【摘要】：高通量測序儀產(chǎn)生大量的DNA數(shù)據(jù),FASTQ是被廣泛使用的存儲DNA數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)格式。對FASTQ格式的數(shù)據(jù)進(jìn)行壓縮處理,能有效地節(jié)省存儲空間。DSRC算法具有壓縮比高的優(yōu)點,因此對DSRC算法進(jìn)行并行能提高壓縮FASTQ格式的DNA數(shù)據(jù)的效率。基于Pthreads,實現(xiàn)了并行DSRC算法。測試結(jié)果表明,當(dāng)使用4線程時加速比達(dá)到3.5。
[Abstract]:......
【作者單位】： 中國科學(xué)院軟件研究所并行軟件與計算科學(xué)實驗室;中國科學(xué)院計算技術(shù)研究所計算機(jī)體系結(jié)構(gòu)國家重點實驗室;廣州中國科學(xué)院軟件應(yīng)用技術(shù)研究所;
【基金】：國家“八六三”高技術(shù)研究發(fā)展計劃基金(2012AA010903) 國家自然科學(xué)基金項目(61170075,61133005,61272136,61100073) 廣州市云計算技術(shù)研發(fā)與產(chǎn)業(yè)化專項資助
【分類號】：TP333

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 劉富強;孫斌;王新紅;;基于DSRC的車載通信平臺設(shè)計[J];今日電子;2009年09期

2 馮純康;周又玲;;DSRC短程通信協(xié)議研究[J];無線互聯(lián)科技;2011年01期

3 向昊;羅禹貢;張書瑋;朱陶;馮輝宗;;多道路調(diào)制環(huán)境下DSRC魯棒性研究與仿真[J];科學(xué)技術(shù)與工程;2013年24期

4 熊輝,史其信;DSRC編織車·路網(wǎng)絡(luò)神經(jīng)[J];交通世界;2001年05期

5 屠宇,徐建閩,鐘慧玲;DSRC系統(tǒng)通信協(xié)議的開發(fā)[J];計算機(jī)工程;2003年21期

6 趙智明,項洪印;DSRC技術(shù)及其在智能交通中的應(yīng)用[J];中國科技信息;2005年22期

7 向昊;于東輝;;DSRC通信系統(tǒng)架構(gòu)設(shè)計與實現(xiàn)[J];科技視界;2013年01期

8 周盧;張曉霞;;專用短程通信(DSRC)協(xié)議通信原理的研究[J];數(shù)字技術(shù)與應(yīng)用;2013年02期

9 馬鉞;基于DSRC的多功能不停車收費系統(tǒng)[J];計算機(jī)工程與應(yīng)用;2002年10期

10 彭選榮,鐘慧玲,徐建閩;專用短程通信(DSRC)協(xié)議研究及應(yīng)用展望[J];移動通信;2003年S1期

相關(guān)會議論文 前6條

1 肖迪;楊蘊;;對自主創(chuàng)新的中國DSRC技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)的選擇思路[A];第二屆中國智能交通年會論文集[C];2006年

2 Tien-Chen,Ho;;Research on Specification for Dedicated Short Range Communication[A];2012年計算機(jī)應(yīng)用與系統(tǒng)建模國際會議論文集[C];2012年

3 陳云;蔡華;許宏科;;個性化交通信息服務(wù)系統(tǒng)的初步研究[A];第一屆全國公路科技創(chuàng)新高層論壇論文集智能交通與機(jī)電工程卷[C];2002年

4 林樹亮;;基于DSRC技術(shù)的多義性路徑識別基站應(yīng)用研究[A];《IT時代周刊》論文專版（第300期）[C];2014年

5 何玉婉;余立建;袁果;;ITS專用短程通信機(jī)制研究[A];2006中國西部青年通信學(xué)術(shù)會議論文集[C];2006年

6 章曙光;;智能交通專用短程通信協(xié)議分析[A];城市科學(xué)論集[C];2004年

相關(guān)重要報紙文章 前1條

1 實習(xí)生 范圓圓;車聯(lián)網(wǎng)將如何改變?nèi)藗兂鲂�？[N];科技日報;2014年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前10條

1 郭海陶;智能交通專用短程通信（DSRC）關(guān)鍵技術(shù)與應(yīng)用研究[D];華南理工大學(xué);2010年

2 許澤斌;DSRC設(shè)備檢測儀的研究與設(shè)計[D];武漢理工大學(xué);2012年

3 邱勁;基于DSRC-ETC的福建高速公路聯(lián)網(wǎng)收費系統(tǒng)的設(shè)計[D];北京郵電大學(xué);2011年

4 田奇峰;智能車載終端DSRC協(xié)議的研究與實現(xiàn)[D];北京郵電大學(xué);2010年

5 羅佳;不停車收費系統(tǒng)中DSRC綜合測試儀的實現(xiàn)[D];華中師范大學(xué);2011年

6 張文天;專用短程通信協(xié)議在電子不停車收費系統(tǒng)中的實現(xiàn)[D];南京理工大學(xué);2006年

7 張弓;ETC應(yīng)用中RSU系統(tǒng)的設(shè)計與實現(xiàn)[D];華東師范大學(xué);2009年

8 李愛生;DSRC邏輯分析儀的設(shè)計及其在ETC系統(tǒng)中的應(yīng)用[D];華中師范大學(xué);2011年

9 王永生;ETC系統(tǒng)中DSRC協(xié)議的分析與實現(xiàn)[D];西安電子科技大學(xué);2011年

10 盧瑞紅;交通專用短程通信協(xié)議DSRC的仿真和驗證研究[D];北京郵電大學(xué);2006年

，

本文編號：2488975