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基于光微流激光的DNA-HRM分析及應(yīng)用

發(fā)布時間:2024-03-31 20:25
  基因是決定生物性狀的根本性因素,基因片段中的DNA通過轉(zhuǎn)錄翻譯等過程從而控制生物性狀的表達,DNA中的堿基序列發(fā)生變異會導致非常嚴重的后果。研究表明許多可遺傳疾病都與DNA序列中的單堿基變異有著直接關(guān)系,因此從DNA層面檢測DNA序列中是否存在堿基變異可以更快、更及時、更準確地檢查出一些疾病。本課題主要以法布里-珀羅(FP)腔為檢測基礎(chǔ),分析研究基于高品質(zhì)因子光微流激光腔的高分辨率熔解曲線(HRM),本文工作中主要分析了三種類型的DNA,分別是:(1)99個堿基對和兩種GC含量的130個堿基對的單堿基破壞型DNA序列:(2)四種單核苷酸多態(tài)性(SNP)變異DNA以及與實際疾病有關(guān)的三種SNP變異DNA;(3)富含G堿基的單鏈DNA。具體如下:1.理論分析并模擬了基于光微流激光的DNA-HRM,分析基于激光的HRM與基于熒光的HRM異同。隨后通過實驗分析研究了99個堿基對以及兩種類型的130個堿基對的DNA序列,實驗結(jié)果表明99個堿基對的DNA序列,完全配對(Target)與其單堿基錯配(Mismatch)DNA之間的裂解溫差為0.9至1℃,而對于130個堿基DNA(Type I)為0....

【文章頁數(shù)】:72 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

圖1-1DNA的雙螺旋結(jié)構(gòu)以及自組裝原理

圖1-1DNA的雙螺旋結(jié)構(gòu)以及自組裝原理

圖1-1DNA的雙螺旋結(jié)構(gòu)以及自組裝原理Fig.1-1DNAdoublehelixstructureandself-assemblyprincip重要的性質(zhì)是DNA分子是雙螺旋結(jié)構(gòu),每個螺旋堿基距離為0.34nm,一個螺旋中含有10個堿基對計依據(jù)。第三....


圖2-1(a)HRM原理圖(b)激光替代了熒光被用作傳感信號

圖2-1(a)HRM原理圖(b)激光替代了熒光被用作傳感信號

U為腔內(nèi)的總能量,ωc為諧振頻率。精細度F表示腔本身的細銳程度:F=(2-4)FSR表示自由光譜的范圍,Dn為半高寬,F(xiàn)越大,諧振波的波峰越尖銳。2.3HRM原理介紹HRM是DNA與染料相結(jié)合時產(chǎn)生的熒光作為傳感信息,因為不同DNA對染....


圖2-2(a-c)展示了計算得到的不同樣品Target和MismatchDNA激光閾值與溫度

圖2-2(a-c)展示了計算得到的不同樣品Target和MismatchDNA激光閾值與溫度

太原理工大學碩士學位論文4基于光微流激光的DNA-HRM的理論計算接下來用上述公式模擬第三章使用的99個堿基對以及130個堿基對的DNA樣品。先計算可得三種樣品DNA的焓熵值如下表所示:表2-2樣品DNA的焓熵值Table2-2enthalpy&....


圖2-2(a-c)理論計算不同樣品的激光閾值Ith與溫度的函數(shù)關(guān)系圖

圖2-2(a-c)理論計算不同樣品的激光閾值Ith與溫度的函數(shù)關(guān)系圖

142-2(a-c)理論計算不同樣品的激光閾值Ith與溫度的函數(shù)關(guān)系圖。(d-f)對應(yīng)的激光輸出與度的關(guān)系。Fig.2-2(ac)Theoreticallycalculatedlaserthreshold,Ith,asafunctionoftemp....



本文編號:3944455

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