【摘要】： 隨著越來(lái)越多的生物基因(組)的測(cè)序完成,生物數(shù)據(jù)不但在數(shù)量上呈指數(shù)增長(zhǎng),存儲(chǔ)及維護(hù)生物數(shù)據(jù)的組織和數(shù)據(jù)庫(kù)也越來(lái)越多。對(duì)生物數(shù)據(jù)的分析與研究是我們的首要目的,但正因?yàn)樯飻?shù)據(jù)的種類及存儲(chǔ)方式眾多,導(dǎo)致我們?cè)跈z索、研究等方面遇到了眾多困難。如何將海量的數(shù)據(jù)按照統(tǒng)一、有效的方式進(jìn)行存儲(chǔ),已成為當(dāng)前急需解決的問(wèn)題。同時(shí),隨著后基因時(shí)代的來(lái)臨,打破傳統(tǒng)的生物信息存儲(chǔ)模式已成為必然。尋找到更好的存儲(chǔ)方式,將為我們更高效地獲得有價(jià)值的生物信息提供極大的方便。 生物數(shù)據(jù)存儲(chǔ)的主要問(wèn)題包括語(yǔ)義異構(gòu),語(yǔ)法異構(gòu),和模式異構(gòu)等。為了較好的解決以上問(wèn)題,在研究中結(jié)合了XML在生物信息學(xué)中現(xiàn)階段的應(yīng)用情況,將其作為數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)格式及實(shí)現(xiàn)存儲(chǔ)模式的媒介。同時(shí),針對(duì)本文提出的存儲(chǔ)模式所具有的特點(diǎn),將XML面向?qū)ο蟮奶匦约{入了研究范圍,使生物信息存儲(chǔ)從信息抽象到數(shù)據(jù)生成均使用統(tǒng)一的信息組織形式。 本文根據(jù)生物數(shù)據(jù)自身的特點(diǎn),從不同角度對(duì)其包含的信息進(jìn)行了分析、抽象以及歸類,形成了生物信息存儲(chǔ)的基本結(jié)構(gòu)。以此結(jié)構(gòu)為基礎(chǔ),根據(jù)不同類型的生物數(shù)據(jù)存儲(chǔ)需求,設(shè)計(jì)了四種生物信息存儲(chǔ)模式。 存儲(chǔ)模式以軟件設(shè)計(jì)模式的思想為基礎(chǔ),以面向?qū)ο笞鳛閷?shí)現(xiàn)手段,將XML作為數(shù)據(jù)載體,實(shí)現(xiàn)生物數(shù)據(jù)存儲(chǔ)的模塊化、統(tǒng)一化。同時(shí),這些存儲(chǔ)模式不但符合生物信息存儲(chǔ)與研究的特點(diǎn),其自身的可復(fù)用性也為今后生物信息存儲(chǔ)方面的研究奠定了基礎(chǔ)。
【學(xué)位授予單位】：華中師范大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2010
【分類號(hào)】：TP333

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2 童

本文編號(hào)：2748163