若干DNA邏輯門的模型研究
發(fā)布時間:2020-09-02 20:29
分子器件是指利用分子的內(nèi)在多樣性在分子水平上完成計算功能的微型系統(tǒng)。分子邏輯門作為分子器件中最具代表性的分子系統(tǒng),在過去的幾十年里取得了很大的進(jìn)展。目前,分子邏輯門是非;钴S的研究領(lǐng)域,有望于解決現(xiàn)代電子計算機(jī)發(fā)展的瓶頸問題。DNA特殊的分子結(jié)構(gòu)與多樣化的功能,自然而然的成為了分子邏輯門的應(yīng)用材料。在本論文中,我們應(yīng)用Watson-Crick堿基配對原則,利用G-四鏈體可以增強(qiáng)NMM熒光強(qiáng)度的特性,借助于DNA鏈置換和熒光標(biāo)記這兩種納米技術(shù)進(jìn)行DNA邏輯門模型的構(gòu)建,主要的研究內(nèi)容如下:1)以圓環(huán)DNA為基本單元,構(gòu)建了一位二進(jìn)制半加器計算模型。在該計算模型中,通過圓環(huán)DNA的特性,使互補(bǔ)在圓環(huán)DNA上兩條單鏈上所修飾的熒光分子FAM與猝滅分子Dabcyl相互作用致使熒光猝滅。設(shè)計可以互補(bǔ)的兩條富含G堿基片段的DNA單鏈作為半加器的兩個輸入信號,利用DNA鏈置換技術(shù)釋放圓環(huán)DNA上攜帶FAM或Dabcyl的DNA單鏈,以及富含G堿基片段形成的G-四鏈體結(jié)構(gòu),輸出信號則檢測FAM與NMM的熒光強(qiáng)度的相對變化,從而實現(xiàn)了半加器的計算。2)以互補(bǔ)雙鏈DNA為基本單元,構(gòu)建了一位二進(jìn)制半減器計算模型。在該計算模型中,作為基本單元的雙鏈DNA其中一條不僅修飾猝滅分子Dabcyl而且設(shè)計含有可以形成G-四鏈體的富含G堿基片段,另一條則是修飾熒光分子FAM。互補(bǔ)配對一方面使FAM與Dabcyl相互作用致使熒光猝滅,另一方面破壞了 G-四鏈體的形成。設(shè)計兩條簡單互補(bǔ)配對的DNA單鏈作為半減器的兩個輸入信號,通過DNA鏈置換破壞基本單元的構(gòu)成,把FAM與NMM的熒光強(qiáng)度的相對變化作為輸出信號,進(jìn)而完成半減器的計算。3)以單鏈DNA/氧化石墨烯為基本單元,構(gòu)建了一位二進(jìn)制半加-半減器計算模型。在該計算模型中,憑借著特殊結(jié)構(gòu)的氧化石墨烯以其出色的熒光猝滅的特點以及吸附單鏈DNA釋放雙鏈DNA的特性,與修飾有熒光分子FAM與猝滅分子Dabcyl的單鏈DNA配合組建基本單元。首先設(shè)計兩條特殊的互補(bǔ)的DNA單鏈作為輸入信號,其中一條輸入鏈修飾熒光分子HEX,另外一條富含G堿基片段。作為輸入信號的兩條DNA單鏈都能與氧化石墨烯吸附的單鏈DNA進(jìn)行互補(bǔ)形成雙鏈結(jié)構(gòu)從而將其從氧化石墨烯表面釋放出來。然后,再設(shè)計第三條富含G堿基片段的DNA單鏈來調(diào)控該模型是執(zhí)行半加器功能還是半減器功能。以FAM與HEX的熒光信號組合作為半加器的輸出信號,以FAM與NMM的熒光信號組合充當(dāng)半減器的輸出信號,實現(xiàn)了該模型既能進(jìn)行半加法的計算也能進(jìn)行半減法的計算。
【學(xué)位單位】:陜西師范大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類】:TP384
【部分圖文】:
逑技術(shù)構(gòu)建了與門(AND)、或門(OR)以及與非門(NAND),在此基礎(chǔ)上進(jìn)而構(gòu)逡逑建了一個級聯(lián)邏輯電路來執(zhí)行異或(XOR)邏輯(見圖1-1)。逡逑檢測DNA分子是科學(xué)研[偟敝幸恢種匾氖莘治鍪侄,因而应用各种茧H蹂義鮮侄衛(wèi)刺岣嘸觳獾淖既沸雜肓槊糶允欠淺V匾。2008妮彫}x宓熱耍郟保叮萏岢雋耍皺義閑碌模模危良觳夥椒ǎ跡保玻,他脡Λ高选择虚喛睍岜K嫉模模危亮粗沒揮胙衾脲義獻(xiàn)庸查罹鄣緗庵實墓庋Х糯筇匭越薪岷。灾@秸肴芤禾逑抵瀉醒衾胱庸查罹坼義系緗庵剩ǎ茫茫校卞澹,5’末稊\糜饉乇曇塹牟糠衷詠壞乃矗模危梁禿慫崮誶忻福齲幔邋澹桑桑傘e義霞しⅲ茫茫校,可揖壻Z掠行芰看櫻茫茫校弊頻接饉亟蠱浞⒐。当目标链辶x洗嬖詰那榭魷攏玫降乃純梢員緩慫崮誶忻福齲幔邋澹桑桑汕懈釕尚饉氐畝體義希模危療巍6蹋模危療斡耄茫茫校敝湎嘍越先醯木駁繾饔彌率梗茫茫校痹獨胗忮義纖夭荒懿芰孔。染J勘炅床淮嬖謔,则携带荧桂~氐鈉斡耄茫茫校畢嗷ュ義峽拷芰孔平⒊鑾抗舛患觳獬隼礎(chǔ)e義稀訟
本文編號:2811064
【學(xué)位單位】:陜西師范大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類】:TP384
【部分圖文】:
逑技術(shù)構(gòu)建了與門(AND)、或門(OR)以及與非門(NAND),在此基礎(chǔ)上進(jìn)而構(gòu)逡逑建了一個級聯(lián)邏輯電路來執(zhí)行異或(XOR)邏輯(見圖1-1)。逡逑檢測DNA分子是科學(xué)研[偟敝幸恢種匾氖莘治鍪侄,因而应用各种茧H蹂義鮮侄衛(wèi)刺岣嘸觳獾淖既沸雜肓槊糶允欠淺V匾。2008妮彫}x宓熱耍郟保叮萏岢雋耍皺義閑碌模模危良觳夥椒ǎ跡保玻,他脡Λ高选择虚喛睍岜K嫉模模危亮粗沒揮胙衾脲義獻(xiàn)庸查罹鄣緗庵實墓庋Х糯筇匭越薪岷。灾@秸肴芤禾逑抵瀉醒衾胱庸查罹坼義系緗庵剩ǎ茫茫校卞澹,5’末稊\糜饉乇曇塹牟糠衷詠壞乃矗模危梁禿慫崮誶忻福齲幔邋澹桑桑傘e義霞しⅲ茫茫校,可揖壻Z掠行芰看櫻茫茫校弊頻接饉亟蠱浞⒐。当目标链辶x洗嬖詰那榭魷攏玫降乃純梢員緩慫崮誶忻福齲幔邋澹桑桑汕懈釕尚饉氐畝體義希模危療巍6蹋模危療斡耄茫茫校敝湎嘍越先醯木駁繾饔彌率梗茫茫校痹獨胗忮義纖夭荒懿芰孔。染J勘炅床淮嬖謔,则携带荧桂~氐鈉斡耄茫茫校畢嗷ュ義峽拷芰孔平⒊鑾抗舛患觳獬隼礎(chǔ)e義稀訟
本文編號:2811064
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