發(fā)布時(shí)間：2021-01-13 03:25

　　大豆是非常重要的經(jīng)濟(jì)作物,早在3,000⁵,000年前的中國(guó),人們便已經(jīng)開(kāi)始對(duì)大豆進(jìn)行了馴化。大豆種子大小是馴化過(guò)程中一個(gè)非常重要的性狀,研究控制大豆種子大小的基因?qū)α私獯蠖够虻倪M(jìn)化具有很重要的意義。在已報(bào)道的大豆種子大小性狀關(guān)聯(lián)分析中,所用分子標(biāo)記數(shù)目比較少,其密度低,降低了關(guān)聯(lián)分析的功效;所用關(guān)聯(lián)分析方法是基于群體結(jié)構(gòu)和多基因背景控制的單位點(diǎn)全基因組掃描方法,涉及多重檢驗(yàn)問(wèn)題,得到的顯著關(guān)聯(lián)位點(diǎn)不多。因此,有關(guān)大豆種子大小基因的報(bào)道很少,遠(yuǎn)遠(yuǎn)小于擬南芥和水稻等植物。針對(duì)上述問(wèn)題,本研究基于286份大豆材料的10組種子大小相關(guān)性狀的表型數(shù)據(jù)與106013個(gè)高密度SNPs標(biāo)記的基因型數(shù)據(jù),使用5種多位點(diǎn)GWAS方法進(jìn)行大豆種子大小性狀的關(guān)聯(lián)分析,獲得其候選基因,并研究?jī)?yōu)異等位基因在群體的分布與實(shí)施設(shè)計(jì)育種。首先,在5種多位點(diǎn)GWAS分析方法的結(jié)果中挑選多次重復(fù)檢測(cè)到的QTNs和同一年同一性狀檢測(cè)結(jié)果中物理位置間距小于50kb的位點(diǎn)區(qū)間（QTR）作為本研究的大豆種子大小QTNs和QTRs;然后,在候選位點(diǎn)和候選區(qū)域中間的前后50kb區(qū)域內(nèi)選取候選基因,通過(guò)不同大豆... 

【文章來(lái)源】：華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】：102 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

大豆種子的粒長(zhǎng)、粒厚和粒寬Figure1Seedlength（SL）,width（SW）andthickness（ST）insoybean

圖 2 2008 年至 2015 年 4 個(gè)性狀檢測(cè)到的 1137 個(gè)顯著 QTNs 在基因組上的分布Figure 2 Distribution of 1137 significant QTNs for four traits in 2008 to 20153.4 大豆種子大小相關(guān)性狀的候選位點(diǎn)、QTR 和候選基因與馴化基因的確定3.4.1 候選位點(diǎn)和 QTR 的確定為了減小假陽(yáng)性對(duì)分析結(jié)果的影響，我們分別選取了 10 組種子大小性狀檢測(cè)結(jié)果中同一性狀至少4組被檢測(cè)到的位點(diǎn)和7組種子百粒重性狀檢測(cè)結(jié)果中至少 3 組被檢測(cè)到的位點(diǎn)，最終一共選取了 59 個(gè)與種子大小相關(guān)的重復(fù) QTNs（表4）。然后對(duì)同一年同一性狀定位到的位點(diǎn)的物理位置間距進(jìn)行計(jì)算，得到 62 個(gè)位點(diǎn)間物理位置小于 50kb 的 QTR（附表 1）。59 個(gè)重復(fù) QTNs 的 LOD 值的范圍是 3.01～19.52，解釋了 0.004%～25.22%

圖 3 59 個(gè)重復(fù)的 QTNs 和 62 個(gè) QTRs 在基因組上的分布Figure 3. Distribution of 59 significant QTNs and 62 QTRs on the genome62 個(gè) QTRs 中，29 個(gè) QTRs 與粒長(zhǎng)性狀顯著關(guān)聯(lián)，31 個(gè) QTRs 與粒寬性狀顯著關(guān)聯(lián)，12 個(gè) QTRs 與粒厚性狀顯著關(guān)聯(lián)，22 個(gè) QTRs 與百粒重性狀顯著關(guān)聯(lián)（圖 4）。62 個(gè) QTRs 中也存在多個(gè)區(qū)間同時(shí)與多個(gè)性狀顯著關(guān)聯(lián)，例如，GmQTR23（6 號(hào)染色體 5910~5956kb）在粒長(zhǎng)和粒寬的性狀分析中都被檢測(cè)到（附表 1）。在 59 個(gè)候選 QTNs 和 62 個(gè) QTRs 的中心物理位置的 100kb 范圍內(nèi)，一共定位到了 900 個(gè)候選基因。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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[5]秈型黑米粒形性狀的遺傳效應(yīng)及其與礦質(zhì)元素含量的遺傳相關(guān)性[J]. 張名位,郭寶江,彭仲明.  遺傳學(xué)報(bào). 2002(08)
[6]玉米籽粒性狀的遺傳效應(yīng)分析[J]. 李玉玲,張澤民,許自成,席章?tīng)I(yíng).  遺傳. 2000(03)
[7]利用P1F1P2和F2或F2∶3世代聯(lián)合的數(shù)量性狀分離分析[J]. 章元明,蓋鈞鎰,張孟臣.  西南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2000(01)
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[9]秈型雜交稻稻米外觀品質(zhì)的種子和母體遺傳效應(yīng)分析[J]. 石春海,朱軍.  北京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 1993(S3)

碩士論文
[1]大豆GmMFT基因克隆、表達(dá)模式及功能分析[D]. 李清.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2012



本文編號(hào)：2974116