基于離子誘導(dǎo)和鏈置換技術(shù)的邏輯放大模型的研究
發(fā)布時(shí)間:2022-01-06 01:08
自從英國(guó)數(shù)學(xué)家Turing于1936年開創(chuàng)性的提出圖靈計(jì)算機(jī)模型以來,電子計(jì)算機(jī)就在各個(gè)領(lǐng)域得到了迅猛發(fā)展,并一躍成為了 20世紀(jì)三大科學(xué)革命之一,其對(duì)社會(huì)的發(fā)展和進(jìn)步產(chǎn)生了巨大的促進(jìn)作用。但隨著21世紀(jì)社會(huì)和科學(xué)技術(shù)等的迅猛發(fā)展,集成電路的復(fù)雜程度、超高速的運(yùn)算能力以及硅晶板的存儲(chǔ)能力都遇到了瓶頸,傳統(tǒng)電子計(jì)算機(jī)在各領(lǐng)域的發(fā)展都遭遇了前所未有的挑戰(zhàn),其運(yùn)算能力也越來越接近技術(shù)所能達(dá)到的極限。在過去的幾十年間,科學(xué)家們都在尋找可靠的替代物(或補(bǔ)充物),這其中就包括神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)計(jì)算機(jī)、量子計(jì)算機(jī)、分子計(jì)算機(jī)等一系列計(jì)算裝置。DNA計(jì)算機(jī)的出現(xiàn)具有劃時(shí)代的意義,其引發(fā)了生物界和其他各界研究者的廣泛關(guān)注,其獨(dú)特的超微結(jié)構(gòu)使得DNA計(jì)算機(jī)擁有超大存儲(chǔ)容量、超高速的運(yùn)行速度以及外觀的微型化,并逐漸被人們用于解決各個(gè)生物領(lǐng)域的各種復(fù)雜問題,包括應(yīng)用數(shù)學(xué)領(lǐng)域的NP完全問題、SAT問題等,生物化學(xué)領(lǐng)域的藥物篩選和疾病的快速檢測(cè)等,環(huán)境科學(xué)領(lǐng)域的快速檢測(cè)等。這其中最引人注意的就是DNA分子強(qiáng)大的存儲(chǔ)能力,比如,2013年,歐洲生物信息研究所Goldman團(tuán)隊(duì)成功將2.2PB的信息存儲(chǔ)至一克中的DNA中。到2...
【文章來源】:陜西師范大學(xué)陜西省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:81 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
基于DNA鏈置換的邏輯門結(jié)構(gòu)模型
陜西師范大學(xué)碩士學(xué)位論文??分別為“AND”門、“OR”門、“XOR”門、半加器和一個(gè)連鎖門(圖1-2),??這五個(gè)邏輯門均以寡聚核苷酸作為輸入,分別與雙鏈DNA中的立足點(diǎn)結(jié)合后通過??分支迀移效應(yīng)將原先與固定鏈部分互補(bǔ)的鏈替換下來,并通過監(jiān)控溶液中的熒光??強(qiáng)度而檢測(cè)邏輯門的輸出[58]。2013年,Wei?Li等人利用DNA鏈置換技術(shù)設(shè)計(jì)了??一個(gè)三輸入環(huán)形DNA邏輯門(圖1-3),該模型是以一個(gè)環(huán)形DNA分子為底物,??"and?Logic?S?S?|?I?Half-Adder??i?,?4?r?i?n'.??I,?1?-?-?〇?:|?HA.,nwl.1.?—?彌??5?I?f?t?廣?3?HA—2—十??''°^|lhi〇''?!?i?1!〇?碑??00?1?llHJlflHnlll??b)?OR?Logic?U-?0?i?0?1?MA.mpuM??8;?|?!?0?0?1?1?HA-flfWt-2?I?1??I?II?I?^?1?1?^?^?S?—?Chained?Gates??L?11°?,|r*ukl-?1?,:-??IXfT?娜?—g?卜?!?l??c
點(diǎn)切割修飾有熒光基團(tuán)和猝滅基團(tuán)的底物,使得底物的熒光基團(tuán)與猝滅基團(tuán)的距??離發(fā)生變化,隨后造成的熒光變化量則作為模型的輸出信號(hào)。該策略為敏感性檢??測(cè)疾病提供了全新的思路[61](圖1-4)。2015年,Simon?M等人以多組分核酸酶(MNA)??和目標(biāo)核酸序列所形成的配對(duì)結(jié)構(gòu)作為輸入,以熒光的相對(duì)變化量作為信號(hào)輸出,??構(gòu)建了?“OR”和“YES”兩種簡(jiǎn)單邏輯門。文章中首先將DNA酶和各自配對(duì)的??寡核苷酸結(jié)合設(shè)計(jì)了兩種可分裂DNA核酸酶
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]鎖核酸分子信標(biāo)在分子識(shí)別與生物分析中的應(yīng)用[J]. 桂珍,嚴(yán)楓,李金昌,葛夢(mèng)圓,鞠熀先. 化學(xué)進(jìn)展. 2015(10)
[2]熒光標(biāo)記技術(shù)在生物學(xué)和醫(yī)學(xué)研究中的應(yīng)用[J]. 吳超柱,徐凡,郜炎龍,姜和. 重慶理工大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)). 2014(05)
[3]生物計(jì)算機(jī)時(shí)代即將來臨[J]. 許進(jìn). 中國(guó)科學(xué)院院刊. 2014(01)
[4]新型熒光技術(shù)在病毒檢測(cè)中的應(yīng)用[J]. 陳璐,吉邢虎,何治柯. 化學(xué)傳感器. 2012(04)
[5]熒光標(biāo)記法測(cè)定大鼠血漿中海膽黃多糖研究[J]. 康迪,滕再進(jìn),柯夢(mèng)云,郁潔,王慧,沈衛(wèi)陽,奚濤,周長(zhǎng)林. 藥物生物技術(shù). 2012(04)
[6]熒光標(biāo)記技術(shù)及其應(yīng)用的研究進(jìn)展[J]. 張桂芬,靳穎,張愛民,張燕玲. 武警醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào). 2008(06)
[7]DNA分子計(jì)算與DNA計(jì)算機(jī)的研究進(jìn)展[J]. 俞洋,繆淮扣,宋世平,樊春海. 科學(xué)通報(bào). 2008(05)
[8]DNA計(jì)算機(jī)原理、進(jìn)展及難點(diǎn)(Ⅳ):論DNA計(jì)算機(jī)模型[J]. 許進(jìn),譚鋼軍,范月科,郭養(yǎng)安. 計(jì)算機(jī)學(xué)報(bào). 2007(06)
[9]導(dǎo)電聚合物固定酶生物傳感器研究進(jìn)展[J]. 李松林,崔建明. 材料導(dǎo)報(bào). 2006(04)
[10]DNA計(jì)算機(jī)原理、進(jìn)展及難點(diǎn)(Ⅰ):生物計(jì)算系統(tǒng)及其在圖論中的應(yīng)用[J]. 許進(jìn),張雷. 計(jì)算機(jī)學(xué)報(bào). 2003(01)
本文編號(hào):3571410
【文章來源】:陜西師范大學(xué)陜西省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:81 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
基于DNA鏈置換的邏輯門結(jié)構(gòu)模型
陜西師范大學(xué)碩士學(xué)位論文??分別為“AND”門、“OR”門、“XOR”門、半加器和一個(gè)連鎖門(圖1-2),??這五個(gè)邏輯門均以寡聚核苷酸作為輸入,分別與雙鏈DNA中的立足點(diǎn)結(jié)合后通過??分支迀移效應(yīng)將原先與固定鏈部分互補(bǔ)的鏈替換下來,并通過監(jiān)控溶液中的熒光??強(qiáng)度而檢測(cè)邏輯門的輸出[58]。2013年,Wei?Li等人利用DNA鏈置換技術(shù)設(shè)計(jì)了??一個(gè)三輸入環(huán)形DNA邏輯門(圖1-3),該模型是以一個(gè)環(huán)形DNA分子為底物,??"and?Logic?S?S?|?I?Half-Adder??i?,?4?r?i?n'.??I,?1?-?-?〇?:|?HA.,nwl.1.?—?彌??5?I?f?t?廣?3?HA—2—十??''°^|lhi〇''?!?i?1!〇?碑??00?1?llHJlflHnlll??b)?OR?Logic?U-?0?i?0?1?MA.mpuM??8;?|?!?0?0?1?1?HA-flfWt-2?I?1??I?II?I?^?1?1?^?^?S?—?Chained?Gates??L?11°?,|r*ukl-?1?,:-??IXfT?娜?—g?卜?!?l??c
點(diǎn)切割修飾有熒光基團(tuán)和猝滅基團(tuán)的底物,使得底物的熒光基團(tuán)與猝滅基團(tuán)的距??離發(fā)生變化,隨后造成的熒光變化量則作為模型的輸出信號(hào)。該策略為敏感性檢??測(cè)疾病提供了全新的思路[61](圖1-4)。2015年,Simon?M等人以多組分核酸酶(MNA)??和目標(biāo)核酸序列所形成的配對(duì)結(jié)構(gòu)作為輸入,以熒光的相對(duì)變化量作為信號(hào)輸出,??構(gòu)建了?“OR”和“YES”兩種簡(jiǎn)單邏輯門。文章中首先將DNA酶和各自配對(duì)的??寡核苷酸結(jié)合設(shè)計(jì)了兩種可分裂DNA核酸酶
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]鎖核酸分子信標(biāo)在分子識(shí)別與生物分析中的應(yīng)用[J]. 桂珍,嚴(yán)楓,李金昌,葛夢(mèng)圓,鞠熀先. 化學(xué)進(jìn)展. 2015(10)
[2]熒光標(biāo)記技術(shù)在生物學(xué)和醫(yī)學(xué)研究中的應(yīng)用[J]. 吳超柱,徐凡,郜炎龍,姜和. 重慶理工大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)). 2014(05)
[3]生物計(jì)算機(jī)時(shí)代即將來臨[J]. 許進(jìn). 中國(guó)科學(xué)院院刊. 2014(01)
[4]新型熒光技術(shù)在病毒檢測(cè)中的應(yīng)用[J]. 陳璐,吉邢虎,何治柯. 化學(xué)傳感器. 2012(04)
[5]熒光標(biāo)記法測(cè)定大鼠血漿中海膽黃多糖研究[J]. 康迪,滕再進(jìn),柯夢(mèng)云,郁潔,王慧,沈衛(wèi)陽,奚濤,周長(zhǎng)林. 藥物生物技術(shù). 2012(04)
[6]熒光標(biāo)記技術(shù)及其應(yīng)用的研究進(jìn)展[J]. 張桂芬,靳穎,張愛民,張燕玲. 武警醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào). 2008(06)
[7]DNA分子計(jì)算與DNA計(jì)算機(jī)的研究進(jìn)展[J]. 俞洋,繆淮扣,宋世平,樊春海. 科學(xué)通報(bào). 2008(05)
[8]DNA計(jì)算機(jī)原理、進(jìn)展及難點(diǎn)(Ⅳ):論DNA計(jì)算機(jī)模型[J]. 許進(jìn),譚鋼軍,范月科,郭養(yǎng)安. 計(jì)算機(jī)學(xué)報(bào). 2007(06)
[9]導(dǎo)電聚合物固定酶生物傳感器研究進(jìn)展[J]. 李松林,崔建明. 材料導(dǎo)報(bào). 2006(04)
[10]DNA計(jì)算機(jī)原理、進(jìn)展及難點(diǎn)(Ⅰ):生物計(jì)算系統(tǒng)及其在圖論中的應(yīng)用[J]. 許進(jìn),張雷. 計(jì)算機(jī)學(xué)報(bào). 2003(01)
本文編號(hào):3571410
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