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若干DNA邏輯門的模型研究

發(fā)布時間:2020-09-02 20:29
   分子器件是指利用分子的內(nèi)在多樣性在分子水平上完成計算功能的微型系統(tǒng)。分子邏輯門作為分子器件中最具代表性的分子系統(tǒng),在過去的幾十年里取得了很大的進(jìn)展。目前,分子邏輯門是非;钴S的研究領(lǐng)域,有望于解決現(xiàn)代電子計算機(jī)發(fā)展的瓶頸問題。DNA特殊的分子結(jié)構(gòu)與多樣化的功能,自然而然的成為了分子邏輯門的應(yīng)用材料。在本論文中,我們應(yīng)用Watson-Crick堿基配對原則,利用G-四鏈體可以增強(qiáng)NMM熒光強(qiáng)度的特性,借助于DNA鏈置換和熒光標(biāo)記這兩種納米技術(shù)進(jìn)行DNA邏輯門模型的構(gòu)建,主要的研究內(nèi)容如下:1)以圓環(huán)DNA為基本單元,構(gòu)建了一位二進(jìn)制半加器計算模型。在該計算模型中,通過圓環(huán)DNA的特性,使互補(bǔ)在圓環(huán)DNA上兩條單鏈上所修飾的熒光分子FAM與猝滅分子Dabcyl相互作用致使熒光猝滅。設(shè)計可以互補(bǔ)的兩條富含G堿基片段的DNA單鏈作為半加器的兩個輸入信號,利用DNA鏈置換技術(shù)釋放圓環(huán)DNA上攜帶FAM或Dabcyl的DNA單鏈,以及富含G堿基片段形成的G-四鏈體結(jié)構(gòu),輸出信號則檢測FAM與NMM的熒光強(qiáng)度的相對變化,從而實現(xiàn)了半加器的計算。2)以互補(bǔ)雙鏈DNA為基本單元,構(gòu)建了一位二進(jìn)制半減器計算模型。在該計算模型中,作為基本單元的雙鏈DNA其中一條不僅修飾猝滅分子Dabcyl而且設(shè)計含有可以形成G-四鏈體的富含G堿基片段,另一條則是修飾熒光分子FAM。互補(bǔ)配對一方面使FAM與Dabcyl相互作用致使熒光猝滅,另一方面破壞了 G-四鏈體的形成。設(shè)計兩條簡單互補(bǔ)配對的DNA單鏈作為半減器的兩個輸入信號,通過DNA鏈置換破壞基本單元的構(gòu)成,把FAM與NMM的熒光強(qiáng)度的相對變化作為輸出信號,進(jìn)而完成半減器的計算。3)以單鏈DNA/氧化石墨烯為基本單元,構(gòu)建了一位二進(jìn)制半加-半減器計算模型。在該計算模型中,憑借著特殊結(jié)構(gòu)的氧化石墨烯以其出色的熒光猝滅的特點以及吸附單鏈DNA釋放雙鏈DNA的特性,與修飾有熒光分子FAM與猝滅分子Dabcyl的單鏈DNA配合組建基本單元。首先設(shè)計兩條特殊的互補(bǔ)的DNA單鏈作為輸入信號,其中一條輸入鏈修飾熒光分子HEX,另外一條富含G堿基片段。作為輸入信號的兩條DNA單鏈都能與氧化石墨烯吸附的單鏈DNA進(jìn)行互補(bǔ)形成雙鏈結(jié)構(gòu)從而將其從氧化石墨烯表面釋放出來。然后,再設(shè)計第三條富含G堿基片段的DNA單鏈來調(diào)控該模型是執(zhí)行半加器功能還是半減器功能。以FAM與HEX的熒光信號組合作為半加器的輸出信號,以FAM與NMM的熒光信號組合充當(dāng)半減器的輸出信號,實現(xiàn)了該模型既能進(jìn)行半加法的計算也能進(jìn)行半減法的計算。
【學(xué)位單位】:陜西師范大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類】:TP384
【部分圖文】:

三向,分支,示意圖,熒光素


逑技術(shù)構(gòu)建了與門(AND)、或門(OR)以及與非門(NAND),在此基礎(chǔ)上進(jìn)而構(gòu)逡逑建了一個級聯(lián)邏輯電路來執(zhí)行異或(XOR)邏輯(見圖1-1)。逡逑檢測DNA分子是科學(xué)研[偟敝幸恢種匾氖莘治鍪侄,因而应用各种茧H蹂義鮮侄衛(wèi)刺岣嘸觳獾淖既沸雜肓槊糶允欠淺V匾。2008妮彫}x宓熱耍郟保叮萏岢雋耍皺義閑碌模模危良觳夥椒ǎ跡保玻,他脡Λ高选择虚喛睍岜K嫉模模危亮粗沒揮胙衾脲義獻(xiàn)庸查罹鄣緗庵實墓庋Х糯筇匭越薪岷。灾@秸肴芤禾逑抵瀉醒衾胱庸查罹坼義系緗庵剩ǎ茫茫校卞澹,5’末稊\糜饉乇曇塹牟糠衷詠壞乃矗模危梁禿慫崮誶忻福齲幔邋澹桑桑傘e義霞しⅲ茫茫校,可揖壻Z掠行芰看櫻茫茫校弊頻接饉亟蠱浞⒐。当目标链辶x洗嬖詰那榭魷攏玫降乃純梢員緩慫崮誶忻福齲幔邋澹桑桑汕懈釕尚饉氐畝體義希模危療巍6蹋模危療斡耄茫茫校敝湎嘍越先醯木駁繾饔彌率梗茫茫校痹獨胗忮義纖夭荒懿芰孔。染J勘炅床淮嬖謔,则携带荧桂~氐鈉斡耄茫茫校畢嗷ュ義峽拷芰孔平⒊鑾抗舛患觳獬隼礎(chǔ)e義稀訟

本文編號:2811064

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