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中國南海樣品可培養(yǎng)細(xì)菌多樣性分析及兩株深海細(xì)菌的多相分類研究

發(fā)布時間:2019-10-08 16:25
【摘要】:中國南海是中國的一個邊緣海。它從馬來西亞南海峽延伸到臺灣海峽東北部,占地面積大約350萬平方公里。中國南海有著大量的生物多樣性,包括超過30%世界珊瑚礁,許多寶貴的魚類和數(shù)量龐大的微生物類群。中國南海地區(qū)蘊(yùn)含著豐富的微生物資源,由于其特殊的地理位置和氣候環(huán)境,這些微生物進(jìn)化出獨(dú)特的生理、代謝特征和生態(tài)功能,具有重要的研究價值和廣闊的應(yīng)用前景。本文以采自中國南海的多種樣品進(jìn)行了微生物多樣性分析,對“東方紅2號”南海基金DFH11航次站點(diǎn)表層海水和海底沉積物樣品中的微生物進(jìn)行了群落分布分析及優(yōu)勢菌群的研究,并以分離出的其中兩株深海細(xì)菌為研究對象,利用多相分類學(xué)方法研究分析了兩株菌的細(xì)胞形態(tài),生長限制因子,生理生化性質(zhì),分子遺傳學(xué)特征,細(xì)胞脂肪酸分析,主要極性脂組分等的多方面的特征,最終確立了兩株細(xì)菌的分類地位。 1.中國南海樣品可培養(yǎng)細(xì)菌的多樣性分析 本文所分析的樣品為“東方紅2號”南;餌FH11航次獲取的海底沉積物、沙礫和用濾膜過濾取得的表層海水樣品共12個樣品,結(jié)果顯示,在表層海水樣品中可培養(yǎng)的微生物菌群主要由γ 變形菌(Pseudoalteromonas、Vibrio、Alteromonas、Psychrobacter),α 變形菌(Sphingorhabdus),硬壁菌(Bacillus),放線菌(Kouria、Rhodococcus),擬桿菌(Maribacter、Cellulophage、Flavobacterium、Olleya)組成。海水沉積物樣品中可培養(yǎng)的微生物菌群主要由γ 變形菌(Enterobacteria、Vibrionaceae、 Alteromonas、 Psychrobacter),微球菌(Microcobacteria),硬壁菌(Bacillus),黃桿菌(Flavobacteriaceae),γ 變形菌(Pseudoalteromonas、Psychrobacter、Oceanospirillaceae、Planococcaseae)組成。 2.菌株SM1222T的多相分類學(xué)研究 菌株SM1222T分離于中國南海42號站位2022m沉積物樣品。菌株SM1222T菌落顏色為灰黃色,邊緣光滑呈凸起狀,革蘭氏染色反應(yīng)為陰性,細(xì)胞呈棒狀,有鞭毛。其生長溫度范圍為4 35°C,最適生長溫度為25 30°C;生長鹽度范圍為0.5 8%NaCl(w/v),最適鹽度為2.0 3.0%NaCl;生長的pH范圍為5.5 10.5,最適生長的pH值為7.5 8。菌株SM1222T能夠還原硝酸鹽為亞硝酸鹽,其細(xì)胞的觸酶和氧化酶反應(yīng)為陽性。該菌株能夠降解利用尿素、檸檬酸鹽和丙酮酸鹽,不能降解利用瓊脂、DNA、 明膠、淀粉、Tween40、Tween60、Tween80和七葉苷。 菌株SM1222T的主要脂肪酸為:summed feature3(C16:1ω7c and/or iso-C15:02-OH),C16:0,C18:1ω7c,summed feature2(C14:03-OH and/or iso-C16:1I) and C12:0。該菌株的主要呼吸醌為Q 8,主要的極性脂類為:磷脂酰乙醇胺(phosphatidylethanolamine,PE),磷脂酰甘油(phosphatidylglycerol,PG)和雙磷脂酰甘油(diphosphatidylglycerol,DPG)。菌株SM1222T的基因組DNA的G+C含量為51.5mol%。 遺傳學(xué)分析,16S rRNA基因序列分析表明菌株SM1222T與Oceanisphaera ostreaeKCTC23422T具有最高的序列相似性(96.8%),基于16S rRNA基因序列的遺傳學(xué)進(jìn)化分析構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹,菌株SM1222T與Oceanisphaera屬聚集成簇,并處于Oceanisphaera屬進(jìn)化分支內(nèi)。 基于以上多相分類學(xué)數(shù)據(jù),,菌株SM1222T屬于Oceanisphaera屬的一個新種,命名為Oceanisphaera profundasp.nov.,菌株SM1222T(=CCTCC AB2013241T=KCTC32510T)為該新種的模式菌株。 3.菌株SM1341T的多相分類研究 菌株SM1341T分離于中國南海103號站位4300m沉積物樣品。菌株SM1341T菌落顏色為白色,需氧的,革蘭氏染色反應(yīng)為陰性,細(xì)胞呈棒狀,沒有鞭毛。其生長溫度范圍為15 40°C,最適生長溫度為35°C;生長鹽度范圍為0 6%NaCl (w/v),最適鹽度為3.0%NaCl;生長的pH范圍為5.0 10.0,最適生長的pH值為7.0。菌株SM1341T能夠還原硝酸鹽為亞硝酸鹽,其細(xì)胞的觸酶和氧化酶反應(yīng)為陽性。該菌株能夠降解利用酪蛋白、淀粉、Tween20、Tween40、Tween80、明膠,不能降解利用瓊脂、DNA、Tween60和七葉苷。 菌株SM1341T的主要脂肪酸為C16:0、summed feature2(C14:03-OH and/or iso-C16:1I)、C18:1ω7c、cyclo-C19:0ω7c和C18:1ω7c11-methyl。該菌株的主要呼吸醌為Q 10,主要的極性脂類為:磷脂酰膽堿(phosphatidylcholine,PC)、磷脂酰甘油(phosphatidylglycerol,PG)、雙磷脂酰甘油(diphosphatidylglycerol,DPG)和兩種含氨基的脂類(two aminolipids,AL1-AL2)。 菌株SM1341T的16SrRNA基因序列與Oceanicella actignis DSM22673T(94.37%)和Pleomorphobacterium xiamenense CLWT(94.31%)具有最高的序列相似性。菌株SM1341T的基因組DNA的G+C含量為68.8mol%。 基于以上多相分類學(xué)數(shù)據(jù),菌株SM1341T應(yīng)代表Oceanicella屬的一個新種,命名為Oceanicella nanhaiensis sp. nov.,菌株SM1341T(=KCTC32512T=CCTCCAB2013360T)為該新種的模式菌株。 該研究對豐富中國南海細(xì)菌多樣性的認(rèn)識和了解,掌握微生物在整個海洋生態(tài)系統(tǒng)中的地位和作用,并且對開展海洋生態(tài)環(huán)境的研究以及開發(fā)海洋微生物資源具有重要的理論意義和應(yīng)用價值。
【學(xué)位授予單位】:聊城大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類號】:Q178.53

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本文編號:2546375

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