有害藻華的宏條形碼分析:機(jī)會(huì)與挑戰(zhàn)
發(fā)布時(shí)間:2021-03-13 04:05
宏條形碼分析(metabarcoding analysis)是通過對(duì)野外樣本的分子標(biāo)記(即條形碼)進(jìn)行PCR擴(kuò)增、測序,并利用測序結(jié)果分析野外樣本物種組成、物種相對(duì)豐度,及其時(shí)空動(dòng)態(tài)變化。這項(xiàng)在近20年里逐步發(fā)展起來的分子技術(shù),得益于DNA測序技術(shù)的快速發(fā)展,包括測序通量的提升和測序成本的降低以及生物信息學(xué)分析方法的快速開發(fā);诳刹僮鞣诸悊卧╫perational taxonomic units,OTUs)分析方法,特別是最近的擴(kuò)增子序列變異(amplicon sequence variants,ASVs)方法的開發(fā),極大促進(jìn)了宏條形碼分析的應(yīng)用。在世界及我國的海洋生態(tài)領(lǐng)域,宏條形碼分析的應(yīng)用還處于起步階段。隨著分析方法的日趨成熟,可適用于不同應(yīng)用領(lǐng)域的分子標(biāo)記不斷增加,以及參考數(shù)據(jù)庫的不斷完善,宏條形碼分析將釋放出廣闊的應(yīng)用潛力。可以預(yù)期,宏條形碼分析將在系統(tǒng)分析我國近岸海域有害藻華物種(及其他浮游生物物種)的組成和相對(duì)豐度中起關(guān)鍵作用,通過發(fā)現(xiàn)新物種,辨別隱存種,跟蹤物種的生物地理學(xué),進(jìn)而幫助解析有害藻華暴發(fā)機(jī)理。
【文章來源】:海洋科學(xué). 2020,44(07)北大核心
【文章頁數(shù)】:19 頁
【部分圖文】:
Tara Oceans項(xiàng)目-浮游植物與其他浮游生物的豐富度分布格局[15]
宏條形碼分析的里程碑事件
基于ASV的分析在逐步取代基于OTU的分析[50]
本文編號(hào):3079542
【文章來源】:海洋科學(xué). 2020,44(07)北大核心
【文章頁數(shù)】:19 頁
【部分圖文】:
Tara Oceans項(xiàng)目-浮游植物與其他浮游生物的豐富度分布格局[15]
宏條形碼分析的里程碑事件
基于ASV的分析在逐步取代基于OTU的分析[50]
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