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基于Xen的虛擬機間MPI通信機制的研究與實現(xiàn)

發(fā)布時間:2017-08-24 10:07

  本文關鍵詞:基于Xen的虛擬機間MPI通信機制的研究與實現(xiàn)


  更多相關文章: 虛擬化 虛擬機間通信 高性能計算 Xen MPI


【摘要】:虛擬化技術能夠有效降低系統(tǒng)和應用軟件的維護和管理成本,增強系統(tǒng)可靠性以及優(yōu)化資源配置,,基于虛擬化環(huán)境構建的大規(guī)模集群日趨流行。然而虛擬化技術尚未在性能關鍵的應用系統(tǒng)中得到廣泛應用,特別是高性能計算領域。MPI是當今高性能計算環(huán)境中最主流的并行計算模型。在并行計算中,MPI進程需要頻繁地通信,而I/O虛擬化所產(chǎn)生的額外開銷,會顯著地降低虛擬機間MPI進程的通信性能。 大量已有工作對改善虛擬機間通信性能或MPI結點內(nèi)通信性能進行了研究,然而同時結合兩者的研究工作并不多。一個通用的虛擬機間通信框架往往沒有針對MPI應用做特殊優(yōu)化,而結點內(nèi)MPI通信框架則無法在虛擬化環(huán)境中使用。本文在同時考慮了虛擬化環(huán)境的特點以及MPI應用的通信特征的基礎上,通過改進虛擬機間通信模型,對同一臺物理機上的不同虛擬機內(nèi)的MPI進程間的通信性能進行了優(yōu)化。 改進后的模型將通信任務代理給一個隔離的后端通信模塊,通信虛擬機內(nèi)部的開銷大幅降低,而進程的通信與計算重疊能力也得到提升。同時,該模型更有利于MPI長消息傳輸與集合通信的優(yōu)化,能夠有效減少拷貝次數(shù),并均衡系統(tǒng)中虛擬機的通信負載。此外,該模型保留了原生環(huán)境下利用硬件加速技術的能力,存在進一步優(yōu)化通信性能的潛力。 在改進模型的基礎上,我們進一步給出了基于Xen的虛擬機間MPI通信框架XNEM的設計和實現(xiàn)。XNEM前后端驅(qū)動以內(nèi)核模塊的形式運行在隔離的虛擬機中,不需要對操作系統(tǒng)或虛擬機監(jiān)視器做任何修改?蚣芴峁┝撕唵味`活的編程接口,能夠方便快速地將框架移植到已有的MPI庫中。同時,我們?yōu)镸PICH庫編寫了XNEM LMT模塊,將XNEM通信框架與MPICH庫整合。使用MPICH庫的MPI進程可以在虛擬環(huán)境下將XNEM LMT模塊作為高性能的虛擬機間通信通道。 我們選取了多個微基準程序和HPC基準程序?qū)NEM框架進行實驗驗證。NetPIPE測試結果顯示,對于MPI長消息傳輸,XNEM的通信吞吐率和延遲顯著優(yōu)于Xen虛擬網(wǎng)絡以及基于共享緩沖的通信模型。IMB基準測試結果顯示12個被測MPI集合操作在XNEM框架下的延遲均好于Xen虛擬網(wǎng)絡,其中的10個表現(xiàn)出更好的通信與計算重疊率。我們還對通信時的CPU利用率進行了測量,并分析可能的系統(tǒng)瓶頸。另外,我們調(diào)整I/O環(huán)大小并重復吞吐率和延遲測試,對XNEM框架的性能進行了調(diào)優(yōu)。最后,我們運行了NPB測試套件中的FT基準程序,驗證了XNEM框架在實際應用中的可用性以及對通信性能的提升。
【關鍵詞】:虛擬化 虛擬機間通信 高性能計算 Xen MPI
【學位授予單位】:上海交通大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2014
【分類號】:TP302
【目錄】:
  • 摘要5-7
  • ABSTRACT7-9
  • 目錄9-12
  • 插圖索引12-14
  • 表格索引14-15
  • 第一章 緒論15-19
  • 1.1 研究背景與意義15-17
  • 1.2 研究目標17
  • 1.3 研究內(nèi)容17-18
  • 1.4 論文組織結構18-19
  • 第二章 Xen 虛擬機間通信機制概述19-31
  • 2.1 Xen 虛擬化技術19-24
  • 2.1.1 體系結構19-21
  • 2.1.2 關鍵技術21-24
  • 2.2 Xen 網(wǎng)絡通信性能分析24-25
  • 2.3 相關工作25-30
  • 2.3.1 XenLoop26-27
  • 2.3.2 MMNet27-28
  • 2.3.3 XenSocket28-29
  • 2.3.4 IVC29-30
  • 2.4 本章小結30-31
  • 第三章 虛擬機間 MPI 通信框架的設計31-43
  • 3.1 設計目標31
  • 3.2 XNEM 通信框架設計31-34
  • 3.2.1 框架概覽31-33
  • 3.2.2 通信流程33-34
  • 3.3 XNEM 通信模型分析34-42
  • 3.3.1 數(shù)據(jù)拷貝35-37
  • 3.3.2 通信特征37-38
  • 3.3.3 MPI 集合通信38-40
  • 3.3.4 I/O 硬件加速40-42
  • 3.4 本章小結42-43
  • 第四章 虛擬機間 MPI 通信框架的實現(xiàn)43-61
  • 4.1 XNEM 框架的實現(xiàn)43-52
  • 4.1.1 模塊初始化43-44
  • 4.1.2 共享數(shù)據(jù)結構44-46
  • 4.1.3 XNEM 前端驅(qū)動的實現(xiàn)46-49
  • 4.1.4 XNEM 后端驅(qū)動的實現(xiàn)49-52
  • 4.2 XNEM 與 MPICH 整合52-60
  • 4.2.1 MPICH 架構52-54
  • 4.2.2 XNEM LMT 模塊的實現(xiàn)54-57
  • 4.2.3 控制信息傳遞57-60
  • 4.2.4 模塊選擇的虛擬化感知60
  • 4.3 本章小結60-61
  • 第五章 實驗驗證61-77
  • 5.1 實驗環(huán)境61-65
  • 5.1.1 系統(tǒng)環(huán)境61
  • 5.1.2 基準程序61-65
  • 5.2 實驗結果與分析65-75
  • 5.2.1 吞吐率與延遲65-68
  • 5.2.2 過載條件下的吞吐率和延遲68-70
  • 5.2.3 Dom0 的 CPU 利用率70-71
  • 5.2.4 I/O 環(huán)對通信性能的影響71-72
  • 5.2.5 MPI 集合通信72-73
  • 5.2.6 HPC 應用程序73-75
  • 5.3 本章小結75-77
  • 第六章 總結與展望77-79
  • 附錄A 部分源代碼79-81
  • 參考文獻81-85
  • 致謝85-87
  • 攻讀學位期間發(fā)表的學術論文目錄87

【共引文獻】

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2 湯恩義;BARR Earlz;蘇振東;李宣東;;程序數(shù)值誤差的擾動檢測與優(yōu)化[J];中國科學:信息科學;2014年11期

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中國博士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前6條

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3 李承功;流場的格子Boltzmann模擬及其GPU-CUDA并行計算[D];大連理工大學;2013年

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9 龔興全;基于OpenCL的圖形處理器FDTD算法仿真研究[D];山東大學;2014年

10 張新;基于SMP的離散事件執(zhí)行驅(qū)動性能模擬器設計與實現(xiàn)[D];國防科學技術大學;2012年



本文編號:730656

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