中國土壤微生物多樣性監(jiān)測的現(xiàn)狀和思考
本文關鍵詞:中國土壤微生物多樣性監(jiān)測的現(xiàn)狀和思考
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【摘要】:土壤微生物多樣性研究是整個生態(tài)系統(tǒng)研究中最薄弱的環(huán)節(jié)之一。高通量測序技術和生物信息學方法的快速發(fā)展極大地促進了土壤微生物多樣性監(jiān)測研究的深度和廣度。目前世界范圍內(nèi)已經(jīng)開展了一些綜合的微生物多樣性研究計劃,如地球微生物計劃。這些計劃存在的主要問題是缺少動態(tài)的監(jiān)測、研究方法不統(tǒng)一、數(shù)據(jù)整合困難等。中國土壤微生物多樣性監(jiān)測網(wǎng)(Soil Microbial Observation Network,SMON)是中國生物多樣性監(jiān)測與研究網(wǎng)絡(Chinese Biodiversity Monitoring and Research Network,Sino BON)的重要組成部分,本文中我們對該監(jiān)測網(wǎng)的建設提出了一些思考。在監(jiān)測布局上建議選擇我國南北水熱梯度下的森林生態(tài)系統(tǒng)、東西降雨梯度下的草原生態(tài)系統(tǒng)、典型濕地生態(tài)系統(tǒng)及重要農(nóng)田生態(tài)系統(tǒng),同時依托現(xiàn)已建成的生物多樣性監(jiān)測網(wǎng)絡觀測點或大樣地,布設監(jiān)測樣點,利用現(xiàn)代環(huán)境基因組學和生物信息學技術,重點圍繞土壤微生物群落和功能基因組的組成與多樣性,開展長期定點的動態(tài)監(jiān)測。監(jiān)測的結果將以名錄、數(shù)據(jù)集或圖鑒的形式發(fā)布,包括中國典型生態(tài)系統(tǒng)中土壤細菌、古菌、真菌與地衣、土壤宏基因組和重要功能基因的組成和多樣性等數(shù)據(jù),同時建設土壤生物大數(shù)據(jù)平臺,達到監(jiān)測數(shù)據(jù)的儲存、查詢、分析、下載、成圖的功能。通過土壤微生物多樣性監(jiān)測,將闡明我國重要森林、草地、濕地、農(nóng)田生態(tài)系統(tǒng)中土壤微生物組成、多樣性、功能基因的時空變化特征和驅動機制,建立土壤微生物多樣性變化與生態(tài)系統(tǒng)功能的關系及相關的模型,預測全球環(huán)境條件變化下土壤微生物的演變規(guī)律,為土壤微生物多樣性資源的保護和利用提供科學依據(jù)。
【作者單位】: 中國科學院成都生物研究所環(huán)境與應用重點實驗室環(huán)境微生物四川省重點實驗室;中國科學院微生物研究所真菌學國家重點實驗室;
【基金】:國家自然科學基金(41371268,31400458) 中國生物多樣性監(jiān)測與研究網(wǎng)絡(Sino BON) 中國科學院科學數(shù)據(jù)庫項目(XXH12504-3-18)
【分類號】:S154.3
【正文快照】: in the format of database,annals,and illustrated handbooks.Key methods used in the SMON are high-throughput sequencing,metagenomics,and bioinformatics.A soil biota database is currently beingconstructed to store observational data for public inquiry and
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,本文編號:1302097
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