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櫛孔扇貝在鎘污染脅迫下消化盲囊組織的轉(zhuǎn)錄組分析

發(fā)布時(shí)間:2019-01-23 15:15
【摘要】:鎘(Cd)作為生物非必需、毒性極強(qiáng)的蓄積性重金屬,易通過食物鏈進(jìn)入人體,嚴(yán)重威脅人類健康。扇貝相對于其他貝類具有特異性蓄積鎘的能力,成為水產(chǎn)品安全領(lǐng)域關(guān)注的焦點(diǎn)。為了闡釋扇貝高蓄積鎘的分子機(jī)制,本研究以鎘脅迫的櫛孔扇貝(Chlamys farreri)消化盲囊組織為研究對象,通過轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)進(jìn)行基因轉(zhuǎn)錄水平分析。通過比較轉(zhuǎn)錄組拼接獲得105071個(gè)unigene和3800個(gè)差異基因,對所得unigene進(jìn)行功能注釋,發(fā)現(xiàn)這些基因集中在蛋白綁定、細(xì)胞黏附、免疫應(yīng)答、細(xì)胞凋亡和能量代謝等方面。對這些蛋白的分子功能進(jìn)行注釋,發(fā)現(xiàn)該類蛋白主要屬結(jié)合蛋白(40.45%)、催化活性蛋白(34.27%)和轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白(5.62%)。這些功能基因和預(yù)測通路為理解扇貝體內(nèi)解毒和免疫系統(tǒng)奠定了基礎(chǔ)。獲得的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)為深入研究雙殼貝類應(yīng)對海洋污染物的分子機(jī)制提供了豐富的基因資源。
[Abstract]:Cadmium (Cd) (CD (Cd), as a non-essential and highly toxic accumulative heavy metal, is easy to enter the human body through the food chain and is a serious threat to human health. Scallop has the ability to accumulate cadmium specifically compared with other shellfish and has become the focus in aquatic product safety field. In order to elucidate the molecular mechanism of cadmium accumulation in scallop chlamys farreri (Chlamys farreri) digesting blind capsule tissue under cadmium stress was used to analyze the gene transcription level by transcriptional sequencing technique. 105071 unigene and 3800 differentially expressed genes were obtained by comparing transcriptome splicing. The functional annotation of the unigene showed that these genes focused on protein binding, cell adhesion, immune response, apoptosis and energy metabolism. The molecular function of these proteins was elucidated. It was found that these proteins mainly belong to binding protein (40.45%), catalytic active protein (34.27%) and transporter protein (5.62%). These functional genes and predictive pathways lay the foundation for understanding the detoxification and immune system in scallop. The obtained transcriptome data provide abundant genetic resources for further study on the molecular mechanism of bivalve in response to marine pollutants.
【作者單位】: 農(nóng)業(yè)部水產(chǎn)品質(zhì)量安全檢測與評價(jià)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 中國水產(chǎn)科學(xué)研究院黃海水產(chǎn)研究所;農(nóng)業(yè)部水產(chǎn)品質(zhì)量安全風(fēng)險(xiǎn)評估實(shí)驗(yàn)室(青島);
【基金】:國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(41506134)
【分類號】:S917.4;X55

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本文編號:2413936

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