本文關(guān)鍵詞： 堆肥化 GH家族基因 PCR-DGGE 冗余分析 蒙特卡羅置換檢驗(yàn)　出處：《環(huán)境科學(xué)》2017年11期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：采用PCR-DGGE技術(shù),研究農(nóng)業(yè)廢物稻草堆肥化過程中參與纖維素降解的糖苷水解酶GH6家族基因的變化,并使用冗余分析(redundancy analysis,RDA)和蒙特卡羅置換檢驗(yàn)(Monte Carlo permutation test)研究了生物信息矩陣與環(huán)境因子矩陣間的相關(guān)性.結(jié)果表明,8個(gè)理化參數(shù)對(duì)GH6家族基因變化影響的相對(duì)大小為:p H堆體溫度TN(total nitrogen)TOM(total organic matters)C/N(TOC/TN)含水率環(huán)境溫度WSC(water soluble carbon),8個(gè)理化參數(shù)共解釋了83.1%的GH6家族基因變化,對(duì)GH6家族基因變化有重要影響,其中pH(P=0.002)、堆體溫度(P=0.004)和TN(P=0.004)是影響GH6家族基因變化的顯著因子,三者分別解釋了24.92%、15.57%和15.04%的GH6家族基因變化.含GH6家族基因的優(yōu)勢菌種在堆體不同時(shí)期有所不同.GH6家族基因的多樣性和豐度隨堆肥化進(jìn)程整體呈現(xiàn)出波動(dòng)趨勢.基于冗余分析的t-value分析表明3個(gè)顯著因子對(duì)GH6家族基因的動(dòng)態(tài)變化具有不同的正負(fù)相關(guān)性.
[Abstract]:PCR-DGGE technique was used to study the changes of glycoside hydrolase (GH6) family genes involved in cellulose degradation during rice straw composting. The correlation between biologic information matrix and environmental factor matrix was studied by using redundancy analysis and Monte Carlo permutation test (Monte Carlo Carlo permutation test). The results showed that the effects of eight physical and chemical parameters on GH6 family genes were as follows: 1. TN(total nitrogen)TOM(total organic matters (C / NTOC / TNN) water content environmental temperature WSC(water soluble carbon.Eighteen physicochemical parameters explain the changes of GH6 family genes in 83.1%. The gene changes of GH6 family were significantly affected by P0. 002, P0. 004) and P0. 004). The variation of GH6 family genes in 24.92% and 15.04%% was explained respectively. The diversity and abundance of GH6 family genes in dominant strains containing GH6 family genes were different at different stages of the heap. The diversity and abundance of GH6 family genes fluctuated with the composting process as a whole. T-value analysis of redundancy analysis showed that three significant factors had different positive and negative correlations to the dynamic changes of GH6 family genes.
【作者單位】： 湖南大學(xué)環(huán)境科學(xué)與工程學(xué)院;環(huán)境生物與控制教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室(湖南大學(xué));湖南城市學(xué)院市政與測繪工程學(xué)院;湖南省林業(yè)科學(xué)院生物環(huán)境工程研究所;
【基金】：國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(51378190,51521006,51578222,51579094) 湖南省自然科學(xué)基金項(xiàng)目(13JJB002) 湖南省科技廳重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目(2016SK2045) 湖南省教育廳創(chuàng)新平臺(tái)開放基金項(xiàng)目(17K019)
【分類號(hào)】：S141.4

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本文編號(hào)：1526686