本文關(guān)鍵詞：馬鈴薯青枯菌Po82菌株質(zhì)�；蚪M分泌蛋白信號肽的分析

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【摘要】：應(yīng)用計算機(jī)技術(shù)和生物信息學(xué)的方法,采用Signal P4.0、Lipo P1.0、Target P1.0.1、TMHMM2.0蛋白質(zhì)分析軟件對植物病原細(xì)菌Ralstonia solanacearum Po82質(zhì)�；蚪M的1680個ORFs編碼的分泌蛋白信號肽氨基酸序列進(jìn)行預(yù)測分析。結(jié)果表明,質(zhì)�；蚪M的1680個ORFs中有102個ORFs所編碼的蛋白質(zhì)具有N-端信號肽序列,包括85個Ⅰ型信號肽,1個Ⅱ型信號肽,15個Prepilin-like信號肽和1個細(xì)菌素和信息素信號肽,所有的分泌蛋白中具有RR-motif信號肽結(jié)構(gòu)的有14個,且均為Ⅰ型信號肽。在102個具有可切割信號肽的分泌蛋白中,有50.98%的蛋白質(zhì)為胞外分泌型(S型),33.33%為線粒體分泌型(M型),6.87%為葉綠體分泌型(C型),8.82%為其他類型的分泌蛋白。信號肽切割位點的氨基酸組成中非極性氨基酸為53.27%,極性氨基酸為18.79%,帶負(fù)電荷的酸性氨基酸為19.12%,帶正電荷的堿性氨基酸為8.82%。比較R.solanacearum GMI1000和R.solanacearum Po82質(zhì)�；蚪M信號肽類型的區(qū)別,發(fā)現(xiàn)這2種菌在信號肽類型上存在很大差異。文章通過對R.solanacearum Po82質(zhì)�；蚪M信號肽分泌蛋白的研究,揭示了該病原菌與寄主互作的致病機(jī)制在長期進(jìn)化中的獨特地位。
【作者單位】： 農(nóng)業(yè)生物多樣性與病蟲害控制教育部重點實驗室;云南生物資源保護(hù)與利用國家重點實驗室;
【基金】：公益性行業(yè)(農(nóng)業(yè))科研專項經(jīng)費項目“作物細(xì)菌性病害防控技術(shù)研究與示范”(201303015)
【分類號】：S432.4
【正文快照】： 茄科雷爾氏菌[Ralstonia solanacearum(Smith)Yabuuhi et al.]是一種植物病原性細(xì)菌,該菌屬于β-變形菌亞門的一類生長于土壤的革蘭氏陰性細(xì)菌[1],主要分布在熱帶、亞熱帶和溫帶地區(qū)且寄主廣泛。茄科雷爾氏菌能侵染包括茄科、豆科在內(nèi)50多個科200多種作物[2],主要破壞宿主植物，

本文編號：1219326