失。植物病原菌可以利用效應(yīng)分子來操控寄主植物的防衛(wèi)反應(yīng),從而實(shí)現(xiàn)其對(duì)植物的侵染、定殖和擴(kuò)展等過程。研究基于前人對(duì)禾谷炭疽菌中已報(bào)道的177個(gè)候選效應(yīng)分子(CE)的氨基酸數(shù)據(jù),利用MEME對(duì)全部CE和不同氨基酸類別的CE進(jìn)行在線motif分析,未獲得較滿意結(jié)果。隨后,結(jié)合已報(bào)道效應(yīng)分子(E)所具有保守motif的氨基酸位置范圍,對(duì)82個(gè)具有典型特征E的信號(hào)肽序列后30~60 aa進(jìn)行獲取,并將信號(hào)肽位置大于28、氨基酸數(shù)量較小的E進(jìn)行剔除,最終明確64個(gè)E存在著保守的PAAX motif。該研究豐富了真菌保守motif的類型,為進(jìn)一步開展禾谷炭疽菌效應(yīng)分子的motif功能研究提供重要的理論指導(dǎo)。
[Abstract]:Anthracnose caused by anthracnose of cereal crops such as corn, wheat and so on has caused huge economic losses to agricultural production in various countries. Plant pathogens can use effector molecules to control host plant defense response, and thus to achieve its infection, colonization and expansion of plants. Based on the amino acid data of 177 candidate effector molecules (CEs) reported by previous researchers, MEME was used to analyze all CE and CE of different amino acids on line. The results were not satisfactory. Then, according to the amino acid position range of conserved motif, 82 signal peptide sequences with typical characteristic E were obtained. The signal peptide position was more than 28 and the number of amino acids was small. Finally, it was clear that 64 E had conservative PAAX motif. This study enriches the types of conserved motif of fungi and provides important theoretical guidance for the further study of the motif function of the effector molecules of A. graminearum.
【作者單位】: 西南林業(yè)大學(xué)林學(xué)院云南省森林災(zāi)害預(yù)警與控制重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;廊坊市文安縣農(nóng)業(yè)局;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(項(xiàng)31560211) 云南省森林災(zāi)害預(yù)警與控制重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室開放基金項(xiàng)目(項(xiàng)ZK150004) 云南省優(yōu)勢(shì)特色重點(diǎn)學(xué)科生物學(xué)一級(jí)學(xué)科建設(shè)項(xiàng)目(50097505) 云南省高校林下生物資源保護(hù)及利用科技創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)(2014015) 云南省教育廳科學(xué)研究基金項(xiàng)目(2014Y330)資助
【分類號(hào)】:S432.4
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,本文編號(hào):1775724
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