發(fā)布時間：2019-10-18 15:40

【摘要】：傳統(tǒng)的虛擬篩選以及網(wǎng)格環(huán)境下的虛擬篩選都需要化學家手動將小分子文件上傳以及結(jié)果數(shù)據(jù)收集,無法實現(xiàn)自動對接以及結(jié)果文件的自動收集,給化學家造成了一定的工作負擔。 本論文在國家自然科學基金重大研究計劃中兩個重點項目“計算化學e-Science研究和示范應(yīng)用”以及“網(wǎng)絡(luò)環(huán)境下抗禽流感病毒H5N1藥物的大規(guī)模虛擬篩選研究”成果的基礎(chǔ)上,結(jié)合Hadoop平臺在海量數(shù)據(jù)存儲中的優(yōu)勢,開展基于Hadoop平臺的虛擬篩選的海量數(shù)據(jù)存儲和結(jié)果處理的設(shè)計和實現(xiàn)工作,以實現(xiàn)虛擬篩選的自動化。本論文主要開展以下兩個方面的工作：一、針對大規(guī)模虛擬篩選中對海量原始小分子數(shù)據(jù)、對接結(jié)果數(shù)據(jù)和海量作業(yè)進行管理的需求,實現(xiàn)了支持大規(guī)模虛擬篩選的數(shù)據(jù)存儲和作業(yè)管理的Hadoop平臺；二、利用MapReduce編程框架實現(xiàn)了并行分子對接和結(jié)果文件的初步處理。 本論文的研究成果為藥物開發(fā)工作者提供了進行大規(guī)模藥物虛擬篩選研究和海量數(shù)據(jù)管理的平臺,為云環(huán)境下的藥物開發(fā)提供了借鑒,將促進計算化學e-science的發(fā)展。
【學位授予單位】：蘭州大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2012
【分類號】：TP333

【二級參考文獻】

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本文編號：2551157