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GPU集群加速近似逆預(yù)條件CG并行求解器

發(fā)布時間:2018-12-18 20:27
【摘要】:針對GPU集群系統(tǒng),研究了分解近似逆(approximate inverse,AINV)和對稱逐次超松弛-近似逆(symmetric successive over relaxation approximate inverse,SSOR-AI)兩類近似逆預(yù)條件的并行算法。采用多級k-路圖劃分方法,通過子圖的內(nèi)點和邊界點識別方法以及稀疏矩陣的置換技術(shù),提出了將稀疏矩陣轉(zhuǎn)換為分塊箭形矩陣的并行方法。基于所形成的分塊箭形矩陣,結(jié)合塊內(nèi)稀疏矩陣近似逆串行、塊間并行的策略給出了近似逆預(yù)條件的并行方法,實現(xiàn)了AINV和SSOR-AI并行算法,解決了AINV預(yù)條件難以并行的問題;贑PU與GPU協(xié)同計算、主機端頁鎖定內(nèi)存和設(shè)備端計算與通信重疊的優(yōu)化技術(shù),實現(xiàn)了并行近似逆預(yù)條件與共軛梯度(conjugate gradient,CG)算法相結(jié)合的線性方程組混合并行求解器。數(shù)值實驗表明,所提方法對AINV和SSOR-AI兩類近似逆預(yù)條件,在多GPU上獲得了很好的可擴展性和加速效果。
[Abstract]:For GPU cluster systems, parallel algorithms for decomposing approximate inverse (approximate inverse,AINV) and symmetric successive overrelaxation approximate inverse (symmetric successive over relaxation approximate inverse,SSOR-AI (symmetric successive over relaxation approximate inverse,SSOR-AI) are studied. A parallel method of converting sparse matrix into block quiver matrix is proposed by using the method of multi-level k-path graph partition, the method of identifying interior and boundary points of subgraph and the technique of replacing sparse matrix. Based on the block quiver matrix, the parallel method of approximate inverse precondition is given by combining the strategy of approximate inverse serial and inter-block parallelism of sparse matrix in block. The parallel algorithm of AINV and SSOR-AI is realized, and the problem that AINV precondition is difficult to parallel is solved. Based on the cooperative computation of CPU and GPU, the optimization technique of memory locking on the host side and the overlap of computing and communication on the device side, a hybrid parallel solver for linear equations is implemented, which combines the parallel approximate inverse precondition with the conjugate gradient (conjugate gradient,CG) algorithm. Numerical experiments show that the proposed method can achieve good scalability and acceleration on multiple GPU for two kinds of approximate inverse preconditioners: AINV and SSOR-AI.
【作者單位】: 中國科學(xué)院計算機網(wǎng)絡(luò)信息中心;中國科學(xué)院大學(xué);
【基金】:國家重點基礎(chǔ)研究發(fā)展計劃(973計劃)No.2011CB309702 數(shù)學(xué)工程與先進計算國家重點實驗室開放基金No.2014A03~~
【分類號】:TP338.6

【共引文獻】

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本文編號:2386454

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