本文選題：酶催化 + 底物輸運(yùn)��； 參考：《物理化學(xué)學(xué)報(bào)》2017年04期

【摘要】：酶催化包括底物到活性區(qū)的輸運(yùn)、選擇催化化學(xué)反應(yīng)及產(chǎn)物釋放等復(fù)雜過程,由于復(fù)雜的蛋白質(zhì)環(huán)境效應(yīng),任一化學(xué)和非化學(xué)過程都有可能是決定酶活性的關(guān)鍵步驟。為了全面認(rèn)識(shí)酶催化活性,我們對(duì)幾類酶催化過程進(jìn)行了廣泛的組合量子/分子力學(xué)(QM/MM)和經(jīng)典分子力學(xué)(MM)動(dòng)力學(xué)模擬(MD)研究,詳細(xì)地討論了整個(gè)酶催化過程的分子機(jī)制、關(guān)鍵殘基的作用和蛋白質(zhì)環(huán)境效應(yīng),豐富了對(duì)酶催化活性的認(rèn)識(shí)。隨著多尺度模型和計(jì)算模擬方法的進(jìn)一步完善與發(fā)展,有望實(shí)現(xiàn)超大復(fù)雜生物酶催化過程的全程模擬研究,為酶工程領(lǐng)域的相關(guān)研究提供支持。
[Abstract]:Enzyme catalysis includes the transport of substrate to active region, the selection of catalytic chemical reaction and the release of products. Due to the complex environmental effects of protein, any chemical or non-chemical process may be the key step to determine the enzyme activity. In order to fully understand the catalytic activity of enzyme, several kinds of enzymatic catalytic processes have been extensively studied by combinatorial quantum / molecular mechanics (QM / MMM) and classical molecular mechanics (MMM) kinetics simulation (MDM), and the molecular mechanism of the whole enzymatic catalytic process has been discussed in detail. The role of key residues and environmental effects of proteins enrich the understanding of enzyme catalytic activity. With the further improvement and development of multi-scale models and computational simulation methods, it is expected to realize the full-process simulation of ultra-complex enzyme catalytic process, and provide support for the related research in the field of enzyme engineering.
【作者單位】： 河南大學(xué)天然藥物與免疫工程重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;廈門大學(xué)化學(xué)化工學(xué)院福建省理論與計(jì)算化學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】：國家自然科學(xué)基金(21133007,21373164,21172053)資助項(xiàng)目~~
【分類號(hào)】：Q55;TQ033

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本文編號(hào)：1978214