基于宏基因組學(xué)16S rDNA測序?qū)煵莞H土壤細(xì)菌群落組成分析
本文關(guān)鍵詞: 煙草 根際土壤 細(xì)菌 宏基因組學(xué) 冗余度分析 出處:《中國農(nóng)業(yè)科技導(dǎo)報(bào)》2017年02期 論文類型:期刊論文
【摘要】:為了研究煙草根際土壤細(xì)菌多樣性,了解其細(xì)菌群落的組成和結(jié)構(gòu),從而為健康植煙土壤生態(tài)系統(tǒng)的構(gòu)建和保持提供理論依據(jù)和指導(dǎo)。以2014年四川涼山州健康煙株現(xiàn)蕾期根際土壤為研究樣本,利用Illumina平臺(tái)Miseq高通量測序技術(shù)對煙草根際土壤細(xì)菌16S rDNA進(jìn)行高通量測序分析。結(jié)果表明:煙草根際土壤微生物多樣性水平較高,不同樣品間主要菌落分布結(jié)構(gòu)相對穩(wěn)定。在門分類水平上,共檢測分類25個(gè)菌門,其中變形菌門占有明顯優(yōu)勢(39.04%~53.71%),其次為擬桿菌門、酸桿菌門、疣微菌門;在屬分類水平上,共檢測分類576類菌屬,鞘脂單胞菌屬、Flavisolibacter、Ohtaekwangia為煙草根際土壤細(xì)菌明顯優(yōu)勢菌屬。大部分主要菌群之間存在明顯正相關(guān)關(guān)系,對煙草根際土壤細(xì)菌影響較大的環(huán)境因子為土壤速效氮、含水量和pH。運(yùn)用宏基因組學(xué)16S rDNA測序技術(shù)獲取的煙草根際土壤細(xì)菌信息較為豐富,為健康植煙土壤機(jī)制研究提供新的理論參考。
[Abstract]:In order to study bacterial diversity in tobacco rhizosphere soil and understand the composition and structure of bacterial community, So as to provide theoretical basis and guidance for the construction and maintenance of healthy tobacco planting soil ecosystem. In 2014, the rhizosphere soil of healthy tobacco plants in Liangshan Prefecture, Sichuan Province, was taken as the research sample. The high throughput sequencing analysis of tobacco rhizosphere bacteria 16s rDNA was carried out by using Miseq high-throughput sequencing technique based on Illumina platform. The results showed that the microbial diversity of tobacco rhizosphere soil was higher than that of tobacco rhizosphere soil. The distribution structure of the main colonies was relatively stable among different samples. At the level of phyla, 25 phylum were detected, among which Proteus had a significant advantage in 53.71G, followed by Bacteroides, acidomycetes, Microphylum verruca, and at the taxonomic level. A total of 576 species of bacteria were classified, and the genus Flavisolibacter Ohtaekwangia was the dominant genus of bacteria in tobacco rhizosphere soil. There was a significant positive correlation between most of the major bacterial groups, and the most important environmental factor affecting bacteria in rhizosphere of tobacco was soil available nitrogen. The microbial information of rhizosphere soil obtained by macrogenomics 16s rDNA sequencing technique is abundant, which provides a new theoretical reference for the study of soil mechanism of healthy tobacco planting.
【作者單位】: 河南農(nóng)業(yè)大學(xué)煙草學(xué)院;江西省煙草公司撫州市公司;
【基金】:河南省煙草公司資助項(xiàng)目(HYKJ201301)資助
【分類號(hào)】:S154.3;S572
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,本文編號(hào):1517844
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