本文關(guān)鍵詞：基于全基因組測序的粘綠木霉Gv29-8中分泌蛋白預(yù)測　出處：《河南師范大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版)》2016年06期 　論文類型：期刊論文

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【摘要】：粘綠木霉Gv29-8作為木霉屬中重要的生防菌之一,對該菌分泌蛋白進行預(yù)測及其特征進行明確具有重要的理論意義。利用SignalP、ProtComp等預(yù)測程序?qū)υ摼?2427條蛋白質(zhì)序列進行分泌蛋白找尋,并對上述分泌蛋白的氨基酸分布、信號肽長度大小及切割位點等性質(zhì)進行分析。粘綠木霉含有分泌蛋白為377個,其氨基酸長度、信號肽長度與植物病原菌不同;信號肽切割位點屬于A-X-A類型,與其他已經(jīng)報道的植物病原真菌、卵菌中分泌蛋白信號肽切割位點一致。
[Abstract]:As one of the important biocontrol Trichoderma in green Trichoderma Gv29-8, the bacteria secrete protein clearly has important theoretical significance for predicting their characteristics. By using SignalP, ProtComp prediction program for 12427 protein sequences of the bacteria for protein secretion and distribution of the search, secretory protein amino acid signal peptide the size of the length and cutting site properties were analyzed. Green Trichoderma containing secretory protein of 377 amino acid, its length, length of signal peptide and plant pathogens; signal peptide cleavage site belongs to the type of A-X-A, and other plant pathogenic fungi has been reported, oomycetes in secretory protein signal peptide cleavage site.

【作者單位】： 西南林業(yè)大學(xué)林學(xué)院;云南省森林災(zāi)害預(yù)警與控制重點實驗室;
【基金】：國家自然科學(xué)基金項目(31560211) 云南省森林災(zāi)害預(yù)警與控制重點實驗室開放基金項目(ZK150004) 云南省林學(xué)一流學(xué)科建設(shè)項目(51600625) 云南省優(yōu)勢特色重點學(xué)科生物學(xué)一級學(xué)科建設(shè)項目(50097505) 云南省高校林下生物資源保護及利用科技創(chuàng)新團隊(2014015)
【分類號】：S476.1
【正文快照】： 一般而言,真菌的分泌蛋白具有N-端含有信號肽、無跨膜結(jié)構(gòu)域、無GPI錨定位點、不具有將蛋白輸送至線粒體或其他胞內(nèi)細胞器的預(yù)測定位信號等四個基本特征[1].目前,學(xué)術(shù)界對于化學(xué)藥劑的替代品生防菌的研究逐年增加,主要涉及木霉屬(Trichoderma ssp.)、芽孢桿菌屬(Bacillus spp.，

本文編號：1382656