以5個黃瓜自交系為親本,按照同親回歸方法,將"D0708-2"作為共同父本,分別與其他4個自交系"D1101-1-2、D0528-2、D1104-2-4和D1158-2"雜交,以黃瓜產(chǎn)量雜種優(yōu)勢顯著組合"D1104-2-4×D0708-2"為試驗材料,通過轉(zhuǎn)錄組測序篩選得到在親本和F1代差異表達(dá)基因克隆。通過生物信息學(xué)分析,獲得黃瓜HSP基因全長CDS,分析該基因編碼蛋白理化性質(zhì)、鑒定親水性與疏水性、亞細(xì)胞定位、預(yù)測蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和比對系統(tǒng)進(jìn)化樹。結(jié)果表明,該基因編碼區(qū)全長1 820 bp,編碼212個氨基酸,編碼蛋白屬于alpha-crystallin-Hsps_p23-like super-family,屬于親水蛋白,亞細(xì)胞定位于線粒體中,不存在明顯信號肽且不具有跨膜結(jié)構(gòu)。與南瓜親緣關(guān)系最為接近,屬于一個分支。根據(jù)其編碼蛋白將該基因命名為CsHSP20。結(jié)果為進(jìn)一步開展CsHSP20基因功能及其在黃瓜雜種優(yōu)勢中作用研究奠定基礎(chǔ)。 

【文章來源】：東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2020,51(09)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：8 頁

【部分圖文】：

黃瓜總RNA提取

蛋白質(zhì)跨膜區(qū)域通常為α螺旋，且跨膜區(qū)蛋白質(zhì)中大多數(shù)氨基酸為疏水性氨基酸。通過軟件TMPRED(http://www.ch.embnet.org/software/TMPRED＿from.html/）預(yù)測Cs HSP20蛋白是否存在跨膜區(qū)域，結(jié)果顯示Cs HSP20蛋白不存在明顯跨膜區(qū)域，不是可跨膜蛋白（見圖4）。圖4 Cs HSP20蛋白跨膜結(jié)構(gòu)預(yù)測

Cs HSP20蛋白跨膜結(jié)構(gòu)預(yù)測


本文編號：3241861