本文選題：分子動力學 + 集群　； 參考：《微電子學與計算機》2014年10期

【摘要】：面對分子動力學模擬在串行計算上的速度瓶頸問題,設計一種并行計算模型來加快計算速度,在分子動力學模擬軟件LAMMPS下引入MPI+OpenMP并行模型,這個模型可以在LAMMPS下提供兩級并行處理,充分利用集群優(yōu)勢,提高模擬計算速度.實驗結果表明,在十節(jié)點下,采用并行模型加速比至少提高8倍以上.
[Abstract]:In view of the speed bottleneck of molecular dynamics simulation in serial computing, a parallel computing model is designed to speed up the computation. MPI OpenMP parallel model is introduced into the molecular dynamics simulation software LAMMPS. This model can provide two-stage parallel processing under LAMMPS, make full use of the advantage of cluster, and improve the speed of simulation. The experimental results show that the speedup of the parallel model is increased by at least 8 times under the ten nodes.
【作者單位】： 重慶郵電大學計算機科學與技術學院;
【分類號】：TP338.6

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本文編號：1864382